腸道菌群是人體生理、免疫系統(tǒng)發(fā)育、消化、發(fā)育和解毒反應的重要場所,對人體健康有著深遠的影響。腸道菌群的結構和組成與多種疾病存在關聯(lián),越來越多研究證實腸道微生物群的失調(diào)與多種腸道疾病存在關聯(lián);不僅如此,最近的研究發(fā)現(xiàn)腸道微生物群與許多自身免疫性疾病,包括自身免疫性肝炎、脊柱炎、多發(fā)性硬化等都與腸道菌群有著千絲萬縷的聯(lián)系。已有研究表明,遺傳因素可以影響腸道菌群的組成。Williams Turpin等,關于宿主基因組與腸道菌群的關聯(lián)研究發(fā)現(xiàn),三分之一的腸道菌群受遺傳因素影響,他們鑒定出58個宿主SNP與33個細菌群豐度相關。Bonder等對荷蘭人群1514個樣本進行研究,鑒定出影響人腸道微生物組的基因座,發(fā)現(xiàn)在MHC位點中,存在部分與腸道微生物組成相關的SNP,例如位于MUC22基因附近的SNP,提示HLA-II類分子可調(diào)控腸道菌群導致其結構和功能的改變。在多種HLA轉基因小鼠模型中,均證實HLA等位與腸道菌群存在關聯(lián),例如有研究表明在HLA-DR3_AIH模型中,腸道微生物群發(fā)生了顯著改變,但在C57BL/6J小鼠中沒有改變,這意味著HLA等位的不同可能導致微生物群組成... 

【文章來源】：西南大學重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：67 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

實驗方案

圖 4-3 序列有效長度分布質(zhì)檢%的相似度對研究樣本進行 OTU 分類，構建稀釋曲線（ sobs（表征實際觀測到的物種數(shù)目），當曲線趨向平坦，更多的數(shù)據(jù)量只會產(chǎn)生少量新的物種（如 OTU）。S趨向平坦時，說明測序數(shù)據(jù)量足夠大，可以反映樣本中信息圖 4-4 稀釋曲線 和 Shannon-Wiener 曲線

圖 4-3 序列有效長度分布. 測序數(shù)據(jù)質(zhì)檢按照 97%的相似度對研究樣本進行 OTU 分類，構建稀釋曲線（圖 4-4）。多性指數(shù)為 sobs（表征實際觀測到的物種數(shù)目），當曲線趨向平坦時，說明測序據(jù)量合理，更多的數(shù)據(jù)量只會產(chǎn)生少量新的物種（如 OTU）。Shannon-Wiene線，曲線趨向平坦時，說明測序數(shù)據(jù)量足夠大，可以反映樣本中絕大多數(shù)的微物多樣性信息


本文編號：2951696