本研究對2001年廣東省急性弛緩性麻痹（Acute flaccid paralysis,AFP）病例中分離到的一株腸道病毒AFP341_GD-CHN₂001株進行了高通量測序后,獲取該全基因組序列,經(jīng)鑒定該毒株為EV-B83。為了解該廣東省首株EV-B83分離株的全基因組特征及其重組特點,本研究對AFP341_GD-CHN₂001毒株通過最大似然法構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,利用bootscanning分析該毒株與其它型別腸道病毒的重組位點,最后根據(jù)該重組位點分區(qū)段構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,進一步驗證重組分析結(jié)果。全長VP1序列構(gòu)建的分子進化樹表明,AFP341_GD-CHN₂001毒株與EV-B83原型株及柬埔寨SEP025_KH₂012分離株形成一簇;初步構(gòu)建P1、P2、P3編碼區(qū)序列系統(tǒng)進化樹,提示該分離株在其分子進化中可能存在基因重組,而bootscanning分析表明非結(jié)構(gòu)蛋白編碼區(qū)是其發(fā)生基因重組的區(qū)域。根據(jù)bootscannin... 

【文章來源】：病毒學(xué)報. 2020年03期 北大核心

【文章頁數(shù)】：10 頁

【部分圖文】：

基于GD341＿2001毒株及GenBank數(shù)據(jù)庫現(xiàn)有EV-B83的VP1編碼區(qū)構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹


本文編號：2936544