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剛地弓形蟲毒力因子ROP18與人細(xì)胞互作蛋白質(zhì)組學(xué)分析及Ⅰ型ROP18結(jié)合人NMI蛋白干擾其功能的機(jī)制研究

發(fā)布時(shí)間:2020-10-27 00:52
   背景:剛地弓形蟲(Toxoplasma gondii)的棒狀體蛋白(rhoptry protein)18(TgROP18)是弓形蟲在入侵宿主細(xì)胞的過(guò)程中分泌到宿主細(xì)胞內(nèi)的一個(gè)關(guān)鍵的毒力因子。TgROP18通常通過(guò)與其靶標(biāo)宿主蛋白發(fā)生相互作用以調(diào)控宿主細(xì)胞的功能,然而,目前的研究只鑒定出了少數(shù)幾個(gè)能與I型蟲株ROP18(TgROP18Ⅰ)結(jié)合的宿主細(xì)胞蛋白,對(duì)于TgROP18Ⅰ與宿主蛋白相互作用的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)仍未闡明;且大多數(shù)的研究都只關(guān)注在TgROP18Ⅰ,對(duì)于II型蟲株ROP18(TgROP18Ⅱ)在人細(xì)胞內(nèi)的靶標(biāo)蛋白及作用機(jī)制更是未知。TgROP18在小鼠體內(nèi)的作用機(jī)制是通過(guò)靶定小鼠的免疫相關(guān)GTPase(immunity-related GTPases,IRGs)使其發(fā)生磷酸化而失活,從而阻止納蟲泡膜的破裂,保護(hù)弓形蟲的寄生環(huán)境。然而在人細(xì)胞中幾乎檢測(cè)不到此IRGs系統(tǒng),因此TgROP18在人細(xì)胞內(nèi)的作用機(jī)制尚不清楚。本研究進(jìn)行了 TgROP18Ⅰ及TgROPl8Ⅱ在人細(xì)胞中的相互作用蛋白質(zhì)組學(xué)分析,并對(duì)TgROP18Ⅰ在人細(xì)胞內(nèi)結(jié)合NMI并干擾NMI功能的作用機(jī)制進(jìn)行探究。方法:運(yùn)用高通量雙分子熒光互補(bǔ)(BiFC)技術(shù)從18,414個(gè)人細(xì)胞蛋白cDNA表達(dá)庫(kù)中篩選出與TgROP18Ⅰ或TgROP18Ⅱ互作的人細(xì)胞蛋白,運(yùn)用熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)及免疫共沉淀(Co-IP)方法對(duì)蛋白互作進(jìn)行驗(yàn)證,并運(yùn)用生物信息學(xué)的方法分析TgROP18Ⅰ或TgROP18Ⅱ在人細(xì)胞中的相互作用蛋白質(zhì)組學(xué)。運(yùn)用Co-IP及免疫熒光(IFA)方法驗(yàn)證TgROP18Ⅰ與人蛋白N-Myc互作因子(N-Myc and STAT interactor,NMI)在弓形蟲感染的情況下的相互作用。運(yùn)用基因定點(diǎn)突變技術(shù)構(gòu)建轉(zhuǎn)基因弓形蟲株,鑒定TgROP18Ⅰ與NMI互作的必需氨基酸位點(diǎn)。通過(guò)對(duì)比在TgROP18Ⅰ存在或不存在的條件下,NMI在總的細(xì)胞中、細(xì)胞質(zhì)組分中、細(xì)胞核組分中、及染色質(zhì)GAS區(qū)域中蛋白水平的差異,評(píng)價(jià)TgROP18Ⅰ對(duì)NMI蛋白水平及NNMI核轉(zhuǎn)移的影響。通過(guò)蟲株增殖能力評(píng)價(jià)實(shí)驗(yàn)確定TgROP18Ⅰ對(duì)蟲株IFN-y抵抗力的影響。結(jié)果:本研究從18,414個(gè)人蛋白cDNA表達(dá)庫(kù)中,共鑒定出了492個(gè)與TgROP18Ⅰ相互作用的蛋白及141個(gè)與TgOP18Ⅱ相互作用的蛋白。生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示大部分的TgROP18Ⅰ 及TgROP18Ⅱ相互作用蛋白與宿主的免疫反應(yīng)及細(xì)胞凋亡相關(guān)。其中NMI、IL20RB、IL21、及UBC通過(guò)FRET及Co-IP實(shí)驗(yàn)被證實(shí)為TgROP18Ⅰ的靶標(biāo)蛋白。在感染CEP+TgROP18Ⅰ蟲株的細(xì)胞中,NMI可特異地被TgROP18Ⅰ靶定而聚集在納蟲泡膜上。TgROP18Ⅰ的激酶活性及激酶結(jié)構(gòu)域中的第439位精氨酸為TgROP18Ⅰ與NMI互作所必需,去除TgROP18Ⅰ的激酶活性或?qū)gROP18Ⅰ的第439位精氨酸突變?yōu)楦彼釋⑵茐腡gROP18Ⅰ與NMI的結(jié)合。TgROP18Ⅰ可降低細(xì)胞中NMI的蛋白水平,并影響NMI向細(xì)胞核轉(zhuǎn)移及結(jié)合至GAS區(qū)域上。結(jié)論:在人細(xì)胞中,TgROP18通過(guò)與宿主蛋白互作,發(fā)揮調(diào)控宿主細(xì)胞的功能,尤其是與宿主免疫及細(xì)胞凋亡相關(guān)的蛋白網(wǎng)絡(luò)互作,有利于弓形蟲實(shí)現(xiàn)免疫逃避,促進(jìn)其胞內(nèi)寄生。弓形蟲在感染過(guò)程中,TgROP18Ⅰ通過(guò)其激酶活性及激酶結(jié)構(gòu)中的關(guān)鍵位點(diǎn)Arg-439結(jié)合NMI,并抑制NMI向細(xì)胞核轉(zhuǎn)移及與GAS區(qū)域的結(jié)合,顯著干擾NMI蛋白的定位及功能。
【學(xué)位單位】:南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:R382.5
【部分圖文】:

信號(hào)通路,信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),互作用,富集


(39.0%)?are?enriched?in?a?PPI?network?with?44?edges.??此外,我們還運(yùn)用IPA數(shù)據(jù)庫(kù),對(duì)7^ROP18I&rgROP18n相互作用蛋白相??關(guān)的人細(xì)胞信號(hào)通路進(jìn)行了分析(圖1-7)。在492個(gè)rgROP18i相互作用蛋白中,??71個(gè)(占所有rgROP18#互作用蛋白的14.4%)相互作用蛋白富集在34個(gè)不??同的信號(hào)通路上;而在141個(gè)rgROPWH相互作用蛋白中,13個(gè)(占所有??rgROPWiJg互作用蛋白的9.2%)相互作用蛋白富集在16個(gè)不同的信號(hào)通路上。??TgROP18i相互作用蛋白前5位被富集的信號(hào)通路分別是:eukaryotic?initiation??factor2?信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)(EIF2signaling)?(p=1.2><10-4);?JAK1?及?JAK3?在?yc?細(xì)胞因子??信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中的作用(roleofJAKlandJAKJinyccytokinesignaling)?(p=1.04xl〇_??3);粒細(xì)胞的黏附及滲出(granulocyte?adhesion?and?diapedesis)?(p=5.01><10-3);??Tubby?介導(dǎo)的?G?蛋白信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)(Gprotein?signaling?mediated?by?Tubby?)(p=5.37xl〇-??3)

激酶結(jié)構(gòu)域


??發(fā)生相互作用(圖2-2B)。于是我們開始探索位于rgR0P18i的vacuole-targeting??domain內(nèi)的全部6個(gè)rgROPlA特有的氨基酸殘基對(duì)于其與NMI結(jié)合的重要性。??我們運(yùn)用?Gibson?Assembly?的方法[丨07],將?TgR0P18丨與?rgR0P18n?的?vacuole???targeting?domain?和激酶結(jié)構(gòu)域進(jìn)行了互換,構(gòu)建了兩株轉(zhuǎn)基因蟲株?—??CEP+:TgROP18-domainswap?l(CEP+rgROP18-DSl,;TgR0P18ii的N端+rgR0P18i??的激酶結(jié)構(gòu)域)和?CEP+rgROP18-domainswap2(CEP+7^ROP18-DS2,?:TgR0P18i??的N端+TgR0P18n的激酶結(jié)構(gòu)域)。免疫熒光的結(jié)果顯示,ROP18-DS1突變體??仍然可與NMI結(jié)合,而ROP18-DS2突變體卻不能與NMI結(jié)合,說(shuō)明位于??7^0?181激酶結(jié)構(gòu)域的多態(tài)性位點(diǎn)才是TgR0P18A?NMI結(jié)合這個(gè)表型所必需??的(圖?2-2C)。??114??

蛋白,蛋白酶體,抑制效應(yīng),表達(dá)質(zhì)粒


??達(dá)量的增加而減少,呈現(xiàn)明顯的劑量反應(yīng)關(guān)系(圖2-6C)。此外,我們還發(fā)現(xiàn),??即使轉(zhuǎn)染等量(2pg)的pEYFP-NMI表達(dá)質(zhì)粒,在梯度轉(zhuǎn)染了不同量(0,?0.5,??1,或2呢)的pECFP-rgROPlh表達(dá)質(zhì)粒的情況下,NMI的蛋白水平仍會(huì)隨著??rgROP^表達(dá)量的增加而減少(圖2-6D)-為了確定7^1?疋181對(duì)NMI蛋白的??抑制效應(yīng)是否是由于T^ROPl^引起NMI蛋白的降解導(dǎo)致的,我們使用了蛋白??酶體抑制劑MG132來(lái)處理細(xì)胞(圖2-6E)。結(jié)果顯示在蛋白酶體被抑制的情況??下,7^110?181對(duì)_1的蛋白的抑制能力并沒(méi)有明顯改變,說(shuō)明此抑制效應(yīng)是不??依賴于蛋白酶體的(圖2_6E)。綜上,這些數(shù)據(jù)說(shuō)明GROPIA降低細(xì)胞中NMI??的蛋白水平,而對(duì)NMI的基因轉(zhuǎn)錄沒(méi)有影響。??122??
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