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內(nèi)共生菌Wolbachia對白紋伊蚊線粒體DNA多樣性的影響

發(fā)布時間:2020-10-22 17:20
   目的調(diào)查揚州6個地區(qū)白紋伊蚊感染W(wǎng)olbachia的規(guī)律,分析揚州6個地區(qū)的白紋伊蚊線粒體DNA COI基因遺傳多樣性,初步探究內(nèi)共生菌Wolbachia對白紋伊蚊線粒體DNACOI基因多樣性的影響,為將來基于Wolbachia特性對蚊媒及蚊媒病的控制奠定基礎(chǔ)。方法1.2017年7月-10月,采集揚州6個地區(qū)的白紋伊蚊,提取單只蚊蟲的DNA,利用Wolbachia wsp基因的通用型和分型引物分別進行PCR擴增,統(tǒng)計陽性樣本的數(shù)量,分析其感染規(guī)律。2.利用線粒體DNA COI基因特異性引物對蚊蟲DNA樣本進行PCR反應(yīng),PCR產(chǎn)物經(jīng)測序儀測序后,通過DnaSP5.1軟件分析COI基因的遺傳多樣性。3.利用生物信息學(xué)分析方法,對感染W(wǎng)olbachia和不感染W(wǎng)olbachia的白紋伊蚊種群的線粒體DNA多樣性進行分析比較。結(jié)果利用Wolbachia wsp基因的通用型引物進行PCR擴增的結(jié)果顯示,揚州市6個不同地區(qū)的白紋伊蚊種群的感染頻率在27.5%~67.5%之間;利用A大組和B大組的特異性引物的檢測結(jié)果為:只感染A組的頻率為0~22.5%,只感染B組的頻率為5%~17.5%,共同感染A和B的頻率為0~35%。對白紋伊蚊COI基因進行PCR擴增,測序所獲得的序列用MEGA6.0分析的結(jié)果為:A+T含量為67.93%,C+G含量為32.07%,核苷酸多樣性(Pi)為0.28190,單倍型多樣性(Hd)為0.933。基于COI基因序列構(gòu)建的進化樹表明,邗江區(qū)、江都區(qū)采樣點的白紋伊蚊聚成一小分支后又與廣陵區(qū)和儀征區(qū)聚成一類,高郵市與寶應(yīng)縣采集點的白紋伊蚊單獨聚為一支,該結(jié)果說明揚州不同的白紋伊蚊種群之間存在一定水平的基因交流。除了廣陵區(qū)種群以外,其他5個種群中不感染W(wǎng)olbachia的白紋伊蚊線粒體COI基因的單倍型多樣性數(shù)(Hd)、核苷酸多樣性數(shù)(Pi)和核苷酸平均差異數(shù)(K)均比感染W(wǎng)olbachia的要高。結(jié)論1.揚州市白紋伊蚊種群體內(nèi)感染W(wǎng)olbachia表現(xiàn)出多樣性,有Wolbachia雙重感染現(xiàn)象。2.揚州6個白紋伊蚊種群的線粒體DNA COI基因有一定水平的交流。3.感染W(wǎng)olbachia的白紋伊蚊種群的線粒體DNA COI基因核苷酸多樣性和單倍型多樣性均低于不感染W(wǎng)olbachia的白紋伊蚊種群,Wolbachia對寄主的線粒體DNA的多樣性具有一定的影響。
【學(xué)位單位】:安徽理工大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R384.1
【部分圖文】:

分布圖,白紋伊蚊,種群,分布圖


(6)?lOxPCR?Buffer?(無?Mg2+)?TaKaRa?公司??(7)?MgCb?(25mmol/L)?TaKaRa?公司??(8)?dNTP?Mixture?(2.5?mmol/L)?TaKaRa?公司??(9)?TaqDNA?聚合酶(5U/fxL)?TaKaRa?公司??(10)?DEPC?國產(chǎn)分析純??(11)無水乙醇?美國Sigma公司??.3實驗方法??.3.1白紋伊蚊的采集方法??采集江蘇省揚州市6個地區(qū)的白紋伊蚊,并用GPS定位儀記錄下每個采樣點??坐標,采集時間均為2017年7月-10月,采集地點的分布見圖1。采用人誘法:??晚時分,采樣者著深色衣褲或者直接裸露小腿站在蚊蟲孳生地的周圍,用電動??蚊器吸捕刺叮在小腿上的蚊蟲。將采集的白紋伊蚊保存于無水乙醇中,帶回實??室后保存于-20°C或立即進行DNA的提取。樣品來源及各采集點的信息如表1。??

白紋伊蚊


1.4.2.2?COI基因的PCR擴增結(jié)果??PCR產(chǎn)物用毛細管電泳儀檢測,以lOOObp的Marker作為標記,電泳后可見??所有電泳結(jié)果目的條帶均在680bp左右。圖6為白紋伊蚊COI基因的擴增結(jié)果電??泳圖。??1.4.2.?3白紋伊蚊的分子鑒定結(jié)果??把測序結(jié)果拼接后,與NCBI網(wǎng)站上的GenBank中的白紋伊蚊COI基因序列??進行BLAST,同源性均大于97%。所測結(jié)果表明,所采集的6個地點的蚊蟲全部??都是白紋伊蚊,無其他蚊種,可用來進行后續(xù)的實驗研宄。??-12-??

白紋伊蚊


1.4.2.2?COI基因的PCR擴增結(jié)果??PCR產(chǎn)物用毛細管電泳儀檢測,以lOOObp的Marker作為標記,電泳后可見??所有電泳結(jié)果目的條帶均在680bp左右。圖6為白紋伊蚊COI基因的擴增結(jié)果電??泳圖。??1.4.2.?3白紋伊蚊的分子鑒定結(jié)果??把測序結(jié)果拼接后,與NCBI網(wǎng)站上的GenBank中的白紋伊蚊COI基因序列??進行BLAST,同源性均大于97%。所測結(jié)果表明,所采集的6個地點的蚊蟲全部??都是白紋伊蚊,無其他蚊種,可用來進行后續(xù)的實驗研宄。??-12-??
【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

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相關(guān)碩士學(xué)位論文 前2條

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本文編號:2851883

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