多房棘球絳蟲HSP20蛋白的生物信息學(xué)分析、重組表達(dá)及泡球蚴的體外培養(yǎng)
發(fā)布時(shí)間:2017-03-25 05:01
本文關(guān)鍵詞:多房棘球絳蟲HSP20蛋白的生物信息學(xué)分析、重組表達(dá)及泡球蚴的體外培養(yǎng),由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的:利用生物信息學(xué)方法對(duì)多房棘球絳蟲熱休克蛋白20(EmHSP20)的結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行預(yù)測(cè)分析,并在大腸桿菌原核表達(dá)系統(tǒng)中表達(dá)EmHSP20重組蛋白。方法:利用多種生物信息學(xué)軟件對(duì)EmHSP20的結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行預(yù)測(cè)分析。將多房棘球絳蟲HSP20編碼序列整合到pET-28b(+)載體質(zhì)粒上,然后轉(zhuǎn)化入DH5a菌株,雙酶切和測(cè)序鑒定重組質(zhì)粒,然后將其轉(zhuǎn)化入Rosetta(DE3)表達(dá)菌株,經(jīng)誘導(dǎo)表達(dá)后用鎳柱純化,Western Blot鑒定重組蛋白并進(jìn)行純度分析和濃度測(cè)定。結(jié)果:EmHSP20基因全長(zhǎng)1261bp,編碼序列長(zhǎng)945bp,編碼314個(gè)氨基酸,理論相對(duì)分子質(zhì)量為35843.7Da,等電點(diǎn)為5.92。EmHSP20無(wú)信號(hào)肽,無(wú)跨膜區(qū),屬胞內(nèi)蛋白。EmHSP20含有典型的兩個(gè)α-晶體結(jié)構(gòu)域;富含4種類型的蛋白質(zhì)功能位點(diǎn),主要是磷酸化位點(diǎn),說明磷酸化是其重要的翻譯后修飾;含有8個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn),可與多種蛋白質(zhì)相結(jié)合。成功構(gòu)建了EmHSP20重組質(zhì)粒及原核表達(dá)體系,經(jīng)Western Blot鑒定所得蛋白確為HSP20, SDS-PAGE分析顯示蛋白純度較高,測(cè)定濃度為1.1mg/mL。結(jié)論:通過生物信息學(xué)方法獲得了EmHSP20的基本信息,成功構(gòu)建了EmHSP20重組子,并利用大腸桿菌原核表達(dá)系統(tǒng)高效表達(dá)了EmHSP20,為進(jìn)一步研究其免疫保護(hù)力及生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。目的:用不同血清和培養(yǎng)基體外培養(yǎng)泡球蚴,以尋找更適合泡球蚴生長(zhǎng)的體外培養(yǎng)條件。方法:分別采用DMEM、RPMI1640培養(yǎng)基和脂牛血清、小鼠血清、馬血清不同條件體外培養(yǎng)泡球蚴,記錄其生長(zhǎng)情況并觀察囊泡形態(tài)和超微結(jié)構(gòu),尋找更適合泡球蚴生長(zhǎng)的體外培養(yǎng)條件。結(jié)果:經(jīng)不同條件體外培養(yǎng)泡球蚴,發(fā)現(xiàn)DMEM-小鼠血清的培養(yǎng)條件下泡球蜘生長(zhǎng)速度最快,囊泡數(shù)達(dá)34個(gè),DMEM-胎牛血清培養(yǎng)條件下囊泡數(shù)為26個(gè),RPMI1640-小鼠血清13個(gè),RPMI1640-胎牛血清9個(gè),而DMEM-馬血清和RPMI1640-馬血清的條件下無(wú)囊泡生長(zhǎng)。小鼠血清培養(yǎng)的裹泡體積整體較胎牛血清培養(yǎng)的竇泡體積偏小。透射電鏡觀察四種囊泡超微結(jié)構(gòu)無(wú)差異。結(jié)論:體外培養(yǎng)結(jié)果顯示,小鼠血清比常規(guī)使用的胎牛血清、馬血清更適合泡球蚴生長(zhǎng),DMEM比RPMI1640更造合泡球蚴生長(zhǎng)。
【關(guān)鍵詞】:多房棘球絳蟲 熱休克蛋白20 生物信息學(xué) 泡球蚴 體外培養(yǎng)
【學(xué)位授予單位】:蘭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R383.3
【目錄】:
- 第一部分 多房棘球絳蟲HSP20蛋白的生物信息學(xué)分析與重組表達(dá)6-50
- 中文摘要6-7
- Abstract7-9
- 引言9-12
- 第一章 多房棘球絳蟲HSP20蛋白的生物信息學(xué)分析12-28
- 1.1 材料12
- 1.2 方法12
- 1.2.1 尋找EmHSP20的開放閱讀框12
- 1.2.2 EmHSP20氨基酸序列的生物信息學(xué)分析12
- 1.3 結(jié)果12-28
- 1.3.1 EmHSP20的開放閱讀框及編碼氨基酸12-13
- 1.3.2 EmHSP20氨基酸序列的blastp分析13-14
- 1.3.3 EmHSP20蛋白的理化性質(zhì)及疏水性分析14-16
- 1.3.4 EmHSP20的跨膜區(qū)預(yù)測(cè)16
- 1.3.5 EmHSP20的信號(hào)肽及亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)16-17
- 1.3.6 EmHSP20 B細(xì)胞線性表位的預(yù)測(cè)17-18
- 1.3.7 EmHSP20的二級(jí)結(jié)構(gòu)分析18-23
- 1.3.8 EmHSP20的保守結(jié)構(gòu)域分析23
- 1.3.9 EmHSP20的三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)23-24
- 1.3.10 EmHSP20同源性分析及分子進(jìn)化樹的構(gòu)建24-28
- 第二章 多房棘球絳蟲HSP20蛋白的重組表達(dá)28-44
- 2.1 材料28-32
- 2.1.1 質(zhì)粒和菌株28
- 2.1.2 主要試劑28
- 2.1.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器和設(shè)備28-29
- 2.1.4 主要溶液的配制29-32
- 2.2 方法32-37
- 2.2.1 重組質(zhì)粒的構(gòu)建32-34
- 2.2.2 重組蛋白的原核表達(dá)34-36
- 2.2.3 重組蛋白的純化36
- 2.2.4 純化后蛋白的分析36-37
- 2.3 結(jié)果37-44
- 2.3.1 EmHSP20-pET-28b(+)重組質(zhì)粒的雙酶切鑒定37-38
- 2.3.2 重組質(zhì)粒插入片段的測(cè)序鑒定38-40
- 2.3.3 EmHSP20重組蛋白在Rosetta(DE3)中的表達(dá)及定位40-41
- 2.3.4 梯度洗脫液的SDS-PAGE分析41-42
- 2.3.5 重組蛋白的Western Blot分析42
- 2.3.6 重組蛋白的SDS-PAGE純度分析42-43
- 2.3.7 重組蛋白的濃度測(cè)定43-44
- 討論44-49
- 結(jié)論49-50
- 第二部分 泡球蚴的體外培養(yǎng)50-65
- 中文摘要50-51
- Abstract51-52
- 引言52-54
- 材料與方法54-59
- 1.1 材料54-56
- 1.1.1 泡球蚴54
- 1.1.2 人肝癌細(xì)胞株HepG254
- 1.1.3 主要試劑54
- 1.1.4 主要實(shí)驗(yàn)儀器和設(shè)備54-55
- 1.1.5 主要溶液的配制55-56
- 1.2 方法56-59
- 1.2.1 肝癌細(xì)胞HepG2的培養(yǎng)56-57
- 1.2.2 泡球蚴的體外培養(yǎng)57-59
- 結(jié)果59-63
- 2.1 泡球蚴生長(zhǎng)曲線59-60
- 2.2 光學(xué)顯微鏡下的囊泡形態(tài)60-62
- 2.3 囊泡超微結(jié)構(gòu)的觀察62-63
- 討論63-64
- 結(jié)論64-65
- 參考文獻(xiàn)65-69
- 在學(xué)期間的研究成果69-70
- 致謝70-71
- 英文縮略語(yǔ)表71-72
【共引文獻(xiàn)】
中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條
1 曾紅春;大鼠肝泡狀棘球蚴多模態(tài)影像學(xué)的動(dòng)態(tài)觀察與分析[D];新疆醫(yī)科大學(xué);2013年
本文關(guān)鍵詞:多房棘球絳蟲HSP20蛋白的生物信息學(xué)分析、重組表達(dá)及泡球蚴的體外培養(yǎng),,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):266666
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