【摘要】：目的分析人非經(jīng)典前折疊素RPB5相互作用因子1(URI1)蛋白的特性、結(jié)構(gòu)和變異體,觀察URI1蛋白在人組織中的表達(dá)。方法通過多種網(wǎng)絡(luò)分析工具,預(yù)測和分析URI1的基本特性及結(jié)構(gòu)。用人組織微陣列免疫組化染色方法檢測其在多種組織/細(xì)胞中的表達(dá)。結(jié)果 URI1編碼1個(gè)535個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì),該蛋白質(zhì)性質(zhì)不穩(wěn)定,無跨膜片段,N末端無信號肽,非分泌型蛋白質(zhì),其mRNA在組織中廣泛表達(dá)。URI1具有11個(gè)潛在的泛素化位點(diǎn),其中6個(gè)為高度可信,5個(gè)為中度可信。有48個(gè)潛在的磷酸化位點(diǎn)(35個(gè)在絲氨酸位、11個(gè)在蘇氨酸位、2個(gè)在酪氨酸位)。在第287氨基酸位有一糖基化位點(diǎn),在第291、371氨基酸位也可能發(fā)生糖基化修飾,未發(fā)現(xiàn)乙酰化位點(diǎn)。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測α螺旋(H)占39.63%,N端具有1個(gè)PFD功能域。URI1在多種組織/細(xì)胞廣泛表達(dá)并存在明顯差異表達(dá),與基于高密度微陣列技術(shù)的BioGPS mRNA表達(dá)譜數(shù)據(jù)吻合。結(jié)論用生物信息學(xué)技術(shù)預(yù)測了URI1蛋白的結(jié)構(gòu)和功能,為URI1蛋白的相關(guān)研究提供了信息。
[Abstract]:Objective to analyze the characteristics, structures and variants of human non-classical RPB5 interaction factor 1 (URI1) protein and to observe the expression of URI1 protein in human tissues. Methods the basic characteristics and structure of URI1 were predicted and analyzed by a variety of network analysis tools. Human microarray immunohistochemical staining was used to detect its expression in various tissues / cells. Results URI1 encodes a 535 amino acid protein with unstable properties, no transmembrane fragment, no signal peptide at the N-terminal, non-secretory protein, and its mRNA is widely expressed in tissues. URI1 has 11 potential ubiquitin sites. Among them, 6 were highly credible and 5 were moderately credible. There were 48 potential phosphorylation sites (35 at serine site, 11 at threonine site and 2 at tyrosine site). There was a glycosylation site at the 287th amino acid site and a glycosylation modification at the 291371 amino acid site. No acetylation site was found. The protein structure predicted that 偽 -helix (H) had a PFD functional domain at the N-terminal of 39.63 cells. URI1 was widely expressed in various tissues / cells and was significantly differentially expressed, which coincided with the data of BioGPS mRNA expression profile based on high-density microarray technique. Conclusion the structure and function of URI1 protein were predicted by bioinformatics, which provided information for the study of URI1 protein.
【作者單位】： 江蘇大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與醫(yī)學(xué)技術(shù)學(xué)院血液學(xué)與血液學(xué)檢驗(yàn)系;Rush大學(xué)醫(yī)學(xué)中心解剖和細(xì)胞生物學(xué)系;
【分類號】：R341

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號：2399428