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應用骨髓庫HLA資料構建高匹配誘導多能干細胞庫的可行性研究

發(fā)布時間:2018-07-17 20:17
【摘要】:目的研究利用骨髓庫HLA資料建立高匹配誘導多能干細胞(iPS)庫的可行性。方法通過對中華骨髓庫湖南分庫長沙實驗室5 236(人)份HLA分型數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析,找出O型HLA-A、-B、-DRB1三座位純合子數(shù)據(jù),計算以純合子志愿者為假定iPS供者、5 236名隨機志愿者為假定患者的匹配幾率;同時計算隨機志愿者HLA單體型頻率,評估以O型HLA高頻單體型純合子志愿者為假設iPS供者的匹配幾率。結果在5 236份骨髓供者資料中共發(fā)現(xiàn)O型HLA單體型純合子14種,以此建庫可以分別為49.81%(2 608/5 236)、61.29%(3 209/5 236)、79.51%(4 163/5 236)、75.76%(3 967/5 236)及97.78%(5 120/5 236)的假定患者提供5種匹配水平的iPS供者;共檢出17種高頻率(HF1%)的單體型,以這些單體型的O型純合子建庫可以分別為64.06%(3 354/5 236)、75.55%(3 956/5 236)、81.11%(4 247/5 236)、78.76%(4 124/5 236)及98.28%(5 146/5 236)的假定患者提供5種匹配水平的iPS供者。結論利用中華骨髓庫現(xiàn)有的HLA資料可以建立數(shù)量少、效率高的iPS細胞庫。
[Abstract]:Objective to study the feasibility of establishing high-match induced pluripotent stem cells (iPS) bank using HLA data from bone marrow bank. Methods by statistical analysis of 5 236 HLA-typing data from Changsha Laboratory of Hunan Branch of Chinese Bone Marrow Bank, we found out the homozygote data of O-type HLA-Af- BN-DRB1 locus. The matching probability of 5 236 random volunteers with hypothetical iPS donor was calculated, and the HLA haplotype frequency of random volunteers was calculated. To evaluate the matching probability of hypothetical iPS donors using high frequency haplotype homozygous volunteers of HLA type O (HLA). Results A total of 14 types of HLA haplotype homozygotes were found in 5 236 bone marrow donors, with which 61.29% (3 209 / 5 236) and 97.78% (5 120 / 5 236) of hypothetical patients were able to provide 5 matching levels of iPS donors, respectively, in 75.76% (3 967 / 5 236) and 97. 78% (5 120 / 5 236) of hypothetical patients. A total of 17 haplotypes with high frequency (HF1%) were detected. The homozygotes of these haplotypes were 64.06% (3 354 / 5 236), 75.55% (3 956 / 5 236) and 78.76% (4 124 / 5 236) and 98.28% (5 146r 5 236) of hypothetical iPS donors. Conclusion using the existing HLA data from Chinese bone marrow bank, we can establish a few and efficient iPS cell bank.
【作者單位】: 長沙血液中心;
【分類號】:R329

【參考文獻】

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【共引文獻】

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本文編號:2130822


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