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線粒體融合基因2啟動子的生物信息學(xué)研究

發(fā)布時間:2018-01-13 02:07

  本文關(guān)鍵詞:線粒體融合基因2啟動子的生物信息學(xué)研究 出處:《中國動脈硬化雜志》2013年02期  論文類型:期刊論文


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【摘要】:目的線粒體融合基因2是一個新發(fā)現(xiàn)的負調(diào)控血管平滑肌細胞增殖的基因,在原發(fā)性高血壓患者血管平滑肌細胞中低表達,但其調(diào)控機制還不明確。本研究通過生物信息學(xué)方法研究線粒體融合基因2的轉(zhuǎn)錄和調(diào)控機制。方法通過使用在線軟件,對線粒體融合基因2上游5'端的啟動子分布、轉(zhuǎn)錄因子及其結(jié)合位點、CpG島、TATA box分析、保守區(qū)域等進行分析。同時對該區(qū)SNP的分布及其功能進行研究。結(jié)果線粒體融合基因2上游5'端存在5個啟動子,但是起核心作用的可能只有2個;有2個保守區(qū)域,存在69個轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點,后者主要與炎癥反應(yīng)、氧化應(yīng)激、細胞增殖與分化和MAPK、STAT信號傳導(dǎo)通路相關(guān);一個CpG島;15個TATA box,有8個處于-2000 bp以內(nèi);32個SNP位點,其中9個處于核心啟動子區(qū),5個可能會影響線粒體融合基因2的轉(zhuǎn)錄。結(jié)論線粒體融合基因2上游5'端-400 bp以內(nèi)可能存在著核心啟動子,該啟動子區(qū)存在著一些重要的與線粒體融合基因2功能相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子。同時,啟動子區(qū)存在的大量SNP可能會影響基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控。
[Abstract]:Objective To study the mechanism of transcription and regulation of mitochondrial fusion gene 2 , which is a newly discovered gene which regulates the proliferation of vascular smooth muscle cells . The mechanism of transcription and regulation of mitochondrial fusion gene 2 is studied by bioinformatics .

【作者單位】: 首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京安貞醫(yī)院北京市心肺血管疾病研究所高血壓研究室;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(81270216) 國家863高技術(shù)項目基金資助(2008AA02Z441) 北京市自然科學(xué)基金重大項目(7120001);北京市自然科學(xué)基金項目(7102045)
【分類號】:R346
【正文快照】: 血管平滑肌細胞(vascular smooth muscle cells,VSMC)的異常增殖是原發(fā)性高血壓(essential hyper-tension,EH)動脈粥樣硬化常見的原因,同時也是EH的常見結(jié)果,但是其潛在的分子機制還不清楚。1997年陳光慧等[1]從自發(fā)性高血壓大鼠(spontaneouslyhypertensive rat,SHR)血管中分

【參考文獻】

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【共引文獻】

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【二級參考文獻】

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