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人精子特異性乳酸脫氫酶結(jié)構(gòu)和功能的計算生物學(xué)分析

發(fā)布時間:2017-12-09 23:01

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【摘要】:精子特異性乳酸脫氫酶(lactate dehydrogenase,LDH),又稱乳酸脫氫酶C4(lactate dehydrogenase C4,LDH-C4),特異性地存在于哺乳動物發(fā)育成熟的睪丸組織中,與精子的生成、代謝、獲能等有密切關(guān)系.根據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫中人LDH-C4氨基酸序列(P07864),利用PROSITE數(shù)據(jù)庫預(yù)測人LDH-C4的功能基序;利用Clustalw2、TreeView1.6.6進(jìn)行LDH-C4進(jìn)化樹的構(gòu)建;利用I-TASSER軟件預(yù)測人LDH-C4的二、三、四級結(jié)構(gòu)以及功能位點.結(jié)果表明:在190!196位有1個LDH活性位點,該位點為脊椎動物各亞型乳酸脫氫酶共有的催化位點,為進(jìn)化中的1個保守序列;從進(jìn)化樹來看,LDHC和LDHB的親緣關(guān)系比較近;人LDH-C4與小鼠LDH-C4的二級、三級結(jié)構(gòu)具有很高的相似性;LDH-C4屬乳酸脫氫酶-蘋果酸脫氫酶(LDH-MDH)超家族中的LDH-1(cd05293)家族的成員,屬于NAD依賴性酶,擁有LDH-1家族具備的基本結(jié)構(gòu)特點.以上結(jié)果為研究LDH-C4基因突變對其功能的影響打下基礎(chǔ).
【作者單位】: 南京軍區(qū)福州總醫(yī)院全軍計劃生育優(yōu)生優(yōu)育研究所;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(No.81170562) 福建省自然科學(xué)基金(No.26111058)~~
【分類號】:R321.1
【正文快照】: 乳酸脫氫酶(lactate dehydrogenase,LDH)以NAD+為輔酶,催化乳酸與丙酮酸的互相轉(zhuǎn)化,由4個亞基組成,廣泛分布于脊椎動物、植物和細(xì)菌.脊椎動物組成LDH有3種不同類型:LDH-A、LDH-B、LDH-C.由4個A亞基組成的LDH-A4主要存在于骨骼肌(故LDH-A4又稱LDH-M4),最適合于在無氧條件下催

【參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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