本文關(guān)鍵詞：microRNA-200家族在狂犬病病毒感染鼠腦組織中的表達及其靶基因預(yù)測

  更多相關(guān)文章： 狂犬病病毒 microRNA 靶基因 生物信息學(xué)

【摘要】：目的檢測microRNA-200(miR-200)家族在感染狂犬病病毒鼠腦中的表達水平,預(yù)測相關(guān)靶基因,為miR-200家族靶基因的生物學(xué)驗證提供數(shù)據(jù)支持,為研究miR-200家族在狂犬病病毒感染過程中的調(diào)節(jié)機制和生物學(xué)功能奠定理論基礎(chǔ)。方法利用MicroRNA基因芯片技術(shù)檢測miR-200家族在感染狂犬病病毒鼠腦組織中的表達水平,并對其進行qRT-PCR驗證;利用TargetScan、MicroCosm Targets和miRarnada等3個數(shù)據(jù)庫預(yù)測miR-200的靶基因,并對靶基因進行功能和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路富集分析。結(jié)果與對照組相比,miR-200在感染狂犬病病毒的小鼠腦組織中表達水平顯著下降,預(yù)測的靶基因有3154個,靶基因主要參與細胞周期、細胞因子受體結(jié)合、細胞代謝、高分子代謝和生物學(xué)調(diào)節(jié)等生物學(xué)功能(P0.01)。參與的信號通路主要有JAK-STAT信號通路、TCR信號傳導(dǎo)通路、軸突引導(dǎo)、蛋白質(zhì)泛素化、Wnt信號通路、TGF-β信號通路和癌癥等信號通路(P0.05)。結(jié)論 miR-200家族在感染狂犬病病毒的鼠腦組織中表達水平顯著下降,預(yù)測的靶基因在相關(guān)免疫應(yīng)答中起重要作用,也可能與狂犬病病毒的感染和致病性有關(guān)。
【作者單位】： 吉林大學(xué)畜牧獸醫(yī)學(xué)院;中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院軍事獸醫(yī)研究所 吉林省人獸共患病預(yù)防與控制重點實驗室;
【基金】：國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(973計劃)(No.2011CB504706) 國家自然科學(xué)基金項目(No.81171555)
【分類號】：R373.9
【正文快照】： 狂犬病(rabies)是由狂犬病病毒(Rabies virus,RABV)引起的人獸共患傳染病,一旦發(fā)病,病死率幾乎為100%,是迄今為止人類病死率最高的急性傳染病。據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)統(tǒng)計,每年全球有55 000人死于狂犬病[1]。我國狂犬病的發(fā)病率居世界第2位,僅次于印度。RABV為單股負鏈RNA病毒,

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 周學(xué);王昊煒;薛峰;;赤擬谷盜基因組中microRNA的生物信息學(xué)預(yù)測與進化分析[J];價值工程;2010年11期

2 陳旭;李晚忱;付鳳玲;;玉米microRNAs及其靶基因的生物信息學(xué)預(yù)測[J];遺傳;2009年11期

3 李國喜;寧小敏;康相濤;楊公社;;MicroRNA調(diào)控動物脂肪細胞的分化[J];中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報;2009年04期

4 高佳莉;羅玉萍;李思光;;miR-34基因家族的分子進化[J];動物學(xué)研究;2007年03期

5 張艷;徐廣賢;賈浩;李娟;王玉炯;;microRNA對腫瘤細胞增殖與分化的調(diào)控[J];科技導(dǎo)報;2009年02期

6 張坤山;李思光;羅玉萍;;調(diào)控過氧化物酶體生物合成和增殖的microRNA的計算機分析[J];細胞生物學(xué)雜志;2009年02期

7 吳家昌;馬瓊;鄒賢飛;楊彤濤;單樂群;馬保安;;miRNA與細胞分化的研究進展[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進展;2010年03期

8 林德球;林遼華;;DNA聚合酶δ結(jié)合蛋白38是microRNA-291a-5p的一個靶基因[J];生物工程學(xué)報;2010年08期

9 林玉玲;賴鐘雄;;植物胚胎發(fā)育MicroRNA研究進展[J];生物技術(shù)通報;2010年10期

10 魯玉柱;封振;邊黎穎;梁建生;;植物發(fā)育與microRNA[J];西北植物學(xué)報;2009年05期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 賀明;陰倩倩;王球玉;趙倩;陳國強;;MicroRNA在HIF-1α誘導(dǎo)白血病細胞分化中的作用[A];中國病理生理學(xué)會受體、腫瘤和免疫專業(yè)委員會聯(lián)合學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2010年

2 劉娜;楊景華;張明方;;嫁接西瓜microRNA的鑒定以及表達差異研究[A];中國園藝學(xué)會2011年學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2011年

3 孫維峰;張嫻嫻;孫奮勇;徐偉;;復(fù)方土茯苓顆粒對高尿酸血癥小鼠腎臟microRNA表達的影響[A];全國第八屆中西醫(yī)結(jié)合風(fēng)濕病學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2010年

4 鞏麗穎;孫開來;;兩種microRNA在先心病心肌組織中的表達[A];中國的遺傳學(xué)研究——遺傳學(xué)進步推動中國西部經(jīng)濟與社會發(fā)展——2011年中國遺傳學(xué)會大會論文摘要匯編[C];2011年

5 徐晨;鮑堅強;李定;郭強蘇;;microRNA-449在小鼠精子發(fā)生過程中的作用研究[A];中國解剖學(xué)會2011年年會論文文摘匯編[C];2011年

6 熊薇;陳小梅;李慧玉;黃士昂;;K562來源微泡microRNA表達譜分析[A];第13屆全國實驗血液學(xué)會議論文摘要[C];2011年

7 羅湘杭;胡容;楊麗;謝輝;周厚德;伍賢平;廖二元;;破骨細胞分化過程中microRNA表達譜及miR-148a的功能機制研究[A];中華醫(yī)學(xué)會第十次全國內(nèi)分泌學(xué)學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2011年

8 羅湘杭;胡容;楊麗;謝輝;周厚德;伍賢平;廖二元;;破骨細胞分化過程中microRNA表達譜及miR-148a的功能機制研究[A];中華醫(yī)學(xué)會第六次全國骨質(zhì)疏松和骨礦鹽疾病學(xué)術(shù)會議暨中華醫(yī)學(xué)會骨質(zhì)疏松和骨礦鹽疾病分會成立十周年論文匯編[C];2011年

9 郭麗娟;蔡軍;李積鳳;劉杰;楊媛華;龐寶森;翟振國;王辰;王軍;;循環(huán)microRNA在CTEPH診斷及發(fā)病機制中的作用研究[A];中華醫(yī)學(xué)會呼吸病學(xué)年會——2011（第十二次全國呼吸病學(xué)學(xué)術(shù)會議）論文匯編[C];2011年

10 張銳;胡艷;李靜;李榮杰;倪迎冬;趙茹茜;;Leptin對肉雞肝臟microRNA及其靶基因表達的影響[A];全國動物生理生化第十一次學(xué)術(shù)交流會論文摘要匯編[C];2010年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 本報記者 李恩青;生物信息學(xué)：促動BT與IT雙贏[N];中國高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)導(dǎo)報;2001年

2 英潮;生物信息學(xué)演繹“變臉”[N];中藥報;2002年

3 劉義;生物信息學(xué)產(chǎn)業(yè)浮出水面[N];中國高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)導(dǎo)報;2000年

4 中科院院士 強伯勤;生物信息學(xué)蘊有巨大效益[N];光明日報;2002年

5 白毅;加強生物信息學(xué)建設(shè)推動人類基因組研究[N];中國醫(yī)藥報;2002年

6 周穎;李梢：生物信息學(xué)為證候研究提供新視角[N];中國中醫(yī)藥報;2006年

7 嚴飛;生物信息學(xué) 新世紀的新科學(xué)[N];大眾科技報;2002年

8 中國科學(xué)院院士 張春霆 郝柏林;生物信息學(xué)孕育大產(chǎn)業(yè)[N];經(jīng)濟日報;2000年

9 劉麗麗;高性能計算為生物信息學(xué)加速[N];計算機世界;2007年

10 田耕;新世紀的新學(xué)科 生物信息學(xué)[N];大眾科技報;2000年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 盛熙暉;應(yīng)用文庫構(gòu)建法和生物信息學(xué)方法鑒定綿羊microRNA[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2010年

2 晁騰飛;miR-9靶向CBX7影響神經(jīng)膠質(zhì)瘤細胞的增殖[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2008年

3 彭麗華;腹瀉型腸易激綜合征及潰瘍性結(jié)腸炎大腸黏膜全基因組及MicroRNA表達譜研究[D];中國人民解放軍軍醫(yī)進修學(xué)院;2010年

4 于曼麗;Let-7d對血管平滑肌細胞增殖調(diào)控的研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2011年

5 于琦;雄激素受體在乳腺癌中表達意義和相關(guān)microRNA篩選的研究[D];天津醫(yī)科大學(xué);2010年

6 袁圓;全腦缺血再灌注后大鼠海馬microRNA的變化及Let-7e調(diào)控Caspase-3表達和機制研究[D];浙江大學(xué);2010年

7 吳志鵬;脊柱骨巨細胞瘤發(fā)生與復(fù)發(fā)差異表達的microRNA的篩選研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2011年

8 許建;肝癌組織中異常表達基因microRNA結(jié)合位點遺傳變異及肝癌患者血清microRNA的研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2011年

9 林茂松;人結(jié)直腸癌microRNA表達譜及其臨床意義的研究[D];蘇州大學(xué);2010年

10 陳智勇;腎透明細胞癌循環(huán)microRNA表達變化的研究[D];中南大學(xué);2010年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 曲婷;基于生物信息學(xué)方法的H1N1流感病毒致病及傳播特性研究[D];吉林大學(xué);2010年

2 王琳;小鼠GSK3β microRNA的生物信息學(xué)預(yù)測及實驗驗證[D];華東師范大學(xué);2011年

3 許振華;玉米低硝酸鹽響應(yīng)microRNA及靶基因鑒定與驗證[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2011年

4 高娜;基于SVM的microRNA多特征融合模型研究[D];吉林大學(xué);2010年

5 謝福亮;油菜microRNA和靶基因的預(yù)測與鑒定[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年

6 陳文新;小立碗蘚（Physcomitrella patens）植物microRNA結(jié)合靶位預(yù)測[D];首都師范大學(xué);2008年

7 宋永站;microRNA-200c對ZEB1表達影響及對腫瘤細胞侵襲遷移作用[D];江蘇大學(xué);2010年

8 胡德亮;microRNA-19b在P19細胞向心肌細胞分化中的作用[D];南京醫(yī)科大學(xué);2011年

9 孫佃臣;低磷脅迫響應(yīng)microRNA及靶基因的克隆和大豆遺傳轉(zhuǎn)化研究[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2011年

10 張秀梅;韌帶成纖維細胞成骨分化過程microRNA、mRNA和蛋白表達譜分析[D];濟南大學(xué);2011年

，

本文編號：1248350