本文關(guān)鍵詞：人感染H7N9禽流感病毒血凝素和神經(jīng)氨酸酶的B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)

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【摘要】：目的利用計(jì)算機(jī)軟件預(yù)測(cè)人感染H7N9禽流感病毒血凝素(HA)和神經(jīng)氨酸酶(NA)的B細(xì)胞表位。方法以HA、NA的氨基酸序列為基礎(chǔ),用Protean、PORTER、MEGA等生物信息學(xué)軟件綜合預(yù)測(cè)HA、NA蛋白可能的B細(xì)胞表位,再結(jié)合吳玉章的平均抗原指數(shù)方案進(jìn)一步篩選。結(jié)果 HA蛋白最有可能的B細(xì)胞表位位于其N端的第53～57、179～183區(qū)段,HA蛋白的其它區(qū)段:62～66、98～101、164～166、315～320、424～426、443～445、493～496等也有可能存在B細(xì)胞表位。NA蛋白最有可能的B細(xì)胞表位位于N端的第321～329、379～386區(qū)段,NA蛋白的其他區(qū)段:46～48、52～54、74～78、136～141、145～150、160～164、194～197、246～248、333～343、426～431等也有可能存在B細(xì)胞表位。結(jié)論綜合多種方案預(yù)測(cè)了H7N9病毒HA、NA蛋白的B細(xì)胞表位,為人感染H7N9禽流感病毒表位疫苗研究提供了實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。
【作者單位】： 重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院感染科
【分類號(hào)】：R373
【正文快照】： 今年3月,我國(guó)多省爆發(fā)了人感染H7N9禽流感疫情,這在世界上尚屬首次報(bào)道。一些研究已表明導(dǎo)致此次人感染的H7N9禽流感病毒是由3種流感病毒重組的新型病毒[1-2]。通過(guò)基因序列分析,發(fā)現(xiàn)該病毒的一些重要位點(diǎn)發(fā)生了變異,從而變得毒性增強(qiáng)、更易感染人以及對(duì)烷胺類的抗病毒藥物耐

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10 盧楊;基于蛋白質(zhì)側(cè)鏈信息的B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)的機(jī)器學(xué)習(xí)方法[D];東北師范大學(xué);2012年

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本文編號(hào)：1174489