本文關鍵詞：新型甲型H7N9禽流感病毒HA與NA的進化分析

  更多相關文章： 甲型HN禽流感病毒 血凝素 神經(jīng)氨酸酶 建模

【摘要】：目的研究2013年甲型H7N9流感病毒血凝素(HA)與神經(jīng)氨酸酶(NA)的基因進化特征,探討該病毒的遺傳變異和分子特性。方法收集GenBank中已登錄的禽流感病毒基因相關參考序列,利用生物信息學軟件DNAMAN和MEGA 4.0對HA和NA基因序列進行進化分析,并利用Phymol軟件進行同源建模。結果 2013年甲型H7N9流感病毒HA與NA的氨基酸序列與國際/國內(nèi)參考毒株的同源性為95.7%～99.8%。同源建模發(fā)現(xiàn)該毒株HA的氨基酸序列發(fā)生了Q226L突變,NA上也發(fā)生了R294K和69 5N del氨基酸突變。結論新型甲型H7N9流感病毒的HA和NA基因序列與我國江浙地區(qū)和部分東亞國家的H7N9禽流感病毒參考株具有高度的同源性,該毒株HA與NA蛋白氨基酸序列發(fā)生的變異,可能是病毒致病性改變的原因之一。
【作者單位】： 昆明市延安醫(yī)院檢驗科;浙江大學醫(yī)學院附屬第一醫(yī)院檢驗科;浙江大學醫(yī)學院附屬第一醫(yī)院中心實驗室;
【分類號】：R373.13
【正文快照】： 2013年3月,上海和安徽兩地發(fā)現(xiàn)了3例新型甲型H7N9禽流感病毒(avian-origin influenza virus,AIV)的人感染病例,繼而江蘇、浙江也發(fā)現(xiàn)了相同感染病例。該病毒為全球首次發(fā)現(xiàn)的新亞型AIV。截至4月15日,上述地區(qū)H7N9病毒的感染病例已達60例,其中13例死亡[1]。研究[2]發(fā)現(xiàn),病毒獲

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