本文關(guān)鍵詞：我國不同基因型水痘-帶狀皰疹病毒流行毒株gE基因序列分析

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【摘要】：為進(jìn)一步了解我國不同地區(qū)流行的水痘—帶狀皰疹病毒(VZV)病毒株的基因型分布和分析代表性病毒株gE基因序列。于2010年12月至2011年6月期間,收集來自北京市、長春市、拉薩市和烏魯木齊市4個(gè)地區(qū)水痘和帶狀皰疹患者的皰疹液拭子和皮膚痂片,共計(jì)18份。用單個(gè)核苷酸多態(tài)性(SNP)譜的方法確定病毒株的基因型。然后采用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)方法擴(kuò)增gE基因的全長片段,并進(jìn)行測序分析。SNP分析顯示18個(gè)病毒株的基因型共為4種,其中有7株屬于clade2遺傳支,1株屬于clade3遺傳支,4株為clade5遺傳支。另有6株病毒兼有不同遺傳支的特征,按照目前國際通用的分型方法不能歸屬于任何明確的遺傳支。對不同病毒株gE基因序列分析,除了發(fā)現(xiàn)3個(gè)國外已有報(bào)道的1個(gè)同義突變(T660C)和2個(gè)反義突變(C119T、C1606A),還發(fā)現(xiàn)了3個(gè)新的反義突變(C56T、C1109T和C917A)和4個(gè)同義突變(C54T、T1075C、T816C和G279A)。首次在我國新疆自治區(qū)發(fā)現(xiàn)了clade5遺傳支的VZV,在長春市還發(fā)現(xiàn)了目前尚未能分型的6株病毒。對部分病毒株gE基因序列分析,在gE的e1和c1抗原表位的編碼區(qū)內(nèi)中檢出1個(gè)新型反義突變(C917A),需要進(jìn)一步研究該突變對該病毒免疫原性和致病性的影響。
【作者單位】： 安徽醫(yī)科大學(xué)微生物學(xué)教研室;吉林大學(xué)白求恩第一醫(yī)院皮膚科;新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院皮膚科;北京大學(xué)附屬第三醫(yī)院皮膚科;西藏大學(xué)醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)部;哥倫比亞大學(xué)病理與細(xì)胞生物學(xué)教研室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(30872253) 安徽省科技廳科技攻關(guān)項(xiàng)目(8010302179)
【分類號】：R373.1
【正文快照】： 水痘-帶狀皰疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)屬皰疹病毒α亞科,為雙鏈DNA病毒。VZV能引起兩種臨床表現(xiàn)截然不同的疾病,原發(fā)感染引起水痘,并可潛伏在感染者的背根神經(jīng)節(jié)、顏面神經(jīng)節(jié)、腸道神經(jīng)節(jié)等多處感覺神經(jīng)節(jié)中,日后在機(jī)體免疫功能下降時(shí)(分子機(jī)理尚不清楚)病毒發(fā)生再

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