發(fā)布時間：2017-11-05 20:09

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【摘要】：目的探討隨機梯度boosting算法(SGB)對代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分類判別和代謝物篩選的效果。方法每一次迭代均根據(jù)損失函數(shù)最小化原則得出"偽殘差",并用最小二乘法對其構(gòu)建基礎(chǔ)分類器(決策樹),最終組合各分類器形成隨機梯度boosting模型。通過模擬實驗和真實代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的分析,與Adaboost、RF、SVM三種算法進行比較。結(jié)果無論是在模擬條件下還是真實數(shù)據(jù)中,隨機梯度boosting算法的分類準確性都優(yōu)于其他三種算法。算法可評價各代謝物重要性,有效地篩選出部分代謝物。結(jié)論隨機梯度boosting算法適用于代謝組學(xué)數(shù)據(jù)研究,對疾病早期診斷、治療和預(yù)后具有重要價值,值得進一步研究和探索。
【作者單位】： 哈爾濱醫(yī)科大學(xué)衛(wèi)生統(tǒng)計教研室;復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院臨床資料統(tǒng)計室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助(81172767)
【分類號】：R341;TP18
【正文快照】： 代謝物組學(xué)是在后基因組學(xué)時代興起的一門跨領(lǐng)域?qū)W科,其主要目標是定量地研究生命體對外界刺激、病理生理變化、以及基因突變而產(chǎn)生的其體內(nèi)代謝物水平的多元動態(tài)反應(yīng),目前已發(fā)展并滲透到各個生物學(xué)領(lǐng)域,如疾病早期診斷〔1〕、醫(yī)藥研制開發(fā)、營養(yǎng)食品科學(xué)、毒理學(xué)等。代謝組

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1 劉樹業(yè);段櫻;李嫻;;代謝組學(xué)的進展及肝臟代謝組學(xué)[J];分子診斷與治療雜志;2009年03期

2 吳公平;王蓉蓉;田洪;劉東波;胡瑕;歐陽杰湖;陳子淵;;過敏反應(yīng)動物模型的代謝組學(xué)研究[J];中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志;2011年23期

3 王宇平;郭長江;楊繼軍;韋京豫;張琪;顏賢忠;;急性低氧暴露小鼠外周血代謝組變化分析[J];中國應(yīng)用生理學(xué)雜志;2009年02期

4 岳秀飛;史曉偉;;代謝組學(xué)技術(shù)及其應(yīng)用的研究進展[J];科技信息;2010年32期

5 張敏;錢善軍;;代謝組學(xué)在醫(yī)藥學(xué)中的應(yīng)用現(xiàn)狀和展望(綜述)[J];安徽衛(wèi)生職業(yè)技術(shù)學(xué)院學(xué)報;2011年04期

6 施鈺琳;王小琴;;代謝組學(xué)及其應(yīng)用研究新進展[J];醫(yī)學(xué)綜述;2007年20期

7 熊萍;肖麗英;李繼遙;;細菌和真菌的代謝組學(xué)研究[J];國際口腔醫(yī)學(xué)雜志;2008年S1期

8 苑福升;劉健;高琦;朱本清;王海濤;閆鵬;楊小玉;;聯(lián)合蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)探討兔脊髓缺血再灌注損傷的時間規(guī)律[J];中國醫(yī)藥導(dǎo)報;2011年12期

9 許彬;王海龍;魏開華;張學(xué)敏;楊松成;;代謝組學(xué)分析技術(shù)及其在幾類重大疾病研究中的應(yīng)用[J];分析測試學(xué)報;2006年05期

10 劉樹民;盧芳;王喜軍;孫文軍;董培良;;基于代謝組學(xué)的熱病證候模型評價方法研究[J];中國藥理學(xué)通報;2009年04期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 蔣寧;周文霞;張永祥;顏賢忠;張齊;;基于核磁共振技術(shù)的快速老化模型小鼠體液代謝組學(xué)研究[A];2008年全國抗衰老與老年癡呆學(xué)術(shù)會議論文集[C];2008年

2 司端運;劉昌孝;;基于質(zhì)譜技術(shù)的代謝組學(xué)研究方法中存在的問題[A];第八次全國藥物與化學(xué)異物代謝學(xué)術(shù)會議論文摘要[C];2006年

3 許國旺;;代謝組學(xué)研究的新進展[A];2007年浙江省醫(yī)學(xué)檢驗學(xué)學(xué)術(shù)年會論文匯編[C];2007年

4 趙立波;劉恩溢;劉一;李玉珍;;基于三重四極桿-線性離子阱雜交質(zhì)譜技術(shù)的代謝組學(xué)分析方法的建立[A];2011年中國藥學(xué)大會暨第11屆中國藥師周論文集[C];2011年

5 李福山;白嵐;;分子生物學(xué)研究的新領(lǐng)域—代謝組學(xué)[A];廣東省肝臟病學(xué)會微創(chuàng)專業(yè)委員會學(xué)術(shù)會議暨消化道腫瘤靶向治療新技術(shù)學(xué)習(xí)班論文匯編[C];2007年

6 孫璐璐;李金寶;鄧小明;;大鼠革蘭陰性菌和革蘭陽性菌感染膿毒癥模型的構(gòu)建及代謝組學(xué)研究[A];第十五次長江流域麻醉學(xué)學(xué)術(shù)年會暨2010年中南六省麻醉學(xué)學(xué)術(shù)年會暨2010年湖北省麻醉學(xué)學(xué)術(shù)年會論文集[C];2010年

7 張利民;葉央芳;安艷捧;田園;王玉蘭;唐惠儒;;大鼠對黃曲霉毒素B1暴露應(yīng)答的代謝組學(xué)研究[A];第十六屆全國波譜學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2010年

8 林[?釗;印大中;;能量代謝與人類生理性衰老過程[A];第十一次中國生物物理學(xué)術(shù)大會暨第九屆全國會員代表大會摘要集[C];2009年

9 徐雯欣;安艷捧;王玉蘭;唐惠儒;;鏈脲佐菌素誘導(dǎo)大鼠各臟器的代謝組分析[A];第十六屆全國波譜學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2010年

10 冉玉平;;轉(zhuǎn)化真菌學(xué)—概念與實踐[A];中國菌物學(xué)會第五屆會員代表大會暨2011年學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2011年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 中科院院士、人類基因組北方中心主任強伯勤;與臨床結(jié)合更緊是趨勢[N];健康報;2006年

2 孫國根;聞玉梅院士解讀“人體細菌群落分布圖”[N];中國醫(yī)藥報;2009年

3 復(fù)旦大學(xué)附屬華東醫(yī)院營養(yǎng)科 馮穎;人類對于腸道微生態(tài)的認識步入新境界(上)[N];中國食品報;2010年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 黎莉;疾病及藥物干預(yù)的代謝組學(xué)方法及應(yīng)用研究[D];華東理工大學(xué);2010年

2 夏建飛;基于液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)的代謝組學(xué)新方法的研究與應(yīng)用[D];華東理工大學(xué);2010年

3 韓莉妲;基于GC/MS技術(shù)的脂肪酸代謝輪廓譜方法和應(yīng)用研究[D];華東理工大學(xué);2011年

4 江芝婷;代謝組學(xué)在疾病預(yù)測診斷以及療效評價中的應(yīng)用研究[D];華東理工大學(xué);2011年

5 廖文婷;基于生物質(zhì)譜技術(shù)的HIV-1 Tat蛋白生物活性的代謝組學(xué)研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2012年

6 周江睿;神經(jīng)肽Y對巨噬細胞炎性因子和小分子炎癥介質(zhì)的調(diào)節(jié)及機制研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2012年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前7條

1 毛璇;代謝組學(xué)技術(shù)在疾病動物模型研究中的應(yīng)用[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2010年

2 吳勝明;基于GC/TOF-MS小鼠血漿代謝組學(xué)技術(shù)方法的建立及其應(yīng)用[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2010年

3 李文娟;博爾納病病毒感染人少突膠質(zhì)細胞的代謝組學(xué)研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2012年

4 呂潔;釓生物效應(yīng)代謝組學(xué)研究[D];燕山大學(xué);2009年

5 王泳欽;束縛應(yīng)激致大鼠高同型半胱氨酸血癥的肝臟代謝組學(xué)研究[D];華北煤炭醫(yī)學(xué)院;2009年

6 張磊;F蛋白誘導(dǎo)原位肝移植大鼠免疫耐受的實驗研究[D];天津醫(yī)科大學(xué);2012年

7 董玲玲;生物被膜型白念珠菌代謝物分析及代謝變化的初步研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2010年

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本文編號：1145675