NRAMP1及MBL SNPs與寧夏海原回族肺結核病遺傳易感性的關聯(lián)性研究
發(fā)布時間:2020-08-12 09:02
【摘要】: 目的結核病的發(fā)生是結核分枝桿菌與宿主之間相互作用的結果,宿主遺傳因素在結核病發(fā)生發(fā)展過程中有著不可忽視的作用。本研究選擇的結核病主要候選易感基因:自然抗性相關性巨噬細胞蛋白1(NRAMP1)基因甘露聚糖結合凝集素( MBL)基因,探討其多態(tài)性與寧夏海原地區(qū)人群結核病遺傳易感性的相關性。方法采用以醫(yī)院為基礎的病例對照研究設計。收集2007年3月-2008年3月,經(jīng)寧夏海原縣醫(yī)院確診的回族結核病患者141例,另選擇與其相匹配的152例回族健康人群作為對照(均排除結核病史,且無自身免疫病、慢性炎癥等其他疾病),應用聚合酶鏈反應-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)法檢測3’UTR、D543N及MBL-G54A多態(tài)性位點的基因型,采用SPSS11.5統(tǒng)計軟件進行統(tǒng)計學分析,計算基因型頻率,等位基因頻率及比值比(OR)。結果(1)對病例和對照人群中的3個基因多態(tài)性位點的頻率進行檢驗,均符合Hardy-Weinberg平衡定律,表明各基因型頻率在該人群中已達遺傳平衡,所選樣本具有群體代表性。(2)以NRAMP1-3’UTR位點TGTG+/+基因型為參照,NRAMP1-3’UTR位點TGTG+/del基因型在病例組中的分布頻率顯著高于對照組(P值分別為0.006;OR值為1.562),差異具有顯著性意義;NRAMP1-3’UTR位點TGTGdel/del基因型在病例組和對照組中的分布差異無顯著性意義(P值為0.774;OR值為0.854)。(3)以NRAMP1- D543N位點GG基因型為參照組,NRAMP1- D543N位點GA基因型在病例組中的分布頻率顯著高于對照組(P值為0.012;OR值為1.545),差異具有顯著性意義;NRAMP1- D543N位點AA基因型在病例組和對照組中的分布差異無顯著性意義(P值分別為0.186;OR值為1.781)。(4)以MBL-G54A位點的GG基因型為參照組,MBL-G54A位點GA基因型在病例組的分布頻率顯著高于對照組(P值為0.008;OR值為1.572);MBL-G54A位點AA基因型在病例組和對照組中的分布差異無顯著性意義(P值分別為0.991;OR值為0.994)。結論(1) NRAMP1-3’UTR位點TGTG+/del基因型可能與寧夏海原回族肺結核的易感性相關。(2)NRAMP1-D543N位點GA基因型可能與寧夏海原回族肺結核的易感性相關。(3)MBL-G54A位點GA基因型可能與寧夏海原回族肺結核的易感性相關。
【學位授予單位】:寧夏醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2009
【分類號】:R521
【圖文】:
圖 1 NRAMP1-3’UTR PCR 擴增產(chǎn)物Fig1 PCR Production of NRAMP1-3’UTRMarker 500/400/300/250/200/50Lane1-7 PCR 擴增產(chǎn)物(244bp)P1-3’UTR 多態(tài)性分型結果R-RFLP 法確定 NRAMP1-3’UTR 多態(tài)性,在該基因多態(tài)生 TGTG 缺失突變會使其內(nèi)部原有的 FokⅠ酶切位點酶解成不同的片段。電泳后在 DNA 標準分子量參照物型,即 TGTG+/+純合子(211bp、33bp);TGTG+/del 雜p);TGTGdel/del 純合子(240bp)(如圖 2)。
圖 2 NRAMP1-3’UTR 位點基因分型結果Fig2 Genotypes of NRAMP1-3’UTRMarker 500/400/300/200/180/160/140/120/100/80/60/40/20 bLane 2,4,5,8 TGTG+/+純合子(211bp,33bp)Lane 1,7,9 TGTG+/del 雜合子(240bp,211bp,33bp)Lane 3,6,10 TGTGdel/del 純合子(240bp)序結果序結果(反向測序)與分型結果完全一致(圖 3a,圖 3b),說 靠的基因分型。
n(frequency)77(54.6%)n(frequency)104(68.4%) 59(41.9%) 40(26.3%) 7.452 0.006 1.5(3.5%) 8(5.3%) 0.083 0.774 0.213(75.5%)69(24.5%)248(81.6%)56(18.4%) 3.188 0.0741.543N 位點多態(tài)性分析標本DNA 按照材料和方法所述的步驟及體系進 4 所示,PCR 產(chǎn)物為 244bp。
【學位授予單位】:寧夏醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2009
【分類號】:R521
【圖文】:
圖 1 NRAMP1-3’UTR PCR 擴增產(chǎn)物Fig1 PCR Production of NRAMP1-3’UTRMarker 500/400/300/250/200/50Lane1-7 PCR 擴增產(chǎn)物(244bp)P1-3’UTR 多態(tài)性分型結果R-RFLP 法確定 NRAMP1-3’UTR 多態(tài)性,在該基因多態(tài)生 TGTG 缺失突變會使其內(nèi)部原有的 FokⅠ酶切位點酶解成不同的片段。電泳后在 DNA 標準分子量參照物型,即 TGTG+/+純合子(211bp、33bp);TGTG+/del 雜p);TGTGdel/del 純合子(240bp)(如圖 2)。
圖 2 NRAMP1-3’UTR 位點基因分型結果Fig2 Genotypes of NRAMP1-3’UTRMarker 500/400/300/200/180/160/140/120/100/80/60/40/20 bLane 2,4,5,8 TGTG+/+純合子(211bp,33bp)Lane 1,7,9 TGTG+/del 雜合子(240bp,211bp,33bp)Lane 3,6,10 TGTGdel/del 純合子(240bp)序結果序結果(反向測序)與分型結果完全一致(圖 3a,圖 3b),說 靠的基因分型。
n(frequency)77(54.6%)n(frequency)104(68.4%) 59(41.9%) 40(26.3%) 7.452 0.006 1.5(3.5%) 8(5.3%) 0.083 0.774 0.213(75.5%)69(24.5%)248(81.6%)56(18.4%) 3.188 0.0741.543N 位點多態(tài)性分析標本DNA 按照材料和方法所述的步驟及體系進 4 所示,PCR 產(chǎn)物為 244bp。
【參考文獻】
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1 劉瑋,張翠英,田磊,李春芝,吳曉明,趙秋敏,張泮河,楊淑梅,楊紅,曹務春;中國漢族人群肺結核易感基因的病例對照研究[J];軍事醫(yī)學科學院院刊;2003年06期
2 段鴻飛,周新華,馬s
本文編號:2790324
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