禽源鮑曼不動(dòng)桿菌的分離鑒定與OmpA蛋白的原核表達(dá)及其初步應(yīng)用
本文關(guān)鍵詞:禽源鮑曼不動(dòng)桿菌的分離鑒定與OmpA蛋白的原核表達(dá)及其初步應(yīng)用
更多相關(guān)文章: 鮑曼不動(dòng)桿菌 流行病學(xué) 系統(tǒng)發(fā)育分析 OmpA蛋白 間接ELISA
【摘要】:鮑曼不動(dòng)桿菌(Acinetobacter baumanii,Ab)是醫(yī)院內(nèi)分離率位居第二的常見于人類感染的非發(fā)酵菌。其常會(huì)造成嚴(yán)重的醫(yī)院內(nèi)感染,包括皮膚和軟組織的感染、傷口感染、泌尿系統(tǒng)感染、繼發(fā)性腦膜炎、呼吸機(jī)相關(guān)性肺炎和菌血癥等并導(dǎo)致人類死亡。然而對(duì)于動(dòng)物源鮑曼不動(dòng)桿菌引起的動(dòng)物感染或者帶菌情況的報(bào)道遠(yuǎn)遠(yuǎn)沒有人類多,尤其禽類感染鮑曼不動(dòng)桿菌的情況鮮有報(bào)道,故探明其在禽類的感染率或者有否人源菌株感染禽類等流行病學(xué)情況具有重要的現(xiàn)實(shí)和公共衛(wèi)生意義。本課題首次開展了不動(dòng)桿菌在家禽中感染情況的調(diào)查研究,并對(duì)流行菌株進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析。此外,通過對(duì)外膜蛋白A(OmpA)進(jìn)行原核表達(dá),分析其免疫原性,并基于此建立了間接ELISA方法,以及進(jìn)行了初步應(yīng)用。本研究對(duì)2014年9月至2015年10月的發(fā)病蛋雞的肝臟、脾臟、肺、氣管和十二指腸等450份病料進(jìn)行鮑曼不動(dòng)桿菌的分離鑒定。對(duì)分離菌進(jìn)行了形態(tài)特征、培養(yǎng)特性的觀察、生化試驗(yàn)、藥敏試驗(yàn)、小鼠致病性試驗(yàn)和特異性基因檢測(cè),結(jié)果共分離到2株鮑曼不動(dòng)桿菌,流行率僅0.44%(95%CI,0.1-1.6)。2株鮑曼不動(dòng)桿菌均對(duì)多種抗生素耐藥,且對(duì)小鼠有較強(qiáng)的致病性,LD50均達(dá)到7.09×107CFU/0.5 m L。這為研究鮑曼不動(dòng)桿菌對(duì)禽類的致病性以及其感染的流行情況等提供了材料基礎(chǔ)。為了更好的認(rèn)識(shí)禽源鮑曼不動(dòng)桿菌的遺傳進(jìn)化地位及其溯源,本研究基于管家基因rec A、gyr B、rpo B結(jié)合16S r RNA基因?qū)?株禽源分離株進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析。結(jié)果表明,進(jìn)化樹分析發(fā)現(xiàn)2株禽源分離株與人源鮑曼不動(dòng)桿菌遺傳距離最近,與大腸桿菌遺傳距離最遠(yuǎn),核苷酸同源性分析顯示禽源分離菌核苷酸同源性均與人源鮑曼不動(dòng)桿菌的最高,高達(dá)92%-99.9%。以上結(jié)果說明禽源分離菌可能由人源菌株進(jìn)化而來,這顯示了重要的公共衛(wèi)生意義。證明了rec A、gyr B、rpo B基因聯(lián)合16S r RNA基因可用于不動(dòng)桿菌屬菌種鑒定,探索了一種鑒定該菌的新方法。通過設(shè)計(jì)特異性引物,擴(kuò)增OmpA基因,克隆至原核表達(dá)載體p ET28a(+),構(gòu)建重組質(zhì)粒p ET28a-OmpA,轉(zhuǎn)化至BL21菌體進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)。通過條件摸索,確定最佳誘導(dǎo)條件,之后采用瓊脂糖Ni柱純化重組蛋白,并對(duì)其進(jìn)行Western blot分析。SDS-PAGE結(jié)果表明,在37℃經(jīng)0.4 mmol/L IPTG誘導(dǎo)5 h的條件下,重組菌株能表達(dá)出約41 k Da的融合蛋白,與預(yù)期大小一致。Western blot分析顯示,該融合蛋白具有良好的免疫反應(yīng)性。以上結(jié)果為進(jìn)一步建立快速簡(jiǎn)便的免疫學(xué)檢測(cè)方法和進(jìn)行血清流行病學(xué)調(diào)查奠定基礎(chǔ)。以純化的OmpA蛋白作為抗原進(jìn)行包板,建立了針對(duì)抗雞鮑曼不動(dòng)桿菌抗體的間接ELISA檢測(cè)方法。本文所建立的ELISA方法具有良好的重復(fù)性和特異性,對(duì)來自河南不同地市的399份雞血清進(jìn)行鮑曼不動(dòng)桿菌抗體的檢測(cè),結(jié)果顯示陽性率有3.75%。本研究所建立的ELISA方法可用于臨床樣品的血清學(xué)檢測(cè),并為雞群中鮑曼不動(dòng)桿菌的臨床診斷和流行病學(xué)調(diào)查提供了有效的檢測(cè)方法。
【關(guān)鍵詞】:鮑曼不動(dòng)桿菌 流行病學(xué) 系統(tǒng)發(fā)育分析 OmpA蛋白 間接ELISA
【學(xué)位授予單位】:河南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S852.61
【目錄】:
- 致謝4-9
- 英文縮寫詞表9-10
- 摘要10-11
- 文獻(xiàn)綜述11-22
- 1.1 不動(dòng)桿菌的發(fā)現(xiàn)11
- 1.2 生長(zhǎng)與培養(yǎng)特性11-12
- 1.3 流行病學(xué)調(diào)查12-15
- 1.4 鮑曼不動(dòng)桿菌的毒力因素15-18
- 1.5 鮑曼不動(dòng)桿菌診斷方法研究進(jìn)展18-21
- 1.6 小結(jié)21-22
- 試驗(yàn)研究22-58
- 試驗(yàn)一 禽源鮑曼不動(dòng)桿菌的分離鑒定22-29
- 1.1 材料22-23
- 1.1.1 病料來源及實(shí)驗(yàn)動(dòng)物22
- 1.1.2 培養(yǎng)基和主要試劑22-23
- 1.2 方法23-24
- 1.2.1 病原菌的分離培養(yǎng)與純化23
- 1.2.2 細(xì)菌生化鑒定23
- 1.2.3 特異性基因檢測(cè)23
- 1.2.4 細(xì)菌藥敏試驗(yàn)23
- 1.2.5 小鼠致病性試驗(yàn)23-24
- 1.3 結(jié)果24-26
- 1.3.1 細(xì)菌培養(yǎng)特性和鏡檢結(jié)果24-25
- 1.3.2 生化試驗(yàn)結(jié)果25
- 1.3.3 特異性基因檢測(cè)25
- 1.3.4 藥敏試驗(yàn)結(jié)果25-26
- 1.3.5 小鼠致病性試驗(yàn)26
- 1.4 討論26-29
- 試驗(yàn)二 禽源鮑曼不動(dòng)桿菌的系統(tǒng)發(fā)育分析29-42
- 2.1 材料29-30
- 2.1.1 菌株29
- 2.1.2 主要儀器29
- 2.1.3 主要試劑29-30
- 2.2 方法30-31
- 2.2.1 引物設(shè)計(jì)30
- 2.2.2 細(xì)菌DNA的提取30
- 2.2.3 管家基因的PCR擴(kuò)增30-31
- 2.2.4 管家基因的序列測(cè)定和分析31
- 2.2.5 基于管家基因的系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建和同源性分析31
- 2.3 結(jié)果31-38
- 2.3.1 管家基因的PCR擴(kuò)增31-32
- 2.3.2 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的鑒定和測(cè)序結(jié)果32
- 2.3.3 基于4個(gè)管家基因的系統(tǒng)發(fā)育分析32-35
- 2.3.4 基于4個(gè)管家基因的同源性分析35-38
- 2.4 討論38-42
- 試驗(yàn)三 禽源鮑曼不動(dòng)桿菌OmpA基因的原核表達(dá)和免疫原性分析42-52
- 3.1 材料42-43
- 3.1.1 菌株,質(zhì)粒和試驗(yàn)動(dòng)物42
- 3.1.2 主要儀器42-43
- 3.1.3 主要試劑43
- 3.2 方法43-45
- 3.2.1 引物的設(shè)計(jì)與合成43
- 3.2.2 細(xì)菌DNA的提取43
- 3.2.3 OmpA基因的擴(kuò)增及序列分析43-44
- 3.2.4 原核表達(dá)載體的構(gòu)建44
- 3.2.5 重組蛋白的表達(dá)44
- 3.2.6 重組蛋白的純化44-45
- 3.2.7 多克隆抗體的制備45
- 3.2.8 Western blot分析45
- 3.3 結(jié)果45-51
- 3.3.1 目的基因的擴(kuò)增45-46
- 3.3.2 目的基因序列分析46-47
- 3.3.3 重組質(zhì)粒pET28a-OmpA的雙酶切鑒定47-48
- 3.3.4 重組蛋白的表達(dá)與純化48-50
- 3.3.5 Western blot分析50-51
- 3.4 討論51-52
- 試驗(yàn)四 基于禽源鮑曼不動(dòng)桿菌OmpA蛋白的間接ELISA方法的建立及應(yīng)用52-58
- 4.1.材料52-53
- 4.1.1 抗原與血清52
- 4.1.2 主要試劑和耗材52
- 4.1.3 主要儀器設(shè)備52
- 4.1.4 ELISA所需的試劑52-53
- 4.2 方法53-54
- 4.2.1 陽性血清的制備53
- 4.2.2 抗原的純化53
- 4.2.3 最佳抗原包被濃度和血清最佳稀釋度的確定53-54
- 4.2.4 最佳包板時(shí)間和溫度的確定54
- 4.2.5 最佳二抗稀釋比例的確定54
- 4.2.6 間接ELISA臨界值判斷標(biāo)準(zhǔn)的確定54
- 4.2.7 間接ELISA的特異性分析54
- 4.2.8 間接ELISA的重復(fù)性試驗(yàn)54
- 4.2.9 間接ELISA的初步應(yīng)用54
- 4.3 結(jié)果54-56
- 4.3.1 OmpA重組蛋白的純化54-55
- 4.3.2 最佳抗原包被濃度和血清最佳稀釋度55
- 4.3.3 最佳抗原包被時(shí)間和溫度55
- 3.3.4 最佳二抗稀釋比例55
- 4.3.5 臨界值判斷標(biāo)準(zhǔn)的確定55
- 4.3.6 特異性分析55-56
- 4.3.7 重復(fù)性試驗(yàn)56
- 4.3.8 初步應(yīng)用56
- 4.4 討論56-58
- 全文總結(jié)58-59
- 參考文獻(xiàn)59-72
- 附:作者讀研期間發(fā)表文章72-73
- ABSTRACT73-74
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,本文編號(hào):710404
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