本文關(guān)鍵詞：荷斯坦奶牛CXCL8基因SNPs檢測(cè)及其與乳房炎和產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)分析

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【摘要】：白介素8(interkeukin8,IL8)作為一種中性粒細(xì)胞趨化因子是趨化因子大家族的一員。曾有試驗(yàn)CXCL8在乳腺炎患者的血清中的分泌量高于健康對(duì)照者的血清分泌量。CXCL8的研究主要集中在人類(lèi)的乳腺癌上,本試驗(yàn)以CXCL8基因作為影響奶牛生產(chǎn)性狀及乳房炎的候選基因,探索其與奶牛的生產(chǎn)性能及乳房炎的相關(guān)性。本研究先利用DNAMAN軟件、在線軟件Ex PASy及在線軟件PSORT II Prediction等生物軟件對(duì)奶牛CXCL8基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析。提取446份經(jīng)產(chǎn)奶牛的頸靜脈血樣中的DNA,用PCR技術(shù)擴(kuò)增目的基因,使用直接測(cè)序檢測(cè)該基因中的多態(tài)位點(diǎn)。采用PCR-RFLP和四引物法技術(shù)對(duì)多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,最后與荷斯坦奶牛乳腺炎和產(chǎn)奶性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,旨在篩查與奶牛多種產(chǎn)奶性狀及乳房炎相關(guān)的多態(tài)位點(diǎn),為對(duì)于中國(guó)荷斯坦奶牛種質(zhì)資源選育和高效養(yǎng)殖提供遺傳基礎(chǔ)。本次測(cè)試的主要結(jié)果如下:1.CXCL8基因的生物信息學(xué)分析對(duì)CXCL8進(jìn)行奶牛、綿羊、豬、家犬、兔子、人和野馬之間的核苷酸同源性分析,得出奶牛的CXCL8和綿羊、豬之間的同源性在90%以上,說(shuō)明該基因在奶牛,豬,綿羊這三個(gè)物種間有很高的保守性。對(duì)奶牛CXCL8基因編碼的蛋白質(zhì)進(jìn)行結(jié)構(gòu)和功能預(yù)測(cè),結(jié)果表明CXCL8蛋白為親水性蛋白,在細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)有少量存在。2.CXCL8基因遺傳變異檢測(cè)本研究對(duì)CXCL8基因進(jìn)行測(cè)序檢測(cè),最終檢測(cè)到4個(gè)SNPs位點(diǎn)。CXCL8基因的C202T、C264T、A302G和A2471G均位于內(nèi)含子區(qū)。3.CXCL8基因群體遺傳學(xué)分析對(duì)CXCL8基因進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析發(fā)現(xiàn),其中三個(gè)SNP位點(diǎn)C202T、C264T和A302G均處于中度多態(tài),只有A2471G位點(diǎn)為低度多態(tài)。CXCL8基因的C202T、A302G兩個(gè)突變位點(diǎn)均處于Hard-Weinberg平衡(P0.05),C264T、A2471G兩個(gè)突變位點(diǎn)均不處于Hard-Weinberg平衡(P0.05)。4.CXCL8基因與奶牛的生產(chǎn)性狀及乳房炎的關(guān)聯(lián)分析利用SPSS 20.0進(jìn)行最小二乘均值分析表明CXCL8基因A2471G位點(diǎn)與奶牛的乳脂率顯著相關(guān)(P0.05),AG基因型具有較低的乳脂率。中國(guó)荷斯坦奶牛CXCL8基因的生物信息學(xué)分析、多態(tài)位點(diǎn)檢測(cè)及其與產(chǎn)奶性狀和乳房炎的關(guān)聯(lián)分析,為進(jìn)一步研究CXCL8基因的生物學(xué)功能提供了理論依據(jù),為了解其在乳房炎抗性中的作用機(jī)理提供一定的理論基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】：CXCL8 荷斯坦奶牛 乳房炎 SNPs 關(guān)聯(lián)分析
【學(xué)位授予單位】：西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類(lèi)號(hào)】：S823;S858.23
【目錄】：

• 摘要6-8
• ABSTRACT8-12
• 第一章 綜述12-22
• 1.1 奶牛乳房炎12
• 1.2 乳房炎的分類(lèi)12-14
• 1.2.1 隱性乳房炎12-13
• 1.2.2 臨床性乳房炎13
• 1.2.3 慢性乳房炎13-14
• 1.3 SNP概述14-17
• 1.3.1 SNP概念14
• 1.3.2 SNP主要檢測(cè)方法14-17
• 1.4 CXCL8簡(jiǎn)介及研究現(xiàn)狀17-21
• 1.4.1 白介素17-18
• 1.4.2 白介素8及其研究現(xiàn)狀18-21
• 1.5 研究目的及意義21-22
• 第二章 CXCL8基因的生物信息學(xué)分析22-27
• 2.1 材料與方法22-23
• 2.1.1 材料22
• 2.1.2 試驗(yàn)方法22-23
• 2.2 結(jié)果與分析23-26
• 2.2.1 奶牛CXCL8基因序列相似性比較23
• 2.2.2 奶牛CXCL8基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析23-24
• 2.2.3 奶牛CXCL8蛋白理化性質(zhì)分析24-25
• 2.2.4 奶牛CXCL8蛋白的亞細(xì)胞定位25
• 2.2.5 奶牛CXCL8蛋白的結(jié)構(gòu)域分析25-26
• 2.3 小結(jié)26-27
• 第三章 CXCL8基因遺傳變異檢測(cè)及其與乳房炎和產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)分析27-37
• 3.1 試驗(yàn)材料27-28
• 3.1.1 奶牛血樣采集27
• 3.1.2 儀器和設(shè)備27
• 3.1.3 藥品和試劑27-28
• 3.2 試驗(yàn)步驟28-30
• 3.2.1 血樣采集28
• 3.2.2 血樣中DNA的提取28
• 3.2.3. 提取的血樣DNA檢測(cè)28
• 3.2.4 引物的設(shè)計(jì)28-29
• 3.2.5 PCR擴(kuò)增、測(cè)序與酶切，，四引物檢測(cè)29-30
• 3.3 試驗(yàn)結(jié)果30-33
• 3.3.1 CXCL8基因SNP位點(diǎn)檢測(cè)30-32
• 3.3.2 CXCL8基因SNP位點(diǎn)分型32-33
• 3.3.3 CXCL8基因SNP位點(diǎn)分布33
• 3.4 結(jié)果分析33-35
• 3.4.1 CXCL8基因的群體遺傳學(xué)分析33-34
• 3.4.2 CXCL8基因多態(tài)性與產(chǎn)奶性狀、乳房炎的關(guān)聯(lián)分析34-35
• 3.5 CXCL8基因在荷斯坦奶牛分子育種中的應(yīng)用理論35-36
• 3.5.1 荷斯坦奶牛生產(chǎn)性狀相關(guān)的CXCL8基因標(biāo)記理論研究方案35
• 3.5.2 荷斯坦奶牛的本品種選育35-36
• 3.6 討論36
• 3.7 小結(jié)36-37
• 結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)37-38
• 參考文獻(xiàn)38-44
• 附錄44-51
• 致謝51-52
• 作者簡(jiǎn)介52

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 管學(xué)文,陳凱,徐淑紅;中藥“乳炎散”治療慢性乳房炎效果好[J];中國(guó)奶牛;2001年05期

2 張雙德;如何防治母羊乳房炎[J];農(nóng)業(yè)科技與信息;2001年06期

3 李有業(yè);治療乳房炎新型敷貼劑——烏別爾桑[J];獸藥與飼料添加劑;2001年01期

4 張生科;狗乳房炎的治療[J];特種經(jīng)濟(jì)動(dòng)植物;2001年09期

5 王震,王柏生;封閉式治療長(zhǎng)毛兔乳房炎的體會(huì)[J];中國(guó)養(yǎng)兔;2001年05期

6 張國(guó)紅,王永忠;乳炎必治注射液對(duì)母畜乳房炎的療效觀察[J];湖北畜牧獸醫(yī);2002年04期

7 張國(guó)擁;;告訴您一個(gè)治療乳房炎的好方法[J];北方牧業(yè);2003年02期

8 張雙德;母羊乳房炎防治[J];農(nóng)村養(yǎng)殖技術(shù);2004年13期

9 陳昌建;乳房炎的控制與擠奶管理[J];中國(guó)乳業(yè);2005年08期

10 谷魁菊,張影英;中西醫(yī)結(jié)合治療牛慢性乳房炎[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2005年08期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 任改仙;高健;劉修權(quán);史為民;蘇敬良;韓博;;北京牛場(chǎng)不同月份乳房炎發(fā)病變化的調(diào)查[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)2010年學(xué)術(shù)年會(huì)——第二屆中國(guó)獸醫(yī)臨床大會(huì)論文集(上冊(cè))[C];2010年

2 孫莉穎;;犬乳房炎的診治[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)養(yǎng)犬學(xué)分會(huì)第十二次全國(guó)養(yǎng)犬學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2007年

3 羅飛;;牛(隱性)乳房炎四種常見(jiàn)診斷方法的對(duì)比及建議[A];第三屆中國(guó)奶牛發(fā)展大會(huì)論文集[C];2008年

4 李宗方;;集約化牧場(chǎng)乳房炎防控體系的建立[A];第四屆中國(guó)奶業(yè)大會(huì)論文集[C];2013年

5 董和平;張健;;一例犬急性乳房炎的診斷和治療[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)小動(dòng)物醫(yī)學(xué)分會(huì)第四次學(xué)術(shù)研討會(huì)、中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)獸醫(yī)外科學(xué)分會(huì)第十六次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集（2）[C];2009年

6 林藩平;;維生素Ｅ和微量元素硒在營(yíng)養(yǎng)和免疫上的重要作用──二者可用于預(yù)防乳牛乳房炎[A];福建省畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)第七次會(huì)員代表大會(huì)暨學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];1994年

7 韓永麟;;抗菌彈性牛床墊與乳房炎的研究[A];中國(guó)奶業(yè)協(xié)會(huì)年會(huì)論文集2009（下冊(cè)）[C];2009年

8 韓超;;規(guī)模牛場(chǎng)乳房炎防治綜合措施[A];第四屆全國(guó)牛病防制及產(chǎn)業(yè)發(fā)展大會(huì)論文集[C];2012年

9 時(shí)乃林;;奶山羊乳房炎的預(yù)防[A];《2008中國(guó)羊業(yè)進(jìn)展》論文集[C];2008年

10 劉利;許尚忠;李俊雅;高雪;高會(huì)江;;淺談奶牛金黃色葡萄球菌性乳房炎[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)養(yǎng)牛學(xué)分會(huì)2011年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2011年

中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 ;美科學(xué)家發(fā)現(xiàn)綠色治療乳房炎方法[N];中國(guó)畜牧獸醫(yī)報(bào);2006年

2 蘇傳勝;能自愈的乳房炎[N];家庭醫(yī)生報(bào);2007年

3 ;乳房炎的診斷與防治[N];中國(guó)畜牧水產(chǎn)報(bào);2001年

4 王力波;奶牛乳房炎的發(fā)生、分類(lèi)與防治措施[N];中國(guó)畜牧獸醫(yī)報(bào);2006年

5 ;大動(dòng)物乳房炎的介紹與防治[N];中國(guó)畜牧水產(chǎn)報(bào);2000年

6 ;大動(dòng)物乳房炎的介紹與防治（完）[N];中國(guó)畜牧水產(chǎn)報(bào);2000年

7 ;乳康靈奶畜乳房炎的發(fā)生及治療[N];中國(guó)畜牧水產(chǎn)報(bào);2001年

8 陜西省畜牧獸醫(yī)研究所 呂亞軍;畜禽乳房炎與“乳康靈”[N];中國(guó)畜牧報(bào);2002年

9 山東荷斯坦奶牛繁育中心 王海濤 劉曉飛 尉景寶;乳房炎的治療與預(yù)防[N];中國(guó)畜牧報(bào);2004年

10 周巖;淺談臨床乳房炎的防治[N];中國(guó)畜牧獸醫(yī)報(bào);2009年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條

1 許金俊;奶牛γ-干擾素基因的表達(dá)及其在乳房炎防治中的初步應(yīng)用[D];揚(yáng)州大學(xué);2004年

2 劉利;牛外周血單個(gè)核細(xì)胞的免疫研究[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2012年

3 張錦霞;抗菌肽在動(dòng)物乳腺中的表達(dá)及對(duì)乳房炎主要病原菌的抑制效應(yīng)研究[D];吉林大學(xué);2006年

4 陳仁金;中國(guó)荷斯坦牛乳房炎相關(guān)基因遺傳效應(yīng)、IL8和CXCR1基因聚合效應(yīng)及表達(dá)規(guī)律的研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2011年

5 王興平;奶牛TLR4及其信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)基因的克隆、SNPs檢測(cè)與乳房炎的關(guān)聯(lián)分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2007年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 楊春合;奶牛乳區(qū)溫度影響因素及與乳房炎的關(guān)系研究[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年

2 黃龍;奶牛臨床乳房炎源大腸桿菌主要毒力基因的克隆與序列分析[D];寧夏大學(xué);2015年

3 李婧;乳房炎患牛乳腺組織來(lái)源的成纖維細(xì)胞對(duì)正常乳腺上皮細(xì)胞生物學(xué)特性和β-酪蛋白分泌的影響[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年

4 閆川;“隱乳凈”對(duì)奶牛隱性乳房炎治療效果的研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

5 茍麗萍;粒細(xì)胞集落刺激因子水平對(duì)圍產(chǎn)期奶牛乳房炎發(fā)生的影響研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

6 陳富強(qiáng);TLR2、TLR4基因在小尾寒羊乳房炎乳腺組織中表達(dá)的研究[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

7 吳肖肖;荷斯坦奶牛CXCL8基因SNPs檢測(cè)及其與乳房炎和產(chǎn)奶性狀的關(guān)聯(lián)分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年

8 張亞琴;運(yùn)用多座位外顯方差法分析荷斯坦牛候選基因與乳房炎易感性的關(guān)系[D];揚(yáng)州大學(xué);2012年

9 楊慶麗;奶山羊乳房炎的淋巴細(xì)胞與乳腺上皮細(xì)胞凋亡規(guī)律[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年

10 劉莉莉;奶山羊乳房炎的氧化損傷及其機(jī)理[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年

本文編號(hào)：639816