發(fā)布時(shí)間：2017-06-03 08:02

  本文關(guān)鍵詞：雞DGAT2基因組織表達(dá)特性及其SNP、CNV遺傳效應(yīng)分析，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：二脂酰甘油�；D(zhuǎn)移酶(diacylgycerol acyltransferase,DGAT)是一種微粒體酶,主要作用機(jī)制是使二酰甘油加上脂肪酸�；纬扇８视�,目前發(fā)現(xiàn)的編碼該酶的基因有DGAT1和DGAT2。有研究表明,DGAT2對(duì)脂肪代謝和生長(zhǎng)發(fā)育具有重要的作用。本課題組前期通過(guò)a CGH芯片對(duì)5個(gè)本地雞品種的全基因組CNV進(jìn)行了檢測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn):固始雞在1號(hào)染色體193951674-193966948處(CNVR)有拷貝數(shù)的缺失,而DGAT2基因處于這個(gè)CNVR中。本研究的目的是探索DGAT2基因的作用及其遺傳變異(SNP和CNV)對(duì)雞生產(chǎn)性能的影響。熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)了DGAT2基因在固始雞1日齡、6周齡和16周齡的13種不同組織中的表達(dá)情況;以固始雞安卡雞F_2代資源群為研究素材,篩選該基因的SNP,并與資源群的肉質(zhì)性狀、生長(zhǎng)性狀、屠體性狀等經(jīng)濟(jì)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,初步揭示該SNP的變異效應(yīng);驗(yàn)證芯片測(cè)定的DGAT2基因存在拷貝數(shù)是否真實(shí)存在,分析DGAT2基因拷貝數(shù)變異與組織表達(dá)的相關(guān)性,在固始雞安卡雞F_2代資源群體對(duì)DGAT2基因拷貝數(shù)進(jìn)行分型,并與資源群的經(jīng)濟(jì)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,揭示拷貝數(shù)變化所引起的基因劑量效應(yīng)的影響。主要結(jié)果如下:1.組織表達(dá)定量結(jié)果表明,DGAT2基因在固始雞腹脂、皮脂、下丘腦、小腸、脾臟、腎臟等組織都有不同程度的表達(dá)。1日齡時(shí),DGAT2基因在皮脂中表達(dá)最高,其次是小腸和腎。6周齡時(shí),DGAT2基因在腹脂中表達(dá)最高,其次是皮脂。16周齡時(shí),DGAT2基因在腹脂中表達(dá)最高,其次是脾臟和小腸。各個(gè)周齡,在心臟、肝臟、肌肉中的表達(dá)量都比較低。2.DGAT2基因第7外顯子g.13955位置存在一個(gè)同義突變位點(diǎn)(C→T),PCR擴(kuò)增產(chǎn)物被限制性酶TapⅠ酶切消化后顯示出CC、CT和TT三種不同基因型,基因型頻率分別為0.49、0.48和0.03,等位基因C和T的頻率分別為0.73和0.27。關(guān)聯(lián)分析表明:該突變位點(diǎn)對(duì)固始雞×安卡雞F_2代個(gè)體初生重,2、4周齡體重、4、8周齡體尺指標(biāo)及肌內(nèi)脂肪含量在不同基因型之間差異顯著(P0.05),CC基因型多數(shù)性狀值顯著高于TT基因型,對(duì)其他指標(biāo)在統(tǒng)計(jì)學(xué)上無(wú)顯著影響(P0.05)。3.DGAT2基因拷貝數(shù)結(jié)果表明:固始雞拷貝數(shù)顯著低于絲羽烏骨雞、淅川烏骨雞、盧氏綠殼蛋雞、貴妃雞、安卡雞拷貝數(shù)(P0.05),其他五個(gè)品種之間差異不顯著(P0.05),與芯片結(jié)果一致,說(shuō)明DGAT2基因拷貝數(shù)變異是真實(shí)存在的。DGAT2基因在固始雞的拷貝數(shù)和組織表達(dá)的相關(guān)性顯示:DGAT2基因拷貝數(shù)變異與組織表達(dá)呈現(xiàn)不相關(guān)(r=-0.189,P=0.451);DGAT2基因在固始雞-安卡雞F_2代資源群的拷貝數(shù)與經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果顯示:DGAT2基因拷貝數(shù)變異與固始雞安卡雞F_2代資源群4周體重、體斜長(zhǎng)、胸骨長(zhǎng)、胸角和胸深以及12周胸角和胸寬等生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)顯著(P0.05),且2個(gè)拷貝個(gè)體性狀值占優(yōu)勢(shì);與屠體性狀的關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn),其與屠體重顯著關(guān)聯(lián)(P0.05),且2、3和4個(gè)拷貝個(gè)體性狀值顯著高于1個(gè)拷貝;與血液生化指標(biāo)的關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn),其與谷草轉(zhuǎn)氨酶和乳酸脫氫酶關(guān)聯(lián)顯著(P0.05),且4個(gè)拷貝個(gè)體性狀值占優(yōu)勢(shì)。與肌纖維性狀的關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn),其與雞腿肌纖維面積比關(guān)聯(lián)顯著(P0.05),且2和4個(gè)拷貝性狀值顯著高于1個(gè)拷貝;與肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)不顯著。由以上試驗(yàn)結(jié)果,可得出如下結(jié)論:1.雞DGAT2基因在不同階段的脂肪組織高表達(dá),在心臟、肝臟、胸肌和腿肌低表達(dá)。在高表達(dá)的組織中,16周齡的表達(dá)量最高。2.雞DGAT2基因g.13955位置(C→T)突變與初生重,2、4周齡體重、4、8周齡體尺指標(biāo)及肌內(nèi)脂肪含量關(guān)聯(lián)顯著(P0.05),CC基因型多數(shù)性狀值顯著高于TT基因型。3.DGAT2基因存在拷貝數(shù)變異,其拷貝數(shù)變異與固始雞脂肪組織表達(dá)呈現(xiàn)不相關(guān)(r=-0.189,P=0.451),與固始雞安卡雞F_2資源群4周齡的體重、體斜長(zhǎng)、胸骨長(zhǎng)、胸角和胸深,12周齡的胸角和胸寬,屠體重,谷草轉(zhuǎn)氨酶,乳酸脫氫酶,雞腿肌纖維面積關(guān)聯(lián)顯著(P0.05)。
【關(guān)鍵詞】：雞 二脂酰甘油�；D(zhuǎn)移酶2 單核苷酸多態(tài)性 組織表達(dá) 拷貝數(shù)變異
【學(xué)位授予單位】：河南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類(lèi)號(hào)】：S831
【目錄】：

• 致謝4-10
• 摘要10-12
• 1 文獻(xiàn)綜述12-20
• 1.1 DGAT2基因的研究進(jìn)展13-14
• 1.1.1 DGAT2基因13
• 1.1.2 DGAT2對(duì)脂肪代謝的影響13
• 1.1.3 DGAT2對(duì)生長(zhǎng)性狀的影響13-14
• 1.2 DNA分子標(biāo)記14
• 1.3 單核苷酸多態(tài)性研究進(jìn)展14-16
• 1.3.1 SNP特性14
• 1.3.2 SNP的檢測(cè)方法14-15
• 1.3.2.1 聚合酶鏈反應(yīng)一單鏈構(gòu)象多態(tài)性14-15
• 1.3.2.2 直接測(cè)序技術(shù)15
• 1.3.2.3 限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性聚合酶鏈反應(yīng)15
• 1.3.2.4 創(chuàng)造酶切位點(diǎn)15
• 1.3.2.5 DNA芯片15
• 1.3.3 SNP在家禽遺傳育種中的研究進(jìn)展15-16
• 1.4 拷貝數(shù)變異的研究進(jìn)展16-19
• 1.4.1 拷貝數(shù)變異的形成機(jī)制16-17
• 1.4.2 拷貝數(shù)變異的作用機(jī)制17
• 1.4.3 拷貝數(shù)變異的檢測(cè)方法17-18
• 1.4.3.1 aCGH技術(shù)17
• 1.4.3.2 SNP芯片技術(shù)17-18
• 1.4.3.3 二代測(cè)序技術(shù)18
• 1.4.4 拷貝數(shù)變異的劑量效應(yīng)18
• 1.4.4.1 基因劑量效應(yīng)的定義18
• 1.4.4.2 基因劑量效應(yīng)對(duì)表型的影響18
• 1.4.5 拷貝數(shù)變異在家禽中的研究進(jìn)展18-19
• 1.4.6 拷貝數(shù)變異對(duì)家禽表型性狀的影響19
• 1.5 本研究的目的和意義19-20
• 2 引言20-21
• 3 DGAT2基因在固始雞不同發(fā)育時(shí)期的組織表達(dá)特性21-27
• 3.1 試驗(yàn)材料21
• 3.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物及樣品采集21
• 3.1.2 試驗(yàn)主要試劑及配制21
• 3.1.3 試驗(yàn)主要儀器21
• 3.2 試驗(yàn)方法21-23
• 3.2.1 總RNA的提取21-22
• 3.2.2 RNA質(zhì)量檢測(cè)22
• 3.2.3 反轉(zhuǎn)錄22-23
• 3.2.4 熒光定量PCR引物設(shè)計(jì)23
• 3.2.5 熒光定量PCR反應(yīng)23
• 3.2.6 數(shù)據(jù)分析23
• 3.3 結(jié)果分析23-25
• 3.3.1 總RNA質(zhì)量檢測(cè)23-24
• 3.3.2 雞DGAT2基因在固始雞不同發(fā)育時(shí)期的組織表達(dá)特性24-25
• 3.4 討論25-26
• 3.5 小結(jié)26-27
• 4 雞DGAT2基因第7外顯子多態(tài)性與生產(chǎn)性能的關(guān)聯(lián)27-37
• 4.1 試驗(yàn)材料27-28
• 4.1.1 研究群體27
• 4.1.2 測(cè)定指標(biāo)27
• 4.1.3 試驗(yàn)主要試劑及配制27-28
• 4.1.4 試驗(yàn)主要儀器28
• 4.2 試驗(yàn)方法28-30
• 4.2.1 引物合成28-29
• 4.2.2 DGAT2基因擴(kuò)增29
• 4.2.3 酶切反應(yīng)29
• 4.2.4 數(shù)據(jù)處理29-30
• 4.3 結(jié)果與分析30-35
• 4.3.1 雞DGAT2基因突變篩選30
• 4.3.2 雞DGAT2基因突變位點(diǎn)分型30
• 4.3.3 雞DGAT2基因突變位點(diǎn)經(jīng)判型后測(cè)序驗(yàn)證30-31
• 4.3.4 雞DGAT2基因突變位點(diǎn)基因型頻率和基因頻率31
• 4.3.5 雞DGAT2基因型與資源群經(jīng)濟(jì)性狀關(guān)聯(lián)分析31-35
• 4.3.5.1 雞DGAT2基因g.13955C＞T位點(diǎn)與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析31-32
• 4.3.5.2 雞DGAT2基因g.13955C＞T位點(diǎn)與肉質(zhì)、脂肪性狀的關(guān)聯(lián)分析32-33
• 4.3.5.3 雞DGAT2基因g.13955C＞T位點(diǎn)與屠體性狀、肌纖維性狀和血液生化指標(biāo)的關(guān)聯(lián)分析33-35
• 4.4 討論35-36
• 4.5 小結(jié)36-37
• 5 DGAT2基因拷貝數(shù)變異基因劑量效應(yīng)研究37-50
• 5.1 試驗(yàn)材料37
• 5.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物和樣品稀釋37
• 5.1.2 F_2代資源群及測(cè)量指標(biāo)37
• 5.2 試驗(yàn)方法37-39
• 5.2.1 血樣基因組DNA提取與檢測(cè)37-38
• 5.2.2 引物設(shè)計(jì)與合成38
• 5.2.3 Q-PCR反應(yīng)體系與程序38
• 5.2.4 標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作38-39
• 5.2.5 試驗(yàn)數(shù)據(jù)分析39
• 5.3 結(jié)果分析39-47
• 5.3.1 引物標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制39-40
• 5.3.1.1 引物溶解曲線39-40
• 5.3.1.2 引物標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作40
• 5.3.2 不同品種雞在DGAT2位點(diǎn)的相對(duì)拷貝數(shù)40-41
• 5.3.3 DGAT2拷貝數(shù)變異與組織表達(dá)的影響41-42
• 5.3.4 DGAT2基因拷貝數(shù)變異對(duì)固始雞-安卡雞F2代資源群經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析42-47
• 5.3.4.1 DGAT2基因拷貝數(shù)變異對(duì)固始-安卡雞F_2代資源群生長(zhǎng)性狀的影響42-44
• 5.3.4.2 DGAT2基因拷貝數(shù)變異對(duì)固始-安卡雞F_2代資源群屠體性狀的影響44
• 5.3.4.3 DGAT2基因拷貝數(shù)變異對(duì)固始-安卡雞F_2代資源群血液生化指標(biāo)的影響44-45
• 5.3.4.4 DGAT2基因拷貝數(shù)變異對(duì)固始-安卡雞F_2代資源群肉質(zhì)性狀的影響45-46
• 5.3.4.5 DGAT2基因拷貝數(shù)變異對(duì)固始-安卡雞F_2代資源群肌纖維性狀的影響46-47
• 5.4 討論47-49
• 5.4.1 DGAT2基因拷貝數(shù)變異的驗(yàn)證47
• 5.4.2 拷貝數(shù)的分析方法47-48
• 5.4.3 拷貝數(shù)變異與生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析48-49
• 5.5 小結(jié)49-50
• 6 全文總結(jié)50-51
• 參考文獻(xiàn)51-59
• ABSTRACT59-61

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6 張偉溪;楊樹(shù)抗逆轉(zhuǎn)錄因子基因遺傳轉(zhuǎn)化與功能驗(yàn)證[D];中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院;2014年

7 李伍舉;基于基因表達(dá)譜的樣本分型與分類(lèi)研究[D];中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2003年

8 梁欣偉;人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞基因表達(dá)譜分析[D];第一軍醫(yī)大學(xué);2006年

9 藺會(huì)云;一條新的轉(zhuǎn)移相關(guān)基因mag-1的研究[D];中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2006年

10 楊志林;惡性膠質(zhì)瘤相關(guān)新基因的篩選、克隆及其特性研究[D];第一軍醫(yī)大學(xué);2001年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 趙月敏;CMFT體外抑瘤活性及對(duì)腫瘤細(xì)胞基因表達(dá)譜的影響[D];河北大學(xué);2015年

2 江月;家蠶TGF-β家族成員dpp和daw基因的功能研究[D];蘇州大學(xué);2015年

3 弓春玲;Hela細(xì)胞與人子宮內(nèi)膜基質(zhì)細(xì)胞中miRNA Let-7及其靶基因的關(guān)系研究[D];內(nèi)蒙古大學(xué);2015年

4 羅影濤;腺苷酸環(huán)化酶3基因敲除小鼠主要嗅覺(jué)表皮基因表達(dá)譜分析[D];河北大學(xué);2015年

5 甘斌;基于稀疏性理論的腫瘤基因表達(dá)譜分類(lèi)[D];曲阜師范大學(xué);2015年

6 喬玲波;StOSM基因及其耐旱功能研究[D];寧夏大學(xué);2015年

7 趙學(xué)軍;家蠅CCTζ基因的cDNA克隆、表達(dá)及表達(dá)模式研究[D];貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院;2015年

8 文正勇;鱖魚(yú)生長(zhǎng)性狀數(shù)字基因表達(dá)譜分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

9 李曉賓;Fancd2os基因在小鼠不同組織中的表達(dá)譜分析及其真核表達(dá)載體的構(gòu)建與鑒定[D];山西醫(yī)科大學(xué);2015年

10 陳輝;CIK誘導(dǎo)過(guò)程中TCR的表達(dá)變化及靶向TCR的基因編輯研究[D];廣東藥學(xué)院;2015年

  本文關(guān)鍵詞：雞DGAT2基因組織表達(dá)特性及其SNP、CNV遺傳效應(yīng)分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：417578