發(fā)布時間：2025-04-18 00:30

　　家犬(Canis familiaris)的馴化研究一直是遺傳學(xué)研究中的熱點,由于其與人類經(jīng)過上萬年形成的密切關(guān)系,家犬一直備受國內(nèi)外生物學(xué)者的重視。從被馴化開始,家犬從行為、食性、外型等方面表現(xiàn)出了和其祖先灰狼(Canis lupus)較大的差異,品種化過程進一步豐富了家犬的表型。家犬是人類研究家養(yǎng)動物的馴化過程、理解各種表型的遺傳基礎(chǔ)、與人類共同疾病的形成原因、甚至是自身的進化過程的絕佳遺傳學(xué)研究材料。 第一章主要對家犬馴化研究工作進行了介紹,范圍覆蓋了家犬起源、家犬二段式馴化、品種犬豐富的表型及疾病研究。并在現(xiàn)有研究的基礎(chǔ)上提出了兩個本論文要探討及解決的問題。一、我們通過分析家犬在東亞、中東、歐洲地區(qū)的系統(tǒng)地理結(jié)構(gòu),從而研究家犬早期在歐亞地區(qū)的擴散方式；二、近年來,家犬/灰狼重測序數(shù)據(jù)呈增長態(tài)勢。豐富的數(shù)據(jù),給了我們彌補家犬單核苷酸多態(tài)性(SNP)參考集(dbSNP139)缺陷的契機,也對如何合理的組織運用大量的家犬、灰狼重測序數(shù)據(jù)向我們提出了要求,因此,我們構(gòu)建了第一個家犬/灰狼SNP數(shù)據(jù)庫。 第二章主要通過分析品種犬在東亞、中東、歐洲地區(qū)的系統(tǒng)地理結(jié)構(gòu)來探討家犬的擴散問題...

【文章頁數(shù)】：110 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖3.2數(shù)據(jù)比對、SNP檢測流程

(http://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/canFam2/3.fa.gz)去比對數(shù)據(jù)和檢測SNP(圖3.2)。對于第一組樣品，使用了專門根據(jù)SOLiD色彩空間標簽nittps://Droducts.appliedbiosvstems.....

圖3.5DoGSD主界面

圖3.5DoGSD主界面。藍色的工具條中包含了DoGSD的瀏覽、查詢、下載及幫助接口。左下及右上的文字部分介紹了數(shù)據(jù)庫的特點和更新信息。3.3.1瀏覽接口通過數(shù)據(jù)瀏覽接口，用戶可以以文本表格形式瀏覽非冗余參考集和個體樣品數(shù)據(jù)集（圖3.6A),結(jié)果按照不同個體、不同染色體排列；....

圖3夕瀏覽接口中直接瀏覽基因區(qū)域s}.rn.編碼區(qū)域s.rr、同義突變}wr、異義突變sNP的二級接口及同義突變SNI〕瀏覽界面，

考慮到基因區(qū)域的，特別是異義突變的SNP時常是用戶關(guān)注的重點，我們在瀏覽功能中專門針對以上問題，添加了三個二級查詢?nèi)肟冢▓D3.7):基因區(qū)域SNP、編碼區(qū)域SNP、同義突變SNP、異義突變SNP。這樣的二級列表極大地方便了用戶

本文編號：4040234