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毛皮動(dòng)物阿留申病毒TaqMan qPCR檢測(cè)方法的建立及其分子流行病學(xué)調(diào)查

發(fā)布時(shí)間:2025-04-18 06:01
  阿留申病毒歸類(lèi)為細(xì)小病毒科(Parvoviridae)阿留申病毒屬(Amdovirus)的成員,目前有6個(gè)病毒種,包括水貂阿留申病毒(Aleutian mink disease virus,AMDV)、灰狐阿留申病毒(Gray fox amdoparvovirus,GFAV)、貉藍(lán)狐阿留申病毒(Raccoon dog and arctic fox amdoparvovirus,RFAV)、臭鼬阿留申病毒(Skunk amdoparvovirus,SKAV)、赤狐糞阿留申病毒(Red fox fecal amdovirus,RFFAV)和小熊貓阿留申病毒(red panda amdoparvovirus,RpAPV)。為建立通用于多種阿留申病毒的檢測(cè)和定量方法,本研究以6種阿留申病毒的VP2基因?yàn)閰⒖夹蛄?在其保守區(qū)設(shè)計(jì)特異性引物和探針,采用直接堿裂解法獲得病毒DNA,建立TaqMan qPCR方法。結(jié)果表明,AMDV、RFAV檢測(cè)極限分別為4.06×10~1 copies/μl、2.93×10~1 copies/μl,變異系數(shù)小于2%。在74份臨床樣品中,TaqMan qPCR檢測(cè)陽(yáng)性率...

【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1-1VP2和NS1蛋白復(fù)制相關(guān)位點(diǎn)區(qū)段分析

圖1-1VP2和NS1蛋白復(fù)制相關(guān)位點(diǎn)區(qū)段分析

aspase-7在RFAV、RpFAV和RFFAV的活化受阻而不能啟動(dòng)裂解作用,導(dǎo)致子代病毒生成量增加,感染進(jìn)程加快,易感且耐受力低的動(dòng)物出現(xiàn)病癥。而417DLLD↓G421在AMDV中具有高度保守性以保證AMDV在宿主動(dòng)物體內(nèi)呈自限性復(fù)制。但在其它新種阿留申病毒中,該位點(diǎn)可能并....


圖1-2VP2和NS1蛋白致病性位點(diǎn)、抗原區(qū)比對(duì)分析

圖1-2VP2和NS1蛋白致病性位點(diǎn)、抗原區(qū)比對(duì)分析

中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第一章緒論9細(xì)胞表面的FcRIIA結(jié)合促使病毒侵入細(xì)胞,F(xiàn)cRIIA受體可能是阿留申病毒抗體復(fù)合物的受體。小鼠單核細(xì)胞、人單核細(xì)胞、B細(xì)胞、嗜堿性粒細(xì)胞以及網(wǎng)狀內(nèi)皮系統(tǒng)細(xì)胞表面都有FcRII受體,這些細(xì)胞也可能是阿留申病毒感染的靶細(xì)胞(DWORAKeta....


圖3-2阿留申病毒VP2基因核苷酸同源性比較

圖3-2阿留申病毒VP2基因核苷酸同源性比較

中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第三章毛皮獸阿留申病毒分子流行病學(xué)調(diào)查27總體上,阿留申病毒種間NS1蛋白差異性大,VP2蛋白較保守。本實(shí)驗(yàn)室克隆獲得DA-RD7、DA-RD15、ZJ-L3、ZJ-L5、HB-Y4、HB-Y5的VP2蛋白之間氨基酸、核苷酸相似性分別為95.7%<sup....


圖3-3阿留申病毒VP2蛋白氨基酸同源性比較

圖3-3阿留申病毒VP2蛋白氨基酸同源性比較

中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第三章毛皮獸阿留申病毒分子流行病學(xué)調(diào)查27總體上,阿留申病毒種間NS1蛋白差異性大,VP2蛋白較保守。本實(shí)驗(yàn)室克隆獲得DA-RD7、DA-RD15、ZJ-L3、ZJ-L5、HB-Y4、HB-Y5的VP2蛋白之間氨基酸、核苷酸相似性分別為95.7%<sup....



本文編號(hào):4040647

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