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地方品種雞ALV-J的分離鑒定及全基因組序列分析

發(fā)布時(shí)間:2024-10-04 20:41
   為研究揚(yáng)州地方品種蘇禽綠殼蛋雞中禽白血病病毒(ALV)的來(lái)源及其變異趨勢(shì),本研究從揚(yáng)州某規(guī);N雞場(chǎng)病雞中分離到多株病毒,并測(cè)定了1株ALV-J(JS18YZ09)的全基因組序列,對(duì)該全基因組序列進(jìn)行比對(duì)分析,結(jié)果顯示,分離株全基因組序列與2009年江蘇地區(qū)蛋雞分離株JS09GY3同源性最高,為93.7%,但其5'LTR和3'UTR區(qū)變異較大。其env基因則與2013年廣東肉雞分離株GD13GZ同源性最高。JS18YZ09株5'LTR序列含有多至6個(gè)潛在轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)C/EBPalp,同時(shí)U3區(qū)有11 bp的缺失,在其3'UTR的rTM區(qū)存在175 bp的缺失。綜合5'LTR,env和3'UTR區(qū)序列特征,推測(cè)引起本次地方品種蘇禽綠殼蛋種雞禽白血病的ALV-J很可能來(lái)源于江蘇地區(qū)蛋雞分離株JS09GY3,但其可能已經(jīng)與廣東地區(qū)株GD13GZ株發(fā)生了重組,且有新的變異趨勢(shì)。本實(shí)驗(yàn)對(duì)蘇禽綠殼蛋雞ALV分子流行病學(xué)的分析研究豐富了ALV的生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)。

【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 主要實(shí)驗(yàn)材料
    1.2 病毒分離與檢測(cè)
    1.3 引物設(shè)計(jì)及合成
    1.4 病毒亞群鑒定與測(cè)序
    1.5 全基因組序列分析
2 結(jié)果
    2.1 病毒分離鑒定結(jié)果
    2.2 ALV-J分離株全基因組分析
    2.3 ALV-J分離株5'LTR基因序列分析
    2.4 ALV-J分離株env基因序列分析
    2.5 ALV-J分離株3'UTR基因序列分析
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本文編號(hào):4007126

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