沙波病毒(Sapovirus, SaV)又名札幌病毒、札如病毒,是一種重要的腸道病原體,能夠引起人和動(dòng)物非細(xì)菌性急性胃腸炎,主要以糞便-口腔途徑傳播。它能夠感染人和豬、牛、狗、蝙蝠與貂等多種動(dòng)物,宿主譜寬。豬沙波病毒(porcine Sapovirus,PoSaV)分布廣泛,在發(fā)達(dá)國(guó)家和發(fā)展中國(guó)家的豬群中普遍存在,主要導(dǎo)致仔豬腹瀉,甚至在一些無(wú)癥狀豬群中也可檢出PoSaV,因此研究PoSaV的基因組特征和遺傳變異對(duì)于預(yù)防該病及食品衛(wèi)生具有重要作用。 本研究中我們?cè)O(shè)計(jì)了10組特異性引物,應(yīng)用one-step RT-PCR方法以西北分離株P(guān)oSaVCH430病毒RNA為模板進(jìn)行擴(kuò)增,獲得了PoSaV CH430株全基因組序列,這是中國(guó)西北地區(qū)首株被全基因組測(cè)序的PoSaV。除去30個(gè)堿基的poly(A)尾,PoSaV CH430株基因組RNA長(zhǎng)7342nt,包括5’-UTR、2個(gè)ORFs和3’-UTR=PoSaV CH430株序列以三核苷酸GTG開始,在基因組和亞基因組的5’端(GTGA/TTCGTGATGGC/AT/G)存在有保守序列Kozak元件(下劃線標(biāo)注序列)。5’-UTR有9個(gè)堿...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖1.1杯狀病毒負(fù)染電鏡圖片A和B為豬沙波病毒；C為諾瓦克病毒：白色標(biāo)準(zhǔn)線為50nmFig.1.1TheElectronmicrographpicturesofCaliciviruses.PorcineSapoviruswasshowedinAandB,Norwalk

NoV)(Kapikianetal.,1972)?電鏡下病毒粒子呈圓形，表面粗糙，內(nèi)徑約為27nm,外徑為32nm，如圖1.1C。免疫電鏡技術(shù)作為一種病毒鑒定的標(biāo)準(zhǔn)方法，成功鑒定了多種腸道病毒，也為SaV的發(fā)現(xiàn)提供了實(shí)驗(yàn)條件。1977年10月，日本札幌市一幼兒園爆發(fā)急性感....

圖2.1CH430株全基因組PCR擴(kuò)増

圖2.1CH430株全基因組PCR擴(kuò)増。Ml:500bpDNA分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)；M2:5000bpDNA分子；1-10:基因組増10個(gè)片段Fig.2.1PCRamplificationofthefull-lengthgenomeofCH430.Ml:DL500....

圖2.2S1-S〗0重組質(zhì)粒的鑒定

圖2.2S1-S〗0重組質(zhì)粒的鑒定。M:5000bpDNA分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)；Ml:500DNA分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)；丨：S1片段重組質(zhì)粒PCR鑒定；2-10:S2-S10片段酶切產(chǎn)物Fig.2.2IdentificationrecombinantplasmidofSIt....

圖2.7根據(jù)沙波病毒屬成員VPl氨基酸序列構(gòu)建的進(jìn)化樹

用生物學(xué)軟件MEGA5.0鄰接法與最大相似性法構(gòu)建進(jìn)化樹，因?yàn)榻Y(jié)果相同，所以只顯示利用鄰接法構(gòu)建的進(jìn)化樹（圖2.7)。IAAB60927-Sapporo'i >goAAQ17061-Mcii4IGIHumanS3 ICAA60262-Manchesterj....

本文編號(hào)：3976271