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中國地方山羊品種群體遺傳結(jié)構(gòu)和選擇信號分析

發(fā)布時間:2024-02-04 05:07
  我國山羊品種資源豐富,特征明顯,具有高繁、抗逆、耐粗飼等特性。山羊遺傳資源的保護和開發(fā)利用,是我國羊產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要基礎(chǔ)。但是隨著近年來畜牧業(yè)飛速發(fā)展以及外來優(yōu)良品種的大量引進,地方山羊的遺傳多樣性和種質(zhì)特性受到一定的威脅,因此研究我國山羊品種的種群歷史、群體結(jié)構(gòu)、遺傳多樣性和基因組選擇痕跡,可以摸清我國山羊遺傳資源家底,為優(yōu)良山羊品種的保護和利用提供理論依據(jù)。因此本論文利用Illumina山羊SNP 50K Beadchip對我國14個山羊品種和2個野生山羊種群共計240個個體進行了遺傳多樣性、群體遺傳結(jié)構(gòu)和基因組選擇痕跡分析,并根據(jù)此結(jié)果提出了我國山羊遺傳資源保護的相關(guān)對策,獲得相關(guān)結(jié)果如下:(1)遺傳多樣性分析發(fā)現(xiàn)戴云山羊的近交系數(shù)最高,雜合度最低;而新疆山羊的近交系數(shù)最低,雜合度最高,說明戴云山羊品種內(nèi)存在著一定程度的近交,遺傳多樣性不豐富。利用主成分分析(PCA)、STRUCTURE、NETVIEW和鄰接(NJ)樹分析群體遺傳結(jié)構(gòu),結(jié)果表明我國地方山羊品種可以劃分為三個類群:北方群體、西南群體和南方群體;野生巖羊和北山羊則與北方群體的聚類關(guān)系更近;群體遺傳結(jié)構(gòu)分析還顯示成都麻羊...

【文章頁數(shù)】:45 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1中國14個地方山羊品種和野生巖羊、北山羊地理分布

圖2-1中國14個地方山羊品種和野生巖羊、北山羊地理分布

圖2-1中國14個地方山羊品種和野生巖羊、北山羊地理分布Figure2-1Distributionof14Chineseindigenousgoatbreeds,C.aegagrusandC.ibex2.2.3基因分型與質(zhì)量控制2.2.3.1....


圖2-2PCA分析結(jié)果

圖2-2PCA分析結(jié)果

州大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文中國地方山羊品種群體遺傳結(jié)構(gòu)和選擇信號分析


圖2-3中國14個地方山羊品種的最大似然法進化樹

圖2-3中國14個地方山羊品種的最大似然法進化樹

圖2-2PCA分析結(jié)果Figure2-2TheresultofthePCAanalysis


圖2-4K=2-8STRUCTURE結(jié)果

圖2-4K=2-8STRUCTURE結(jié)果

蘭州大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文中國地方山羊品種群體遺傳結(jié)構(gòu)和選擇信號分析如圖2-4所示的結(jié)果,當(dāng)K=2時野羊種群Y和B其他品種明顯分開?梢钥闯霎(dāng)K值增加時,部分山羊品種從大的聚類中分離了出來,當(dāng)K=3時,LZS、DYS有著比較明顯的分離,同時MTS、....



本文編號:3895262

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