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中國地方山羊品種群體遺傳結構和選擇信號分析

發(fā)布時間:2024-02-04 05:07
  我國山羊品種資源豐富,特征明顯,具有高繁、抗逆、耐粗飼等特性。山羊遺傳資源的保護和開發(fā)利用,是我國羊產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要基礎。但是隨著近年來畜牧業(yè)飛速發(fā)展以及外來優(yōu)良品種的大量引進,地方山羊的遺傳多樣性和種質特性受到一定的威脅,因此研究我國山羊品種的種群歷史、群體結構、遺傳多樣性和基因組選擇痕跡,可以摸清我國山羊遺傳資源家底,為優(yōu)良山羊品種的保護和利用提供理論依據(jù)。因此本論文利用Illumina山羊SNP 50K Beadchip對我國14個山羊品種和2個野生山羊種群共計240個個體進行了遺傳多樣性、群體遺傳結構和基因組選擇痕跡分析,并根據(jù)此結果提出了我國山羊遺傳資源保護的相關對策,獲得相關結果如下:(1)遺傳多樣性分析發(fā)現(xiàn)戴云山羊的近交系數(shù)最高,雜合度最低;而新疆山羊的近交系數(shù)最低,雜合度最高,說明戴云山羊品種內存在著一定程度的近交,遺傳多樣性不豐富。利用主成分分析(PCA)、STRUCTURE、NETVIEW和鄰接(NJ)樹分析群體遺傳結構,結果表明我國地方山羊品種可以劃分為三個類群:北方群體、西南群體和南方群體;野生巖羊和北山羊則與北方群體的聚類關系更近;群體遺傳結構分析還顯示成都麻羊...

【文章頁數(shù)】:45 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1中國14個地方山羊品種和野生巖羊、北山羊地理分布

圖2-1中國14個地方山羊品種和野生巖羊、北山羊地理分布

圖2-1中國14個地方山羊品種和野生巖羊、北山羊地理分布Figure2-1Distributionof14Chineseindigenousgoatbreeds,C.aegagrusandC.ibex2.2.3基因分型與質量控制2.2.3.1....


圖2-2PCA分析結果

圖2-2PCA分析結果

州大學碩士研究生學位論文中國地方山羊品種群體遺傳結構和選擇信號分析


圖2-3中國14個地方山羊品種的最大似然法進化樹

圖2-3中國14個地方山羊品種的最大似然法進化樹

圖2-2PCA分析結果Figure2-2TheresultofthePCAanalysis


圖2-4K=2-8STRUCTURE結果

圖2-4K=2-8STRUCTURE結果

蘭州大學碩士研究生學位論文中國地方山羊品種群體遺傳結構和選擇信號分析如圖2-4所示的結果,當K=2時野羊種群Y和B其他品種明顯分開?梢钥闯霎擪值增加時,部分山羊品種從大的聚類中分離了出來,當K=3時,LZS、DYS有著比較明顯的分離,同時MTS、....



本文編號:3895262

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