發(fā)布時(shí)間：2022-12-03 20:10

　　基因組上的遺傳變異是研究動(dòng)物表型性狀差異的重要基礎(chǔ)。目前，在牛上已有多個(gè)品種的全基因組變異信息被公布，并且通過(guò)生物信息學(xué)分析，預(yù)測(cè)出了很多與家畜肌肉生長(zhǎng)、脂肪代謝、繁殖力和抗病性等數(shù)量性狀相關(guān)的位點(diǎn)。然而，中國(guó)黃牛的全基因組變異研究尚未見(jiàn)報(bào)道。關(guān)于全基因組變異檢測(cè)的方法主要有SNP（Single nucleotidepolymorphism）芯片、CGH（Comparative genomic hybridization）芯片和高通量測(cè)序等，其中，高通量測(cè)序技術(shù)能夠全面、準(zhǔn)確的獲取基因組上的全部遺傳信息，因而應(yīng)用較為廣泛。本研究采用測(cè)序技術(shù)系統(tǒng)檢測(cè)了2個(gè)中國(guó)地方黃牛品種（南陽(yáng)牛和秦川牛）的基因組變異，并比較分析兩個(gè)品種間、中國(guó)地方黃牛與國(guó)外牛品種基因組DNA上的差異。同時(shí)，研究拷貝數(shù)變異（Copy number variation, CNV）對(duì)功能基因的表達(dá)及相關(guān)性狀的影響，最后，深入分析了牛配對(duì)盒7（Paired box7, Pax7）基因啟動(dòng)子區(qū)的一處短片段拷貝變異對(duì)啟動(dòng)子活性、基因表達(dá)和表型性狀所產(chǎn)生的劑量效應(yīng)。本研究主要取得了如下結(jié)果： 1.黃牛全基因組變異檢測(cè)及分析 ... 

【文章頁(yè)數(shù)】：146 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

能夠引起轉(zhuǎn)錄水平變化的基因組變異類型(HaraksinghandSnyder2013)

每兆堿基對(duì)（Mbp）序列測(cè)序所需成本變化(Delsenyetal.2010)

拷貝數(shù)變異的不同類型Figure1-3Differenttypesofcopynumbervariations此外，研究表明，CNVs在基因組中的分布也是有一定規(guī)律的，Hou等(2011)研究

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Identification and expression analysis of mical family genes in zebrafish[J]. Chikin Kuok.  遺傳學(xué)報(bào). 2010(10)
[2]秦川牛選育工作的過(guò)去、現(xiàn)在和未來(lái)[J]. 邱懷.  黃牛雜志. 1999(01)
[3]建國(guó)以來(lái)我國(guó)養(yǎng)牛業(yè)發(fā)展概況[J]. 邱懷.  西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 1984(03)



本文編號(hào)：3706892