發(fā)布時間：2017-04-18 13:14

  本文關鍵詞：FSHβ基因區(qū)域多態(tài)性與臺灣褐色菜鴨生產性狀關聯(lián)研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：本實驗以臺灣褐色菜鴨為試驗材料,通過PCR-SSCP和測序技術對臺灣褐色菜FSHβ基因進行SNP檢測同時分析其多態(tài)性與各性狀的關聯(lián)；通過實時熒光定量PCR技術,通過使用2-△△ct換算法對FFSHβ基因拷貝數(shù)進行定量,并分析其多態(tài)性與生產性能的關聯(lián)。(1)在臺灣褐色菜鴨FSHβ基因擴增序列的第106bp、第266bp和第267bp位點發(fā)現(xiàn)堿基替換(分別為A106C.C266T和A267G),并產生了HH、Hh和hh三種基因型,其中HH型為野生型,共有7個個體,Hh型共有46個個體,hh型共有41個個體；h等位基因頻率是0.6809,H等位基因頻率是0.3191；該基因座位的雜合度為0.4346；其多態(tài)信息含量為0.3401；FSHβ基因多態(tài)位點經χ2適應性檢驗表明處于平衡狀態(tài)。經關聯(lián)發(fā)現(xiàn),基因型Hh和基因型hh的個體的四周齡體重均顯著低于基因型HH的個體(P0.05)；基因型Hh和基因型hh的個體的蛋重均顯著高于基因型HH的個體(P0.05)；基因型Hh的個體蛋殼厚度極顯著低于基因型HH的個體(P0.01),同時基因型hh的個體也顯著低于基因型HH的個體(P0.05)。(2)將FFSHβ-F/FSHβ-R和|Anpl-DRA-F-F/Anpl-DRA-兩對引物進行定量PCR的擴增,應用熒光定量PCR儀自帶系統(tǒng),繪制標準曲線。FSHβ基因引物的曲線相關系數(shù)R2=0.996,擴增效率E=108.337%,斜率為-3.137；Anpl-DRA基因引物的曲線相關系數(shù)R2=0.990,擴增效率E=106.068%,斜率為-3.185。其中斜率差為0.048,擴增效率差為2.269%。(3)本試驗利用熒光定量PCR技術檢測鴨FSHβ基因拷貝數(shù)變異情況,共檢測五種變異類型,個體數(shù)分別為42、26、15、7、4。關聯(lián)分析顯示,臺灣褐色菜鴨FSHβ基因CNVs位點的五種拷貝數(shù)變異與其蛋殼厚度和蛋白高度均存在顯著相關(P0.05),在蛋殼厚度中五種拷貝數(shù)變異存在兩兩顯著差異,其中拷貝數(shù)為1的個體蛋殼厚度極顯著高于拷貝數(shù)為2的個體；拷貝數(shù)為Ⅳ的個體蛋白高度明顯低于拷貝數(shù)為Ⅰ、Ⅱ、和Ⅲ的個體；其余性各狀間均無顯著相關(P0.05)。
【關鍵詞】：SNP 拷貝數(shù) 多態(tài)性 FSHβ 鴨
【學位授予單位】：福建農林大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：S834
【目錄】：

• 摘要7-8
• Abstract8-10
• 第一章 文獻綜述10-20
• 1. DNA分子遺傳標記10
• 2. 單核苷酸多態(tài)性的研究進展10-14
• 2.1 單核苷酸多態(tài)性標記10-11
• 2.2 單核苷酸多態(tài)性檢測方法11-13
• 2.3 SNP在畜禽中的應用13-14
• 3 拷貝數(shù)變異的研究進展14-18
• 3.1 拷貝數(shù)變異的檢測方法14-16
• 3.2 CNVs在畜禽中的研究16-18
• 4 促卵泡素β亞基基因18-19
• 5 本研究的意義與目的19-20
• 第二章 FSHβ基因SNPs與鴨性狀關聯(lián)分析20-32
• 1 實驗材料20-21
• 1.1 實驗動物與性狀測定20
• 1.2 試驗所需儀器與設備20
• 1.3 主要試劑藥品及來源20
• 1.4 常用主要試劑20-21
• 2 試驗方法21-26
• 2.1 鴨基因組DNA提取21
• 2.2 基因組DNA的濃度及純度的檢測21
• 2.3 瓊脂糖凝膠電泳檢測21-22
• 2.4 引物的設計合成22
• 2.5 PCR擴增及檢測22-23
• 2.6 PCR-SSCP操作步驟23
• 2.7 銀染過程23-24
• 2.8 數(shù)據統(tǒng)計及性狀關聯(lián)分析24-26
• 3. 結果與分析26-30
• 3.1 基因組DNA提取26
• 3.2 FSHβ基因多態(tài)性檢測26-30
• 4 討論30-32
• 第三章 FSHβ基因拷貝數(shù)變異與各性狀關聯(lián)分析32-44
• 1 實驗材料32
• 1.1 實驗動物與性狀測定32
• 1.2 試驗所需儀器與設備32
• 1.3 主要試劑藥品及來源32
• 2. 試驗方法32-37
• 2.1 鴨基因組DNA提取32
• 2.2 基因組DNA的濃度及純度的檢測32
• 2.3 引物的設計與合成32-33
• 2.4 PCR擴增及檢測33
• 2.5 標準品的構建33-34
• 2.6 建立標準曲線34-36
• 2.7 FSHβ基因拷貝數(shù)檢測36
• 2.8 FSHβ基因CNVs與生產性能相關性分析36-37
• 3. 結果與分析37-42
• 3.1 FSHβ基因和Anpl-DRA基因引物擴增檢測37
• 3.2 重組質粒的檢測37-38
• 3.3 引物標準曲線的繪制38-40
• 3.4 FSHβ基因拷貝數(shù)的檢測40-42
• 4 討論42-44
• 全文結論44-45
• 參考文獻45-52
• 附表52-54
• 致謝54

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據庫 前10條

1 楊海兵;龍國榮;徐龍鑫;嚴毅;何光中;;貴州黃牛ANGPTL4基因PCR-RFLP多態(tài)性檢測[J];貴州畜牧獸醫(yī);2015年04期

2 王利紅;袁旭紅;魏萍萍;張瑞;王維;李丹;林偉;;蘇姜豬Lrh-1基因PCR-SSCP多態(tài)性及其與產仔數(shù)的關系[J];江蘇農業(yè)科學;2015年05期

3 孫海森;劉勝軍;李建磊;蔣再慧;崔廣佳;孫超;潘增濤;張瑩;;FSHβ基因與公鵝精液品質性狀的關聯(lián)分析[J];黑龍江八一農墾大學學報;2015年01期

4 王亞男;王金玉;張跟喜;薛倩;唐瑩;魏岳;施會強;;FSHβ基因多態(tài)性與京海黃雞生產性能的遺傳相關研究[J];中國畜牧雜志;2015年03期

5 管玲玉;馬力鵬;劉麗娟;魯慧文;翟騰蛟;徐夢思;黃濤;;FSH-β和ESR基因多態(tài)性對大白豬產活仔數(shù)的影響[J];豬業(yè)科學;2015年01期

6 麻艷超;郭振清;周麗艷;陳普;陸鳴;東方陽;王建設;;SNP的檢測方法及其在農作物遺傳育種中的應用[J];河北科技師范學院學報;2014年03期

7 李新建;韓雪蕾;郜軍偉;李改英;任廣志;;ADAMTS1基因單核苷酸多態(tài)性與豬繁殖性狀間關聯(lián)分析[J];養(yǎng)豬;2014年04期

8 趙聘;李建柱;曲哲會;唐雪峰;趙云煥;郭曉秋;劉紀成;;淮南麻鴨IGF-Ⅰ基因單核苷酸多態(tài)性及其與生長性能關系研究[J];信陽農業(yè)高等�？茖W校學報;2014年02期

9 龍熙;邱小田;陳磊;王金勇;李學偉;;榮昌豬雜交群體基因組拷貝數(shù)變異鑒定與分析[J];畜牧獸醫(yī)學報;2014年04期

10 張越;麻雅嬌;王繼英;屈云龍;王金勇;丁向東;;豬溶菌酶基因單核苷酸多態(tài)性檢測及與溶菌酶濃度的關聯(lián)分析[J];中國畜牧雜志;2014年07期

中國博士學位論文全文數(shù)據庫 前1條

1 易國強;利用二代測序挖掘雞拷貝數(shù)變異及影響飼料效率的候選基因[D];中國農業(yè)大學;2015年

中國碩士學位論文全文數(shù)據庫 前2條

1 李江曼;寧都黃雞FSH β和PRL基因多態(tài)性與產蛋性能的關聯(lián)性分析[D];江西農業(yè)大學;2013年

2 王青娟;文昌肌促卵泡素β亞基基因的單鏈核苷酸多態(tài)性及其與產蛋性能的相關性研究[D];山東農業(yè)大學;2012年

  本文關鍵詞：FSHβ基因區(qū)域多態(tài)性與臺灣褐色菜鴨生產性狀關聯(lián)研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：314956