本文關(guān)鍵詞：FSHβ基因區(qū)域多態(tài)性與臺(tái)灣褐色菜鴨生產(chǎn)性狀關(guān)聯(lián)研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：本實(shí)驗(yàn)以臺(tái)灣褐色菜鴨為試驗(yàn)材料,通過(guò)PCR-SSCP和測(cè)序技術(shù)對(duì)臺(tái)灣褐色菜FSHβ基因進(jìn)行SNP檢測(cè)同時(shí)分析其多態(tài)性與各性狀的關(guān)聯(lián)；通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),通過(guò)使用2-△△ct換算法對(duì)FFSHβ基因拷貝數(shù)進(jìn)行定量,并分析其多態(tài)性與生產(chǎn)性能的關(guān)聯(lián)。(1)在臺(tái)灣褐色菜鴨FSHβ基因擴(kuò)增序列的第106bp、第266bp和第267bp位點(diǎn)發(fā)現(xiàn)堿基替換(分別為A106C.C266T和A267G),并產(chǎn)生了HH、Hh和hh三種基因型,其中HH型為野生型,共有7個(gè)個(gè)體,Hh型共有46個(gè)個(gè)體,hh型共有41個(gè)個(gè)體；h等位基因頻率是0.6809,H等位基因頻率是0.3191；該基因座位的雜合度為0.4346；其多態(tài)信息含量為0.3401；FSHβ基因多態(tài)位點(diǎn)經(jīng)χ2適應(yīng)性檢驗(yàn)表明處于平衡狀態(tài)。經(jīng)關(guān)聯(lián)發(fā)現(xiàn),基因型Hh和基因型hh的個(gè)體的四周齡體重均顯著低于基因型HH的個(gè)體(P0.05)；基因型Hh和基因型hh的個(gè)體的蛋重均顯著高于基因型HH的個(gè)體(P0.05)；基因型Hh的個(gè)體蛋殼厚度極顯著低于基因型HH的個(gè)體(P0.01),同時(shí)基因型hh的個(gè)體也顯著低于基因型HH的個(gè)體(P0.05)。(2)將FFSHβ-F/FSHβ-R和|Anpl-DRA-F-F/Anpl-DRA-兩對(duì)引物進(jìn)行定量PCR的擴(kuò)增,應(yīng)用熒光定量PCR儀自帶系統(tǒng),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)。FSHβ基因引物的曲線(xiàn)相關(guān)系數(shù)R2=0.996,擴(kuò)增效率E=108.337%,斜率為-3.137；Anpl-DRA基因引物的曲線(xiàn)相關(guān)系數(shù)R2=0.990,擴(kuò)增效率E=106.068%,斜率為-3.185。其中斜率差為0.048,擴(kuò)增效率差為2.269%。(3)本試驗(yàn)利用熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)鴨FSHβ基因拷貝數(shù)變異情況,共檢測(cè)五種變異類(lèi)型,個(gè)體數(shù)分別為42、26、15、7、4。關(guān)聯(lián)分析顯示,臺(tái)灣褐色菜鴨FSHβ基因CNVs位點(diǎn)的五種拷貝數(shù)變異與其蛋殼厚度和蛋白高度均存在顯著相關(guān)(P0.05),在蛋殼厚度中五種拷貝數(shù)變異存在兩兩顯著差異,其中拷貝數(shù)為1的個(gè)體蛋殼厚度極顯著高于拷貝數(shù)為2的個(gè)體；拷貝數(shù)為Ⅳ的個(gè)體蛋白高度明顯低于拷貝數(shù)為Ⅰ、Ⅱ、和Ⅲ的個(gè)體；其余性各狀間均無(wú)顯著相關(guān)(P0.05)。
【關(guān)鍵詞】：SNP 拷貝數(shù) 多態(tài)性 FSHβ 鴨
【學(xué)位授予單位】：福建農(nóng)林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類(lèi)號(hào)】：S834
【目錄】：

• 摘要7-8
• Abstract8-10
• 第一章 文獻(xiàn)綜述10-20
• 1. DNA分子遺傳標(biāo)記10
• 2. 單核苷酸多態(tài)性的研究進(jìn)展10-14
• 2.1 單核苷酸多態(tài)性標(biāo)記10-11
• 2.2 單核苷酸多態(tài)性檢測(cè)方法11-13
• 2.3 SNP在畜禽中的應(yīng)用13-14
• 3 拷貝數(shù)變異的研究進(jìn)展14-18
• 3.1 拷貝數(shù)變異的檢測(cè)方法14-16
• 3.2 CNVs在畜禽中的研究16-18
• 4 促卵泡素β亞基基因18-19
• 5 本研究的意義與目的19-20
• 第二章 FSHβ基因SNPs與鴨性狀關(guān)聯(lián)分析20-32
• 1 實(shí)驗(yàn)材料20-21
• 1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物與性狀測(cè)定20
• 1.2 試驗(yàn)所需儀器與設(shè)備20
• 1.3 主要試劑藥品及來(lái)源20
• 1.4 常用主要試劑20-21
• 2 試驗(yàn)方法21-26
• 2.1 鴨基因組DNA提取21
• 2.2 基因組DNA的濃度及純度的檢測(cè)21
• 2.3 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)21-22
• 2.4 引物的設(shè)計(jì)合成22
• 2.5 PCR擴(kuò)增及檢測(cè)22-23
• 2.6 PCR-SSCP操作步驟23
• 2.7 銀染過(guò)程23-24
• 2.8 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)及性狀關(guān)聯(lián)分析24-26
• 3. 結(jié)果與分析26-30
• 3.1 基因組DNA提取26
• 3.2 FSHβ基因多態(tài)性檢測(cè)26-30
• 4 討論30-32
• 第三章 FSHβ基因拷貝數(shù)變異與各性狀關(guān)聯(lián)分析32-44
• 1 實(shí)驗(yàn)材料32
• 1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物與性狀測(cè)定32
• 1.2 試驗(yàn)所需儀器與設(shè)備32
• 1.3 主要試劑藥品及來(lái)源32
• 2. 試驗(yàn)方法32-37
• 2.1 鴨基因組DNA提取32
• 2.2 基因組DNA的濃度及純度的檢測(cè)32
• 2.3 引物的設(shè)計(jì)與合成32-33
• 2.4 PCR擴(kuò)增及檢測(cè)33
• 2.5 標(biāo)準(zhǔn)品的構(gòu)建33-34
• 2.6 建立標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)34-36
• 2.7 FSHβ基因拷貝數(shù)檢測(cè)36
• 2.8 FSHβ基因CNVs與生產(chǎn)性能相關(guān)性分析36-37
• 3. 結(jié)果與分析37-42
• 3.1 FSHβ基因和Anpl-DRA基因引物擴(kuò)增檢測(cè)37
• 3.2 重組質(zhì)粒的檢測(cè)37-38
• 3.3 引物標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)的繪制38-40
• 3.4 FSHβ基因拷貝數(shù)的檢測(cè)40-42
• 4 討論42-44
• 全文結(jié)論44-45
• 參考文獻(xiàn)45-52
• 附表52-54
• 致謝54

【參考文獻(xiàn)】

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  本文關(guān)鍵詞：FSHβ基因區(qū)域多態(tài)性與臺(tái)灣褐色菜鴨生產(chǎn)性狀關(guān)聯(lián)研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：314956