發(fā)布時(shí)間：2017-04-18 07:30

  本文關(guān)鍵詞：鄱陽湖地區(qū)鴨禽流感病毒分子流行病學(xué)解析與耐藥性初探，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：江西鄱陽湖是主要的候鳥棲息地是東亞-澳大利亞候鳥遷徙路線的必經(jīng)之地,這給周邊散養(yǎng)家禽和候鳥之間的接觸創(chuàng)造了條件,增加了禽流感病毒在野鳥和家禽之間的傳播幾率。本研究選取鄱陽湖周邊7個縣區(qū)的養(yǎng)殖戶進(jìn)行入戶采樣和調(diào)查,通過研究了解禽流感各亞型在家鴨中的流行情況,并對其進(jìn)行基因進(jìn)化和分子特征分析,了解其基因進(jìn)化情況及耐藥風(fēng)險(xiǎn)。2014年在江西鄱陽湖周邊七個區(qū)縣的戶家鴨養(yǎng)殖場采集糞便和水樣等環(huán)境樣本共計(jì)3467份,將采集的樣本使用無特定病原體(SPF)雞胚進(jìn)行病毒分離,使用紅細(xì)胞凝集試驗(yàn)進(jìn)行初篩,再使用熒光實(shí)時(shí)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(Real-time PCR)方法確定甲型流感病毒,隨后進(jìn)行二代測序?qū)嶒?yàn),得到全基因組序列后進(jìn)行分子進(jìn)化和耐藥位點(diǎn)分析。所有采集的環(huán)境樣本,血凝陽性率為3.18%(109/3425),血凝陽性標(biāo)本中甲型流感核酸陽性率為44.95%(49/109),49份標(biāo)本中分離到了禽流感病毒,其中H10N3亞型2株,H11N3亞型2株,H12N5亞型2株,H3N2亞型5株,H3N3亞型2株,H3N6亞型8株,H3N8亞型5株,H4N6亞型8株,H5N6亞型3株,H6N1亞型1株,H6N6亞型4株,H7N7亞型3株,混型4株。3株H5N6毒株,HA基因?qū)儆赾lade2.3.4.4分支,其6個內(nèi)部片段均來源于H5N6亞型。耐藥位點(diǎn)分析結(jié)果顯示,金剛烷胺類和神經(jīng)氨酸酶抑制劑均敏感。鄱陽湖地區(qū)飼養(yǎng)的家禽中流行共監(jiān)測到H10N3, H11N3, H12N5, H3N2, H3N3, H3N6, H3N8, H4N6, H5N6, H6N1, H6N6, H7N7,混型等亞型流行,其中H5N6存在感染人的風(fēng)險(xiǎn)。
【關(guān)鍵詞】：禽流感病毒 鄱陽湖 家鴨 基因進(jìn)化 耐藥
【學(xué)位授予單位】：北京農(nóng)學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S858.32
【目錄】：

• 摘要4-5
• Abstract5-6
• 縮略詞表6-9
• 1. 引言9-12
• 1.1 研究的目的和意義9-10
• 1.2 國內(nèi)外的研究現(xiàn)狀10-12
• 2. 研究內(nèi)容和方法12-14
• 2.1 研究對象12
• 2.2 現(xiàn)場調(diào)查與標(biāo)本采集12
• 2.3 標(biāo)本的運(yùn)輸和處理12-13
• 2.4 實(shí)驗(yàn)室檢測13
• 2.5 結(jié)果分析13
• 2.6 質(zhì)量控制13-14
• 3. 材料和方法14-28
• 3.1 材料14-18
• 3.1.1 調(diào)查登記表14
• 3.1.2 環(huán)境樣本采樣14
• 3.1.3 病毒分離14-15
• 3.1.4 核酸提取15
• 3.1.5 實(shí)時(shí)熒光定量鑒定15-16
• 3.1.6 一步法反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(One-step RT-PCR)16
• 3.1.7 凝膠電泳及純化16
• 3.1.8 產(chǎn)物定量及全基因組序列測定16-17
• 3.1.9 個人防護(hù)17-18
• 3.2 方法18-28
• 3.2.1 現(xiàn)場樣本采集18
• 3.2.2 病原學(xué)檢測18-22
• 3.2.3 全基因序列測定22-27
• 3.2.4 數(shù)據(jù)和序列分析27-28
• 4. 結(jié)果28-57
• 4.1 標(biāo)本采集情況28-29
• 4.2 血凝檢測結(jié)果29-31
• 4.3 A型禽流感核酸檢測結(jié)果31-33
• 4.4 測序亞型及結(jié)果分析33-34
• 4.5 H5N6亞型同源性分析34-39
• 4.6 系統(tǒng)進(jìn)化樹及分子特征分析39-56
• 4.7 分子特征分析及耐藥性位點(diǎn)分析56-57
• 5. 討論57-60
• 6. 結(jié)論60-61
• 6.160
• 6.260
• 6.360-61
• 參考文獻(xiàn)61-65
• 致謝65-66
• 個人簡介66-68

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號：314346