IGF-1基因啟動(dòng)子區(qū)poly T結(jié)構(gòu)與豬生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-04-15 11:08
本文關(guān)鍵詞:IGF-1基因啟動(dòng)子區(qū)poly T結(jié)構(gòu)與豬生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)分析,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:類胰島素生長(zhǎng)因子1(Insulin-like growth factor-I,IGF-1)主要介導(dǎo)生長(zhǎng)激素(growth hormone,GH)的啟動(dòng)過程,同時(shí)也是機(jī)體生長(zhǎng)、發(fā)育和代謝的一個(gè)重要調(diào)控因子。課題組前期研究發(fā)現(xiàn)在豬IGF-1基因啟動(dòng)子區(qū)存在poly T位點(diǎn)多態(tài)性,而且已有研究證明poly T結(jié)構(gòu)與染色體核小體的形成有關(guān),進(jìn)而影響基因的轉(zhuǎn)錄。在此基礎(chǔ)上,通過簡(jiǎn)單重復(fù)序列(Simple Sequence Repeats,SSR)熒光標(biāo)記檢測(cè)方法對(duì)美系杜洛克豬,法系長(zhǎng)白豬,新法系大白豬,官莊花豬和粵東黑豬群體IGF-1基因進(jìn)行分型,并與美系杜洛克、新法系大白豬的生長(zhǎng)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。具體研究結(jié)果如下:1.在不同群體發(fā)現(xiàn)IGF-1基因的核心啟動(dòng)子區(qū)poly T位點(diǎn)存在多態(tài)性,且處于Hardy-Weinberg遺傳平衡狀態(tài)(P0.05)。在官莊花豬群體中9T、10T等位基因頻率分別為0.455、0.545;在粵東黑豬群體中分布的有9T、10T、11T三個(gè)等位基因頻率分別為0.333、0.639、0.028。在美系杜洛克、新法系大白豬、法系長(zhǎng)白豬中都只含有10T、11T兩個(gè)等位基因,其中10T等位基因的頻率分別為0.672、0.189、0.923,11T等位基因頻率分別為0.328、0.811、0.077。2、新法系大白豬、美系杜洛克豬只在達(dá)115 kg體重日齡、平均日增重性狀上不同基因型間差異顯著(P0.05),在新法系大白豬、美系杜洛克豬群體中,10/10T基因型個(gè)體比10/11T、11/11T個(gè)體表現(xiàn)較大的平均日增重。3、美系杜洛克豬群體中10/10T基因型個(gè)體比11/11T個(gè)體提前5.37天達(dá)115kg體重;新法系大白豬群體中10/10T個(gè)體比10/11T個(gè)體提前10.02天達(dá)到115 kg體重。
【關(guān)鍵詞】:豬 胰島素生長(zhǎng)因子-1 poly T SSR 生長(zhǎng)性狀 關(guān)聯(lián)分析
【學(xué)位授予單位】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S828
【目錄】:
- 摘要3-4
- abstract4-6
- 英文縮寫詞6-9
- 1 前言9-15
- 1.1 豬生長(zhǎng)性狀相關(guān)候選基因的研究9-10
- 1.2 IGF-1 基因結(jié)構(gòu)及功能研究現(xiàn)狀10-12
- 1.2.1 IGF-1 基因的多態(tài)性的研究10-11
- 1.2.2 IGF-1 基因的功能性研究11-12
- 1.3 Poly T結(jié)構(gòu)研究現(xiàn)狀12-13
- 1.4 SSR熒光標(biāo)記檢測(cè)13-14
- 1.5 研究目的與意義14
- 1.6 研究技術(shù)路線14-15
- 2 材料與方法15-25
- 2.1 實(shí)驗(yàn)材料15-18
- 2.1.1 實(shí)驗(yàn)樣品15
- 2.1.2 實(shí)驗(yàn)主要試劑15-16
- 2.1.2.1 主要試劑及試劑盒15-16
- 2.1.2.2 主要試劑的配置16
- 2.1.3 主要分子生物學(xué)軟件與數(shù)據(jù)庫16-17
- 2.1.4 儀器設(shè)備17-18
- 2.2 實(shí)驗(yàn)方法18-23
- 2.2.1 DNA抽提18
- 2.2.2 DNA質(zhì)量和濃度檢測(cè)18-19
- 2.2.3 設(shè)計(jì)特異性引物19
- 2.2.4 PCR擴(kuò)增19-20
- 2.2.5 目的片段的回收純化20-21
- 2.2.6 目的片段連T載21-22
- 2.2.7 IGF-1 載體質(zhì)粒抽提22-23
- 2.2.8 SSR熒光標(biāo)記檢測(cè)23
- 2.3 數(shù)據(jù)分析23-25
- 2.3.1 基因型頻率的計(jì)算23-24
- 2.3.2 哈迪-溫伯格定律--卡方檢驗(yàn)24
- 2.3.3 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析24
- 2.3.4 生產(chǎn)數(shù)據(jù)處理與分析24-25
- 3 結(jié)果與分析25-32
- 3.1 IGF-1 基因擴(kuò)增效果25-26
- 3.2 SSR熒光標(biāo)記檢測(cè)結(jié)果26-27
- 3.3 IGF-1 基因poly T位點(diǎn)在中外豬種中的分布情況27-29
- 3.3.1 商業(yè)豬種中poly T位點(diǎn)的分布情況27-28
- 3.3.2 地方豬群體poly T位點(diǎn)的分布情況28-29
- 3.4 IGF-1 基因與美系杜洛克豬生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)分析29-30
- 3.5 IGF-1 基因與新法系大白豬生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)分析30-32
- 4 討論32-34
- 4.1 IGF-1 基因poly T位點(diǎn)多態(tài)性在中外豬種的分布情況32
- 4.2 IGF-1 基因不同基因型對(duì)美系杜洛克、新法系大白豬生長(zhǎng)性狀的影響32-34
- 4.2.1 IGF-1 基因與美系杜洛克豬生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)分析32-33
- 4.2.2 IGF-1 基因與新法系大白豬生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)分析33-34
- 5 結(jié)論34-35
- 致謝35-36
- 參考文獻(xiàn)36-40
- 附錄40
本文關(guān)鍵詞:IGF-1基因啟動(dòng)子區(qū)poly T結(jié)構(gòu)與豬生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):308261
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