一株莫拉氏菌新種的分離鑒定與特性研究
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【摘要】:莫拉氏菌(moraxella),是一種革蘭氏陰性菌,有抗褪色傾向,歸屬于莫拉氏菌科。該菌多寄生于人或其它溫血?jiǎng)游锏酿つど?是一種機(jī)會(huì)性致病菌。莫拉氏菌通常為桿狀或球桿狀。桿菌短而飽滿,接近球形,球形菌通常較小,單個(gè)或成對(duì)存在。該菌在有氧環(huán)境下生長(zhǎng)良好,在缺氧環(huán)境下可微弱生長(zhǎng)。菌落不產(chǎn)生色素,通常氧化酶和觸酶陽性。不產(chǎn)酸以及碳水化合物。對(duì)青霉素敏感。DNA的G+Cmol%為40.0-47.5。本研究從四川綿陽地區(qū)鴨場(chǎng)分離到一株革蘭氏陰性球菌。該菌伴隨鴨疫里默氏菌被分離。并在此基礎(chǔ)上對(duì)其形態(tài)學(xué)、培養(yǎng)特性、生長(zhǎng)特性、生化特性等進(jìn)行了考察。其16S rRNA基因序列與莫拉氏菌屬細(xì)菌同源性最高可達(dá)到97%。初步鑒定為莫拉氏菌屬的一個(gè)新種。該分離株在顯微鏡下可見短桿狀,雙球或短鏈狀排列。多數(shù)成對(duì)排列,亦有單個(gè)排列。在巧克力平板上形成圓形、淡黃色、邊緣整齊、表面光滑、不透明、濕潤(rùn)、黏稠、扁平、大小均一的菌落。在麥康凱培養(yǎng)基上不生長(zhǎng)。API20NE生化實(shí)驗(yàn)表明該菌株不水解明膠尿素和七葉苷。不同化葡萄糖、檸檬酸、苯乙酸、阿拉伯糖、甘露糖、甘露醇、N-乙酰-葡萄糖胺、麥芽糖、葡萄酸鹽、癸酸、己二酸。硝酸鹽還原呈陰性。非發(fā)酵菌實(shí)驗(yàn)表明該菌株與精氨酸、鳥氨酸、賴氨酸、枸櫞酸鹽、尿素、七葉苷、木糖、氧化酶等反應(yīng)呈陽性。與硫化氫、葡萄糖、ONPG、蔗糖、麥芽糖、硝酸鹽還原、蛋白胨水的反應(yīng)呈陰性。對(duì)該菌株進(jìn)行了全基因組序列的測(cè)定,經(jīng)序列拼接,得到一條完整的基因組序列,該基因組長(zhǎng)度為549960 bp, G+C含量為45.87%;16S rRNA系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建。結(jié)果表明該分離株處于莫拉氏菌屬的進(jìn)化分支內(nèi),與兔莫拉氏菌、多動(dòng)物莫拉氏菌同源性較高。最后為測(cè)定該菌株與莫拉氏菌屬種內(nèi)的其它細(xì)菌的親緣關(guān)系,本研究以該菌株的全基因組序列為研究對(duì)象,進(jìn)行了平均核苷酸同源性分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)該菌株的全基因組與莫拉氏菌屬種內(nèi)細(xì)菌的全基因組對(duì)比得到ANIb值的范圍為69.23%~74.21%, ANIm值的范圍為84.02%-87.16%。該菌株的甲基萘醌組分為MK-7 (92%)、MK-6 (5%)和MK-8(2%)。菌株極性脂為diphosphatidyl(DPG)、phosphatidyl ethanolamine(PE)、glycolipid(GL)、 unidentified phospholipids(UPL)和undentified aminophospholipids(UAPL)。基于以上這些多相性分析結(jié)果,建議將該菌株界定為莫拉氏菌屬的一個(gè)新種,并命名為Moraxellaanas.sp.nov (RCAD00137)。為了解該分離菌株是否對(duì)鴨有致病性,本研究進(jìn)行了雛鴨攻毒實(shí)驗(yàn),結(jié)果表明該菌對(duì)健康雛鴨不致死。小鼠攻毒試驗(yàn)表明該菌對(duì)小鼠不致死。此外,鴨胚感染實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn)該菌株對(duì)鴨胚不致死。采用K-B藥敏紙片擴(kuò)散法進(jìn)行藥敏試驗(yàn),結(jié)果表明該分離菌株對(duì)青霉素G、氨芐西林、慶大霉素、氟苯尼考、萘啶酸、環(huán)丙沙星、恩諾沙星、克林霉素、紅霉素螺旋霉素、阿奇霉素、新諾明、復(fù)方新諾明、氯霉素、利福平等抗生素耐藥。對(duì)亞胺培南、美羅培南、頭孢他啶等抗生素敏感。該菌株表現(xiàn)出多重耐藥的現(xiàn)象。運(yùn)用14種抗生素進(jìn)行最小抑菌濃度的測(cè)定,結(jié)果菌株對(duì)喹諾酮類藥物的最小抑菌濃度均在512μg/ml以上,表現(xiàn)出高度耐藥。對(duì)臨床上常用的林可霉類中的林可霉素、克林霉素以及大環(huán)內(nèi)脂類的阿奇霉素和氨曲南、磺胺甲基異惡唑的最小抑菌濃度值均在512μg/ml以上,同樣表現(xiàn)出了高度耐藥。而對(duì)氯霉素(8μg/ml)、羧芐西林(16μg/ml)、萬古霉素(1μg/ml)則表現(xiàn)低水平的耐藥。
【關(guān)鍵詞】:鴨莫拉氏菌新種 分離鑒定 生化試驗(yàn) 16SrRNA 平均核苷酸同源性
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S852.61
【目錄】:
- 中文摘要4-6
- ABSTRACT6-8
- 縮略詞表8-11
- 1 文獻(xiàn)綜述11-19
- 1.1 莫拉氏菌病原學(xué)12-16
- 1.2 細(xì)菌新種的分離鑒定16-17
- 1.3 平均核苷酸同源性(ANI)17-19
- 1.4 研究的目的及意義19
- 2 實(shí)驗(yàn)材料和方法19-27
- 2.1 實(shí)驗(yàn)材料19-20
- 2.2 實(shí)驗(yàn)方法20-26
- 2.3 動(dòng)物感染實(shí)驗(yàn)26
- 2.4 鴨胚感染實(shí)驗(yàn)26-27
- 2.5 基于全基因組的平均核苷酸同源性分析27
- 3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果27-44
- 3.1 16S rDNA基因擴(kuò)增27-28
- 3.2 16S rRNA基因擴(kuò)增28-29
- 3.3 選擇性培養(yǎng)結(jié)果29-30
- 3.4 形態(tài)學(xué)檢查30-32
- 3.4.1 革蘭氏染色30-31
- 3.4.2 黑斯莢膜染色31-32
- 3.5 生化試驗(yàn)32-33
- 3.5.1 API 20 NE鑒定結(jié)果32-33
- 3.5.2 非發(fā)酵菌生化鑒定管試驗(yàn)33
- 3.6 藥物敏感性的測(cè)定33-35
- 3.7 最小抑菌濃度的測(cè)定35-36
- 3.8 醌組分及極性脂的測(cè)定36-37
- 3.9 全基因組的提取及測(cè)序37-44
- 3.9.1 基于16S rRNA基因序列分析及系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建38-41
- 3.9.2 生長(zhǎng)曲線的測(cè)定41-43
- 3.9.3 動(dòng)物感染試驗(yàn)43
- 3.9.4 鴨胚感染試驗(yàn)43
- 3.9.5 平均核苷酸同源性分析43-44
- 4 討論44-53
- 4.1 RCAD00137菌株的鑒定44
- 4.2 RCAD00137菌株的特性44-48
- 4.3 RCAD00137菌株藥物敏感性測(cè)定48-50
- 4.4 RCAD00137菌株醌組分測(cè)定以及極性脂測(cè)定50
- 4.5 RCAD00137菌株的致病性50-51
- 4.6 基于全基因組RCAD00137菌株平均核苷酸同源性分析51-53
- 5 結(jié)論53-54
- 6 參考文獻(xiàn)54-62
- 致謝62
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本文編號(hào):298446
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