甘肅主要綿羊品種的PRKAG3、CAST和CAPN1基因多態(tài)性與肉品質(zhì)相關(guān)性分析
本文關(guān)鍵詞:甘肅主要綿羊品種的PRKAG3、CAST和CAPN1基因多態(tài)性與肉品質(zhì)相關(guān)性分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:為從分子水平研究甘肅境內(nèi)典型養(yǎng)殖模式下甘肅高山細(xì)毛羊、小尾寒羊、藏羊、蒙古羊和灘羊5個(gè)綿羊品種(各50只)PRKAG3基因、CAST基因和CAPN1基因多態(tài)性與屠宰性能和肉品質(zhì)的相關(guān)性,探討以提高綿羊屠宰性能和肉品質(zhì)性能的可能性。研究采用PCR-SSCP技術(shù)對(duì)5個(gè)綿羊品種的PRKAG3,CAST以及CAPN1基因的多態(tài)性進(jìn)行研究,并與9月齡屠宰性能和肉品質(zhì)進(jìn)行相關(guān)性分析。主要研究結(jié)果如下:1、5個(gè)綿羊品種均檢測(cè)到PRKAG基因A2689G和A3659G兩個(gè)多態(tài)位點(diǎn)。A2689G位點(diǎn)位于內(nèi)含子4,A3659G位點(diǎn)位于外顯子10。A2689G多態(tài)位點(diǎn)中灘羊的雜合度最高,甘肅高山細(xì)毛羊次之,PIC值均介于0.25~0.5之間,為中度多態(tài)。經(jīng)χ2檢驗(yàn),藏羊偏離哈代-溫伯格平衡狀態(tài),其余綿羊品種在該位點(diǎn)均處于哈代-溫伯格平衡狀態(tài)。對(duì)于A3659G多態(tài)位點(diǎn),灘羊雜合度最高,為0.41,除小尾寒羊外,其余4個(gè)綿羊品種PIC值均介于0.25~0.5之間,為中度多態(tài)。關(guān)聯(lián)性分析表明,A2689G多態(tài)位點(diǎn)對(duì)胴體重和失水率有顯著影響(P0.05);A3659G多態(tài)位點(diǎn)對(duì)凈肉率、對(duì)剪切力有顯著影響。2、5個(gè)綿羊品種均檢測(cè)到CAST基因擴(kuò)增片段G62T,C110T多態(tài)性位點(diǎn),PIC值介于0.25~0.5之間,為中度多態(tài)。哈代溫伯格平衡檢驗(yàn)5個(gè)綿羊品種均偏離哈代溫伯格平衡。關(guān)聯(lián)性分析表明,多態(tài)位點(diǎn)對(duì)失水率和剪切力有顯著性影響(P0.05)。3、5個(gè)綿羊品種中均檢測(cè)到CAPN1基因A630G多態(tài)位點(diǎn),位于外顯子6,5個(gè)綿羊品種PIC值介于0.25~0.5之間,為中度多態(tài)。關(guān)聯(lián)性分析表明,此多態(tài)位點(diǎn)與胴體重和肉色有顯著相關(guān)性(P0.05)。4、基因聚合分析表明AB-FF-AB-BB基因型組合的個(gè)體有利于失水率與肉色的提高(P0.05),AA-FF-AB-BB基因型組合的個(gè)體有利于胴體重的提高(P0.05),且對(duì)肉色評(píng)分影響顯著(P0.05)。
【關(guān)鍵詞】:綿羊 PCR-SSCP PRKAG3基因 CAST基因 CAPN1基因 肉品質(zhì)性狀 關(guān)聯(lián)性分析
【學(xué)位授予單位】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:S826
【目錄】:
- 摘要4-5
- SUMMARY5-9
- 第一章 文獻(xiàn)綜述9-20
- 1 PRKAG3基因的研究現(xiàn)狀9-13
- 1.1PRKAG3基因的定位與發(fā)現(xiàn)9-10
- 1.2 PRKAG3結(jié)構(gòu)與活性調(diào)節(jié)10-11
- 1.3 PRKAG3在骨骼肌中特異性表達(dá)11-12
- 1.4 PRKAG3對(duì)營(yíng)養(yǎng)代謝的調(diào)節(jié)作用12
- 1.5 PRKAG3基因?qū)θ赓|(zhì)的影響12-13
- 2 Calpain家族基因13-18
- 2.1 Calpain系統(tǒng)的組成13-14
- 2.2 CAPN1和CAST結(jié)構(gòu)14-16
- 2.3 鈣蛋白酶系統(tǒng)功能16-18
- 3 PCR-SSCP與SNP的研究綜述18-19
- 3.1 SSCP技術(shù)的原理18
- 3.2 PCR-SSCP方法的特點(diǎn)18
- 3.3 SNP及其研究方法18-19
- 4 本研究的意義19-20
- 第二章 材料與方法20-28
- 1 實(shí)驗(yàn)材料20-22
- 1.1 主要儀器設(shè)備20-21
- 1.2 主要試劑21
- 1.3 主要試劑及配制21-22
- 2 試驗(yàn)方法22-25
- 2.1 技術(shù)路線(xiàn)22-23
- 2.2 血細(xì)胞DNA的提取23
- 2.3 引物設(shè)計(jì)23-24
- 2.4 PCR反應(yīng)最佳反應(yīng)體系24
- 2.5 PCR產(chǎn)物檢測(cè)24
- 2.6 PCR-SSCP分析及基因型判定24-25
- 3 數(shù)據(jù)分析25-28
- 3.1 生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析25-26
- 3.2 突變位點(diǎn)分析26-27
- 3.3 統(tǒng)計(jì)分析模型27-28
- 第三章 結(jié)果與分析28-47
- 1 基因組DNA抽提結(jié)果28
- 2 基因PCR擴(kuò)增結(jié)果28
- 3 PCR-SSCP多態(tài)性檢測(cè)及測(cè)序?qū)Ρ冉Y(jié)果28-47
- 3.1 PRKAG3基因PCR-SSCP分析及結(jié)果多態(tài)性檢測(cè)28-30
- 3.2 PRKAG3群體遺傳學(xué)分析30-32
- 3.3 CAST基因SSCP檢測(cè)與判型32
- 3.4 CAST基因第3內(nèi)含子測(cè)序結(jié)果比對(duì)32-33
- 3.5 CAST基因型頻率和基因頻率分析33-34
- 3.6 CAST基因基因多態(tài)位點(diǎn)的遺傳特性34
- 3.7 CAPN1基因多態(tài)性34-35
- 3.8 基因型頻率和基因頻率35-36
- 3.9 基因多態(tài)位點(diǎn)與屠宰性狀及肉品質(zhì)性狀分析36-44
- 3.10 對(duì)PRKAG3、CAST、CAPN1基因與肉質(zhì)相關(guān)性分析44-45
- 3.11 多基因聚合分析45-46
- 3.12 多基因聚合與肉品質(zhì)性狀相關(guān)性分析46-47
- 第四章 討論與結(jié)論47-53
- 1 討論47-52
- 1.1 PRKAG3基因遺傳特性分析及肉質(zhì)性狀的關(guān)系47-49
- 1.2 CAST基因遺傳特性分析及肉質(zhì)性狀的關(guān)系49-50
- 1.3 CAPN1基因遺傳特性分析及肉質(zhì)性狀的關(guān)系50-51
- 1.4 不同基因型組合對(duì)肉品質(zhì)影響51-52
- 2 結(jié)論52-53
- 參考文獻(xiàn)53-61
- 致謝61-62
- 作者簡(jiǎn)歷62-63
- 導(dǎo)師簡(jiǎn)介63-64
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