2009~2014年福建省甲型H1N1流感病毒分子流行病學特征研究
發(fā)布時間:2017-09-25 21:05
本文關鍵詞:2009~2014年福建省甲型H1N1流感病毒分子流行病學特征研究
更多相關文章: 甲型H1N1流感病毒 分子流行病學 抗原性 耐藥性 糖基化位點
【摘要】:目的:本研究通過對2009~2014年福建省甲型H1N1流感(甲流)病毒的分子流行病學特征進行分析,結合本省流感的監(jiān)測情況,旨在探索該病毒在我省的基因變異和分子特征,掌握流感流行的趨勢,為預測疫苗的防治效果及防控甲流疫情提供科學依據。方法:收集106株源自福建省各哨點醫(yī)院流感樣病例的甲流病毒毒株,通過RT-PCR和測序方法獲得HA和NA基因的全長序列。運用分子生物學軟件和統計學軟件對序列進行拼接、比對和分析,以甲流病毒疫苗株A/California/07/2009(H1N1)為參考毒株,從多個方面對我省甲流的分子流行病學進行研究,結合流感監(jiān)測數據來揭示甲流在我省的流行規(guī)律和變異特征。結果:1、2009~2014年福建省甲流經歷了流行消長的反復過程,近兩年的流行強度更是加大,2014年下半年處于流行低谷,但很有可能迎來新的流行高峰。2、同源進化分析顯示,福建省甲流病毒HA基因與疫苗株的核苷酸和氨基酸的同源性分別在97.6%~99.6%和97.2%~99.1%之間;NA基因則分別在98.7%~99.6%和97.4%~99.6%之間。隨著時間的推移,HA基因和NA基因的進化樹均逐漸形成6個分支,HA蛋白上的S143G、H138R、V249L、V234I、K163Q、S185T、S451N和NA蛋白上的K432E、V241I發(fā)生突變可能是導致毒株聚集成不同分枝的重要原因,其中H138R和S143G分別位于抗原決定簇Ca上和其周圍,K163Q和S185T則分別位于抗原決定簇Sa和Sb上。3、抗原性分析顯示,2009~2014年期間福建省甲流病毒HA蛋白中共有97個氨基酸位點發(fā)生變化,其中有17個氨基酸位點,變異累計涉及4個抗原決定簇,也有部分毒株在190螺旋和220環(huán)上位點發(fā)生變異,從2012年開始,毒株相對疫苗株出現了較大的變異,氨基酸位點的變異個數均超過10個。福建省近年來的甲流毒株已經出現了抗原漂移現象。抗原漂移株與非抗原漂移株在NA基因第34、44、200、241、321、369、386和432位點上的變異存在統計學差異。4、在本次甲流毒株中發(fā)現了D222G和Q293H位點的突變,但并未增強病毒毒力,所有毒株均表現為低致病性。5、本次研究中發(fā)現了“達菲”耐藥位點H275Y,并伴有可能會增強H275Y突變株NA酶活性及蛋白表達的V241I和N369K的同時突變。6、有3個毒株的HA蛋白上均增加一個位于抗原決定簇Sa內的糖基化位點NKS162-164或NQS162-164,其中2個毒株源于暴發(fā)疫情。在毒株中發(fā)現可能與耐藥相關的NA上的糖基化位點NQS42-44的增加,在毒株A/Fujianfuzhou/SWL11724/2009(H1N1)上也發(fā)現了可能會影響病毒的組織嗜性尤其是神經嗜性的NA蛋白的NGT146-148位點的缺失。結論:福建省甲流病毒已悄然發(fā)生遺傳變異和分子進化,與疫苗的同源性隨著時間的推移逐漸降低,并出現了51株抗原漂移株,且在NA基因上發(fā)現8個可能與抗原漂移現象相關的位點和H275Y耐藥位點。未來福建省可能會迎來新一輪甲流的流行。
【關鍵詞】:甲型H1N1流感病毒 分子流行病學 抗原性 耐藥性 糖基化位點
【學位授予單位】:福建醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R511.7
【目錄】:
- 主要英文縮略詞4-6
- 中文摘要6-8
- ABSTRACT8-11
- 引言11-15
- 第一部分 2009~2014年福建省流感監(jiān)測分析15-20
- 1 流感樣病例報告情況15-16
- 2 病原學監(jiān)測16-19
- 3 分析討論19-20
- 第二部分 2009~2014年福建省甲流病毒分子流行病學特征研究20-51
- 1 材料20-25
- 2 實驗方法25-29
- 3 結果29-48
- 4 討論48-51
- 結論51-52
- 參考文獻52-56
- 綜述56-64
- 參考文獻61-64
- 致謝64-65
- 已發(fā)表和待發(fā)表的文章65
【參考文獻】
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1 謝劍鋒;沈曉娜;王美愛;楊式芹;黃萌;張炎華;修文瓊;翁育偉;嚴延生;鄭奎城;;福建省甲型H1N1流感病毒基因特征研究[J];病毒學報;2014年01期
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,本文編號:919544
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