本文關(guān)鍵詞：H7N9禽流感患者恢復(fù)期T細(xì)胞受體庫特征研究

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【摘要】：目的建立H7N9禽流感患者恢復(fù)期T細(xì)胞受體庫,尋找H7N9特異性T細(xì)胞受體變化。方法收集2013年3月至5月確診的8例人感染禽流感H7N9患者恢復(fù)期血液以及10例健康人血液,分離基因組DNA,采用Ⅲumina He Seq2000測序平臺對T細(xì)胞受體庫β鏈(TRB)抗原互補(bǔ)決定區(qū)3進(jìn)行高通量測序,分析TRB庫的多樣性等特征。結(jié)果與正常組比較,H7N9患者某些TRBV基因使用頻率如TRBV30、TRBV27存在顯著差異。使用主成分分析降維后,發(fā)現(xiàn)恢復(fù)期患者TRBV-TRBJ基因配對模式與正常人有顯著差別,可用于區(qū)分H7N9患者和正常人群�；颊摺颊�、正常人—正常人之間的共享序列數(shù)量和頻率明顯大于患者-正常人,且患者間TRB庫具有較高相似度。多樣性指數(shù)在患者組明顯低于正常人群,顯示在感染恢復(fù)期其免疫功能仍處于相對低下狀態(tài)。同時H7N9患者中超高表達(dá)克隆明顯增多,且序列間存在較高相似性。結(jié)論 H7N9恢復(fù)期患者T細(xì)胞受體庫有H7N9特征性變化,這些特征將為疾病的診斷和治療性T細(xì)胞的研究提供重要信息。
【作者單位】： 復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院呼吸科;深圳華大基因股份有限公司;復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院;
【關(guān)鍵詞】： 高通量測序 免疫組庫 抗原互補(bǔ)決定區(qū) 生物信息學(xué) 禽流感病毒
【基金】：國家自然科學(xué)基金(編號:81170056、81490533)
【分類號】：R511.7
【正文快照】： are H7N9-specific changes in TRB repertoires of H7N9 infected patients in convalescent phase,which havepotential implication in diagnosis and therapeutic T cell development.自2013年,在中國首次報道實(shí)驗(yàn)室確診的人感染禽流感病毒H7N9以來[1],該新發(fā)傳染病在2014

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

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本文編號：911300