本文關(guān)鍵詞：云南中緬邊境等地5種瘧原蟲18S rDNA基因的序列分析及種系發(fā)育

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【摘要】：目的分析我國(guó)云南中緬邊境等地5種瘧原蟲18S rDNA的基因差異和種系發(fā)育。方法 2000-2015年收集來(lái)自我國(guó)云南中緬邊境等地的瘧疾患者血樣(或瘧原蟲DNA),提取血樣中的瘧原蟲DNA,對(duì)它們的18S rDNA基因進(jìn)行擴(kuò)增、測(cè)序分析,并與Gen Bank中瘧原蟲相應(yīng)序列進(jìn)行比較分析,利用鄰接法(neighbor joining,NJ)、最大似然法(maximum likelihood,ML)和最大簡(jiǎn)約法(maximum parsimony,MP)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果共收集了94例瘧疾患者血樣或DNA,所有樣品均擴(kuò)增出18S rDNA基因序列。序列比對(duì)分析顯示,惡性瘧原蟲(Plasmodium falciparum)、間日瘧原蟲(P.vivax)、三日瘧原蟲(P.malariae)、卵形瘧原蟲(P.ovale)和諾氏瘧原蟲(P.knowlesi)的種內(nèi)差異分別為0~0.2%、0~0.1%、0~0.1%、0~0.1%和0。種系發(fā)育關(guān)系分析顯示,NJ、MP和ML法構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)基本一致。本研究的瘧原蟲形成5個(gè)大的分支:惡性瘧原蟲形成一個(gè)分支,與Gen Bank中來(lái)自喀麥隆(KC428741、KC428742)、巴西(KC906718)和馬來(lái)西亞(HQ283221)的分離株聚集在一起;間日瘧原蟲形成一個(gè)分支,其中大部分樣品與來(lái)自喀麥隆(HF945443)、印度(HM014361、JQ627158)和哥倫比亞(U83877)的分離株形成一較小分支,小部分樣本(Pv11、Pv18和Pv21)形成一個(gè)更小的分支后與食蟹猴瘧原蟲(P.cynomolgi)(L07559)相聚形成一較小分支;三日瘧原蟲形成一個(gè)分支,來(lái)自云南的三日瘧原蟲Pm1、Pm3和Pm4聚在一個(gè)小分支內(nèi),并與來(lái)自日本的分離株(AB250682)相聚,再與來(lái)自海南的分離株P(guān)m5相聚,顯示出地區(qū)差異性;卵形瘧原蟲形成一個(gè)分支,與來(lái)自越南的分離株(EU935736、AF387038)聚在一起;諾氏瘧原蟲形成一個(gè)分支,與來(lái)自緬甸的分離株(GU816250、GU816246)聚在一起。結(jié)論我國(guó)云南中緬邊境等地5種瘧原蟲18S rDNA基因均無(wú)明顯種內(nèi)差異;種系發(fā)育關(guān)系分析顯示,NJ、MP和ML法構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)基本一致。
【作者單位】： 復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;中國(guó)疾病預(yù)防控制中心寄生蟲病預(yù)防控制所 世界衛(wèi)生組織熱帶病合作中心 科技部國(guó)家級(jí)熱帶病國(guó)際聯(lián)合研究中心 衛(wèi)生部寄生蟲病原與媒介生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 瘧原蟲 S rDNA基因 序列分析 種系發(fā)育
【基金】：上海市衛(wèi)計(jì)委面上項(xiàng)目(No.201640278) 國(guó)家科技重大專項(xiàng)(No.2012ZX10004-220) 國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(No.2016YFC1202000,2016YFC1202005) 國(guó)家科技支撐計(jì)劃(No.2008BAI56B03)~~
【分類號(hào)】：R531.3
【正文快照】： 瘧疾是由瘧原蟲經(jīng)按蚊叮咬進(jìn)入血液而引起的蟲媒傳染病。感染人體的瘧原蟲主要有5種,即惡性瘧原蟲(Plasmodium falciparum)、間日瘧原蟲(P.vivax)、三日瘧原蟲(P.malariae)、卵形瘧原蟲(P.ovale)和諾氏瘧原蟲(P.knowlesi)[1]。我國(guó)主要流行的是惡性瘧原蟲和間日瘧原蟲[2,3]。

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：883100