本文關(guān)鍵詞：不同來源H9N2亞型禽流感病毒血凝素蛋白生物學(xué)分析

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【摘要】：目的對(duì)不同來源的H9N2亞型禽流感病毒血凝素蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)比較分析,以找出重要的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)。方法從Genebank的基因數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取18株H9N2亞型禽流感病毒H9血凝素蛋白的核苷酸和氨基酸序列,運(yùn)用Clustal X,Bioedit等國(guó)際通用軟件進(jìn)行氨基酸和核苷酸的序列比對(duì),計(jì)算核苷酸及氨基酸的同源性。在線軟件Antheprot分析二級(jí)結(jié)構(gòu)。結(jié)果 H9型血凝素蛋白編碼框架長(zhǎng)約1683bp,編碼含560個(gè)氨基酸的多肽。18株H9N2亞型禽流感病毒血凝素基因同源率為90.6%~99.8%,血凝素蛋白的氨基酸同源率為93.0%~99.4%,多肽序列中有84個(gè)變異位點(diǎn),變異率為15.03%。血凝素蛋白A1和A2裂解序列為位于aa333-aa341的PSRSSR↓GLF序列;其中1株出現(xiàn)A334T變異,另一株則出現(xiàn)R335G變異。H9血凝素蛋白富含潛在α螺旋(25%~27%),β折疊(29%~32%),β轉(zhuǎn)角(25%~27%)及無規(guī)則卷曲(17%~19%)等結(jié)構(gòu);H9型血凝素蛋白受體結(jié)合位點(diǎn)是由R100、W161、T163、N191、198(A/V/T)、L202、Y203位氨基酸殘基折疊構(gòu)成。結(jié)論 H9N2亞型禽流感病毒血凝素蛋白重要功能結(jié)構(gòu)域的序列和空間結(jié)構(gòu)相對(duì)保守穩(wěn)定。
【作者單位】： 南昌大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院;南昌大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)教研室;
【關(guān)鍵詞】： HN亞型禽流感病毒 血凝素蛋白 生物信息學(xué) 蛋白結(jié)構(gòu)
【分類號(hào)】：R511.7
【正文快照】： 流感是嚴(yán)重威脅人類健康的一種呼吸道疾病,病原為流感病毒(influenza virus),分甲乙丙三型。甲型流感病毒為含8個(gè)節(jié)段的單負(fù)鏈RNA胞膜病毒,其胞膜上有血凝素和神經(jīng)氨酸酶2個(gè)刺突蛋白。血凝素抗原性的差異可將流感病毒分為1~15個(gè)亞型,神經(jīng)氨酸酶抗原性將流感病毒分為1~9個(gè)亞型

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本文編號(hào)：670030