環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測鉤端螺旋體方法的建立、應(yīng)用和評(píng)價(jià)
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【摘要】:鉤端螺旋體病(leptospirosis,簡稱鉤體病)是由致病性鉤端螺旋體(簡稱鉤體)感染引起的全球性人獸共患傳染病,流行范圍廣,危害大。在我國,多發(fā)生于水稻種植區(qū)域,是洪澇災(zāi)害時(shí)重點(diǎn)監(jiān)控的傳染病之一。鉤端螺旋體屬分兩個(gè)種:問號(hào)鉤端螺旋體和雙曲鉤端螺旋體;前者是寄生性、致病性的問號(hào)鉤端螺旋體,可分離自病人、動(dòng)物或者帶菌者;后者是非致病性鉤端螺旋體,通常對(duì)人和動(dòng)物不致病,除少數(shù)菌株外均來自地表水。鉤體病的早期診斷對(duì)于鉤體病的治療和預(yù)后很重要,目前診斷鉤體的方法有鉤體菌分離培養(yǎng)法、經(jīng)典方法顯微凝集試驗(yàn)(microscopic agglutination test, MAT)、動(dòng)物接種以及分子生物學(xué)技術(shù)檢查等。各種方法均具有一定的優(yōu)缺點(diǎn)和適用性,例如,分離培養(yǎng)耗費(fèi)時(shí)間長、檢出陽性率低;MAT具有快速和靈敏的特點(diǎn),但該檢測方法存在一定的局限性,如耗費(fèi)血清抗體量大、檢測時(shí)效性低、結(jié)果易受各種因素影響等;PCR和熒光定量PCR存在操作復(fù)雜和儀器昂貴等問題,在一些發(fā)展中國家和現(xiàn)場檢測方面受到限制。環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(loop-mediated isothermal amplification, LAMP)是2000年日本榮研公司Notomi博士研發(fā)出的一種新型等溫核酸擴(kuò)增方法。本研究旨在建立環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)快速檢測鉤端螺旋體,并應(yīng)用于鉤體的現(xiàn)場環(huán)境檢測,為鉤體病原菌的快速檢測、現(xiàn)場流行病學(xué)調(diào)查和現(xiàn)場疾病監(jiān)測提供基礎(chǔ)。本研究實(shí)驗(yàn)中的LipL32是鉤體外膜重要蛋白,僅存在致病性鉤體中,含量占的外膜總蛋白75%,是引起人和動(dòng)物免疫的重要蛋白。本研究以鉤體外膜蛋白LipL32基因?yàn)槟康幕?下載我國15群15型鉤體標(biāo)準(zhǔn)參考菌株序列,設(shè)計(jì)LAMP引物,并以熒光定量PCR和普通PCR為對(duì)照,依次進(jìn)行菌株樣本靈敏度檢測、特異性檢測(98株菌)、模擬樣本研究和現(xiàn)場實(shí)踐研究(69個(gè)樣本)。結(jié)果:探針法熒光定量PCR檢測下限為2copy/μL; LAMP檢測下限為200 copy/μL,同染料法熒光定量檢測下限一樣,比普通PCR方法靈敏100倍;特異性檢驗(yàn)結(jié)果良好,擴(kuò)增56株鉤體結(jié)果為陽性,檢測25株非鉤體結(jié)果為陰性;模擬樣本檢測下限為200條鉤體/μL(煮沸法)和200條鉤體/μL(試劑盒提取法)。在現(xiàn)場采集標(biāo)本檢測研究中,不同的檢測方法的結(jié)果一致,LAMP對(duì)現(xiàn)場采集標(biāo)本的檢出率同熒光定量法一致,高于普通PCR方法。本次LAMP研究,針對(duì)致病性鉤體LipL32基因設(shè)計(jì)的引物,特異性好,靈敏度比普通PCR高兩個(gè)數(shù)量級(jí),可以應(yīng)用于不同血清型、群的鉤體檢測,也可以用于現(xiàn)場采集標(biāo)本的檢測。LAMP實(shí)驗(yàn)操作簡單,對(duì)設(shè)備要求不高,可以用于現(xiàn)場快速檢測鉤體。
【關(guān)鍵詞】:問號(hào)鉤端螺旋體屬 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增 檢測 應(yīng)用
【學(xué)位授予單位】:中國疾病預(yù)防控制中心
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R514.4;R440
【目錄】:
- 縮略詞5-6
- 中文摘要6-8
- Abstract8-10
- 前言10-26
- 材料與方法26-36
- 結(jié)果及分析36-53
- 討論53-59
- 小結(jié)59-60
- 參考文獻(xiàn)60-62
- 附件62-68
- 碩士研究生期間發(fā)表文章68-69
- 致謝69
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