本文關(guān)鍵詞：重慶市2009～2014年甲型H1N1流感病毒分離株HA基因變異分析

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【摘要】：目的對2009~2014年分離得到的甲型H1N1流感病毒進(jìn)行血凝素(HA)基因測序分析,與世界衛(wèi)生組織(WHO)推薦疫苗株A/California/07/2009(H1N1)比對,研究其基因變異情況。方法按分離時間及地點不同,選取47株2011~2014年分離得到的甲型H1N1流感病毒進(jìn)行測序,同時選取既往已有的25株2009年甲型H1N1流感病毒的序列結(jié)果,經(jīng)分子生物學(xué)軟件進(jìn)行核苷酸及氨基酸序列分析,并繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果 2009、2011~2014年的新型甲型H1N1流感病毒與疫苗株均位于一個大的分枝下,各病毒間的關(guān)系均較近。72株分離株的HA基因總的核苷酸差異在0~2.7%之間,氨基酸差異在0~3.1%之間;與疫苗株A/California/07/2009(H1N1)的核苷酸差異在0.4%~2.4%之間,氨基酸差異在0.9%~3.1%之間。氨基酸變異情況隨著年份增加累積得更多,但在氨基酸序列上仍顯示為低致病性流感病毒特征;2009年有9株病毒株丟失481位的糖基化位點,2013年有6株病毒株增加位于162位的糖基化位點。結(jié)論 WHO推薦的甲型H1N1疫苗總體上對重慶地區(qū)的人群仍有較好的保護(hù)作用,但隨著時間推移,部分甲型H1N1流感病毒株可能已發(fā)生抗原漂移,需繼續(xù)對其監(jiān)測。
【作者單位】： 重慶市疾病預(yù)防控制中心微生物檢測所;重慶市疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所;
【關(guān)鍵詞】： 甲型HN 流感病毒 序列分析 HA基因
【基金】：重慶市衛(wèi)計委醫(yī)學(xué)科研基金資助項目(2011-2-316)
【分類號】：R511.7
【正文快照】： 流行性感冒(簡稱流感)是由流感病毒引起的具有高度傳染性的急性呼吸道傳染病,傳播迅速,短時間內(nèi)可造成局部地區(qū)的暴發(fā)或全球范圍的流行,也是人類迄今為止尚無法有效控制的傳染病之一。流感病毒屬正黏病毒科(orthomyxoviri-dae),按核衣殼蛋白(nucleocapsid protein,NP)和基質(zhì)蛋

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