本文關鍵詞：宿主抗原呈遞通路基因LMP多態(tài)性與丙型肝炎病毒感染的相關性研究

  更多相關文章： 丙型肝炎病毒 慢性感染 LMP2基因 LMP7基因 單核苷酸多態(tài)性

【摘要】：背景：丙型肝炎病毒的感染是導致慢性丙型肝炎,肝硬化以及肝細胞癌的重要原因之一。宿主系統(tǒng)的適應性免疫應答是控制病毒感染進程的主要手段。病毒的感染和清除都依據(jù)機體的抗原呈遞通路誘導正確有效的體液免疫和細胞免疫應答。目前的研究表明：低分子量蛋白酶體(lowmolecular weight protein,LMP)作為HLA-I類基因的組成部分,參與內源性抗原加工,產(chǎn)生抗原肽,以保證HLA抗原復合體的后續(xù)正常呈遞。近年來,國內外很多研究都報道了LMP基因多態(tài)性與丙型肝炎病毒慢性感染之間的關聯(lián)性,但由于人種,民族,樣本和實驗研究方法的不同,結果并不完全一致。因此,本研究的目的就是探討中國云南地區(qū)漢族人群的LMP基因多態(tài)性與丙型肝炎病毒的慢性感染之間是否具有關聯(lián)性。方法：本研究分為兩個部分。第一部分收集2010.1.1-2015.12.31在云南省第一人民醫(yī)院接受過HCV抗體檢查的全部一般就診人群的臨床相關資料及抗-HCV血液檢測結果。觀察其在不同的年份,性別,年齡等方面的的分布上是否存在明顯差異性。第二部分選擇云南地區(qū)漢族人群HCV慢性感染患者427例,健康對照者412名,采用TaqMan探針基因分型方法對LMP2基因SNPrs1351383, rs17587,rs2127675和LMP7基因SNPrs2071543進行基因分型,并對LMP2上三個位點構建單倍型,分別統(tǒng)計它們的等位基因頻率,基因型頻率,單倍型頻率,并分析SNPs及單倍型與HCV慢性感染的相關性。結果：(1)對接受過HCV抗體檢查的一般就診人群共573796名進行了調查,其中包括男性291091名(50.73%),女性282705名(49.27%)。顯示全部選取人群的總體抗-HCV陽性率為0.58%,抗-HCV陽性率在不同的年份,性別,年齡分布上均顯示出明顯的差異性,具有統(tǒng)計學意義(P0.05)。男性陽性率明顯高于女性,且近幾年比例基本維持不變。女性抗-HCV陽性率近三年比例小幅上升。在年齡方面有明顯區(qū)分度,中年(30-49歲)是HCV的最高發(fā)年齡段。(2)在病例組和對照組中,LMP2rs1351383(AC)等位基因A和C的頻率分別為56.9%、60.9%和43.1%、39.1%；AA、AC、CC基因型頻率分別為32.8%、48.3%、19%和36.3%、49.2%、14.5%。rs17587(GA)等位基因G和A的頻率分別為77.7%、78.7%和22.3%、21.3%；GG、AG、AA基因型頻率分別為61%、33.4%、5.6%和61.6%、34.1%、4.3%。rs2127675(AG)等位基因A和G的頻率分別為66.1%、70.5%和33.9%、29.5%；AA、AG、GG基因型頻率分別為44%、44.2%、11.9%和48.8%、43.5%、7.8%。rs2071543(GT)等位基因G和T的頻率分別為82.7%\81.9%和17.3%、18.1%：LMP7rs2071543(GT),GG、GT、TT基因型頻率分別為68.5%、28.2%、3.2%和68.2%、27.6%、4.3%。病例組和對照組LMP2基因rs1351383和rs2127675的等位基因頻率的差異具有統(tǒng)計學意義(P0.05),rs1351383/rsl7587/rs2127675構建單倍型AGA和CGG,差異具有統(tǒng)計學意義(P0.05)；除此以外,其他位點的基因型、等位基因型、單倍型的頻率在病例組和對照組中差異均無統(tǒng)計學意義(P0.05)。結論：從流行病學調查層面來看,中國云南地區(qū)漢族人群的總體抗-HCV陽性率呈現(xiàn)上升趨勢,符合全國范圍內的總體趨勢。從分子生物學角度來看,中國云南地區(qū)漢族人群LMP2基因SNPrs1351383C等位基因和rs2127675 G等位基因可能是HCV慢性感染的易感因素,rs1351383/rs17587/rs2127675單倍型AGA可能是HCV慢性感染的保護因素,CGG可能是HCV慢性感染的危險因素。
【關鍵詞】：丙型肝炎病毒 慢性感染 LMP2基因 LMP7基因 單核苷酸多態(tài)性
【學位授予單位】：昆明理工大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R512.63
【目錄】：

• 摘要5-7
• Abstract7-12
• 第一章 緒論12-28
• 1 丙型肝炎病毒的概述12-21
• 2 宿主HLA抗原呈遞通路相關基因及抗原加工呈遞機制21-24
• 3 宿主HLA抗原呈遞通路相關基因與HCV感染的相關性24-25
• 4 LMP基因與HCV感染的相關性25-28
• 第二章 實驗內容28-56
• 第一部分：云南省昆明市一般人群HCV感染的流行病學調查28-31
• 1 材料與方法28
• 2 結果28-31
• 第二部分：云南漢族人群LMP基因多態(tài)性與HCV慢性感染的相關性研究31-56
• (一) 實驗材料31-34
• 1 實驗對象31
• 2 主要試劑31-33
• 3 主要儀器33-34
• (二) 實驗方法34-45
• 1 DNA的提取及定量34-36
• 2 樣本臨床指標的檢測36-39
• 3 LMP2,LMP7基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點基因分型39-43
• 4 統(tǒng)計學處理43-45
• (三) 實驗結果與分析45-56
• 1 研究對象的基本特征45-46
• 2 TaqMan探針基因分型結果46-50
• 3 普通PCR擴增產(chǎn)物測序檢測結果50-52
• 4 病例組與對照組LMP2和LMP7基因的Hardy-Weinberg平衡檢驗52-53
• 5 LPM2,LMP7多態(tài)性位點在病例組和對照組中的等位基因與基因型頻率53-54
• 6 LMP2多態(tài)性位點在病例組和對照組中的連鎖不平衡檢測結果54-55
• 7 LMP2多態(tài)性位點在病例組和對照組中的單倍型構建及其頻率55-56
• 第三章 討論56-64
• 第一部分：云南省昆明市正常人群HCV感染的流行病學調查56-58
• 第二部分：云南漢族人群LMP基因多態(tài)性與HCV慢性感染的相關性研究58-64
• 第四章 小結64-65
• 致謝65-66
• 參考文獻66-76
• 附錄A 研究生期間發(fā)表文章76

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 荊丹清,滕衛(wèi)平;MHC區(qū)域LMP和TAP基因與1型糖尿病的關系[J];中國糖尿病雜志;2000年02期

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 李彤;宿主抗原呈遞通路基因LMP多態(tài)性與丙型肝炎病毒感染的相關性研究[D];昆明理工大學;2016年

，

本文編號：564163