新疆頭癬致病菌的系統(tǒng)進(jìn)化研究
發(fā)布時間:2025-04-27 02:04
目的:明確新疆頭癬致病菌許蘭毛癬菌、斷發(fā)毛癬菌、紫色毛癬菌、犬小孢子菌4種菌的系統(tǒng)進(jìn)化親緣特征,試圖從菌種演變進(jìn)化角度為新疆頭癬高流行的原因提供數(shù)據(jù)支持。方法:收集新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院皮膚科實驗室保存的經(jīng)形態(tài)學(xué)明確鑒定的頭癬致病菌,分離的菌株患者分別來自北疆烏魯木齊市和克拉瑪依市,南疆喀什市及和田市。用于實驗的臨床菌株傳代培養(yǎng)采用馬鈴薯PDA培養(yǎng)基27℃培養(yǎng)。提取已培養(yǎng)好的菌株基因組DNA,采用普通PCR擴(kuò)增真菌通用引物ITS間區(qū)和Beta-tublin間區(qū)序列,凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物送交測序,將所得數(shù)據(jù)在GenBank核酸數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行blast同源序列比對。根據(jù)blast同源性比對結(jié)果,選取同源性程度最高的參照菌株信息,分別使用Clustal和MEGA5.0軟件將序列匹配排列,進(jìn)行500次bootstrap統(tǒng)計學(xué)檢驗,繪制四種菌的ITS和Beta-tubulin基因序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果:四種菌的ITS和Beta-tublin間區(qū)序列分子鑒定均與形態(tài)學(xué)鑒定完全吻合。使用Beta-tublin間區(qū)在真菌系統(tǒng)進(jìn)化研究上比ITS間區(qū)更可靠,種間同源性達(dá)100%。根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化樹特征分析四種...
【文章頁數(shù)】:42 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中英文縮略詞對照表
摘要
ABSTRACT
前言
研究內(nèi)容與方法
1.研究對象
2.實驗所需儀器及試劑
3.研究方法
3.1 DNA的提取
3.2 核酸蛋白定量儀測定DNA濃度
3.3 引物合成
3.4 引物溶液配制
3.5 用ITS1/4引物擴(kuò)增ITS基因
3.6 用Beta-tubulin F/R引物擴(kuò)增Beta-tubulin基因
3.7 凝膠電泳檢查 PCR 產(chǎn)物
3.8 PCR產(chǎn)物測序及系統(tǒng)進(jìn)化分析
技術(shù)路線圖
結(jié)果
討論
小結(jié)
致謝
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)位論文
新疆醫(yī)科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文導(dǎo)師評閱表
本文編號:4041709
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【學(xué)位級別】:碩士
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摘要
ABSTRACT
前言
研究內(nèi)容與方法
1.研究對象
2.實驗所需儀器及試劑
3.研究方法
3.1 DNA的提取
3.2 核酸蛋白定量儀測定DNA濃度
3.3 引物合成
3.4 引物溶液配制
3.5 用ITS1/4引物擴(kuò)增ITS基因
3.6 用Beta-tubulin F/R引物擴(kuò)增Beta-tubulin基因
3.7 凝膠電泳檢查 PCR 產(chǎn)物
3.8 PCR產(chǎn)物測序及系統(tǒng)進(jìn)化分析
技術(shù)路線圖
結(jié)果
討論
小結(jié)
致謝
參考文獻(xiàn)
綜述
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