目的對19例人感染高致病性H5N6禽流感病毒的血凝素(hemagglutinin,HA)和神經(jīng)氨酸酶(neuraminidase,NA)蛋白進行分子進化分析。方法運用下一代測序平臺對病毒分離物進行全基因組測序,從美國國家生物技術信息中心(national center for biotechnology information,NCBI)和全球流感序列數(shù)據(jù)庫(global initiative on sharing avian influenza data, GISAID)下載參考序列,利用Blasts、Mega 6.1及Clustal X 2.1等軟件進行序列分析。結果 2014-2018年中國共發(fā)生23例人感染H5N6禽流感病毒病例。對19個病例的H5N6病毒的HA和NA基因進行進化分析。HA進化分析顯示病毒都屬于Clade 2.3.4.4,其中涉及17個病例的病毒屬于Group C;首例H5N6病例毒株(A/Sichuan/26221/2014)屬于Group D;福建一個病例(A/Fujian-Sanyuan/21099/2017)屬于Group B。所有19個病例的病毒HA蛋...

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圖12014-2018年19例人感染H5N6病毒HA基因進化樹

Lee等[3,13]研究發(fā)現(xiàn),從2012年末開始,2.3.4.4H5Nx病毒的HA基因分化出4個不同進化群:GroupA(Buan-like)、B(Gochang-like)、C和D。本研究中,HA進化分析顯示(圖1),31株病毒都屬于Clade2.3.4.4,其中涉及17....

圖22014-2018年19例人感染H5N6病毒NA基因進化樹

從NA進化樹分析可見,H5N6病毒的NA起源于中國家禽中流行LPAIH6N6病毒,進化上為兩大分支:A分支屬于早期H5N6病毒,NA蛋白莖區(qū)沒有發(fā)生缺失;B分支NA蛋白莖區(qū)出現(xiàn)11個氨基酸的缺失。見圖2。2.4分子特征分析

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