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廣西和越南北部HIV-1分子流行病學(xué)及耐藥研究

發(fā)布時(shí)間:2024-03-10 18:15
  第一部分廣西和越南北部HIV-1分子流行病學(xué)研究背景和目的廣西是我國(guó)艾滋病疫情較為嚴(yán)重的地區(qū),而與廣西接壤的越南北部地區(qū)也是該國(guó)艾滋病疫情相對(duì)嚴(yán)重的區(qū)域。既往研究表明廣西-越南北部之間存在HIV-1毒株相互傳播的可能,但多數(shù)研究是利用當(dāng)?shù)夭杉腍IV流行毒株與國(guó)際上公開(kāi)的中國(guó)或者越南的HIV毒株序列進(jìn)行進(jìn)化分析得出的結(jié)果。近年來(lái)廣西和越南北部HIV-1的傳播途徑和主要亞型已發(fā)生了一定的變化。到目前為止,尚未有同一時(shí)期在兩地開(kāi)展的較大規(guī)模的流行病學(xué)研究去明確兩地的HIV-1毒株之間是否存在傳播關(guān)系。當(dāng)前,廣西和越南的政治、經(jīng)濟(jì)、文化交流隨著“一帶一路”倡議的帶動(dòng)和日益密切的中國(guó)-東盟合作而日趨活躍,艾滋病相互傳播的風(fēng)險(xiǎn)也加大。在此背景下,本研究的主要目的是通過(guò)同時(shí)收集兩地艾滋病感染樣本,分析當(dāng)前兩地HIV-1亞型的分布、基因變異和系統(tǒng)進(jìn)化特征,以期了解廣西和越南北部地區(qū)HIV-1的流行特征、基因變異和相互的傳播關(guān)系。方法2016年-2017年,通過(guò)方便抽樣,在廣西(崇左市、防城港市、百色市、南寧市和柳州市)和越南北部(廣寧省、涼山省、高平省和河江省)收集進(jìn)行抗病毒治療的艾滋病感染者作為研...

【文章頁(yè)數(shù)】:129 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

圖1-1廣西和越南北部的pol基因序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析

圖1-1廣西和越南北部的pol基因序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析

2018屆博士論文廣西和越南北部HIV-1分子流行病學(xué)及耐藥研究2.廣西和越南HIV-1基因亞型判定及分布情況首先使用NCBI提供的在線分析工具Genotyping分別對(duì)gag、pol和env序列進(jìn)行初步亞型鑒定,再使用MEGA7.0繪制gag、po....


圖1-3廣西HIV-1樣本基因亞型在各城市的分布

圖1-3廣西HIV-1樣本基因亞型在各城市的分布

地區(qū)CRF01_AECRF08_BCCRF07_BCBCURFs總計(jì)南寧4.26(17/399)10.78(43/399)---0.75pp(3/399)15.79(63/399)百色3.76(15/399)15.04(60/399)0.75(3/399)--....


圖1-4廣西HIV-1樣本基因亞型在性別方面的分布

圖1-4廣西HIV-1樣本基因亞型在性別方面的分布

圖1-4廣西HIV-1樣本基因亞型在性別方面的分布Fig1-4ThesexdistributionofHIV-1subtypesinGuangxi2.3基因亞型的感染途徑分布表1-3顯示了廣西HIV-1各基因亞型在傳播途徑方面的分布,已知亞型樣....


圖1-5樣本NN-IDU-16pol區(qū)DNA序列的RIP分析結(jié)果

圖1-5樣本NN-IDU-16pol區(qū)DNA序列的RIP分析結(jié)果

2018屆博士論文廣西和越南北部HIV-1分子流行病學(xué)及耐藥研究置插入了B(B’)亞型片段,其余位置均為CRF01_AE亞型(圖1-6);此外,為了進(jìn)一步確定樣本在HIVDNA序列上具體的重組位置,我們又運(yùn)用HIVDatabase提供的在線工....



本文編號(hào):3925171

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