目的對(duì)鹽城市2015-2017年流行的乙型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神經(jīng)氨酸酶(neuraminidase, NA)基因進(jìn)行分子進(jìn)化特征研究。方法將鹽城市2015-2017年流感監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)醫(yī)院以及流感暴發(fā)點(diǎn)采集的流感樣病例咽拭子標(biāo)本進(jìn)行核酸、病毒分離檢測(cè)定型,對(duì)選取的18株乙型流感病毒分離株采用一步法RT-PCR方法擴(kuò)增其HA1基因和NA基因,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)純化測(cè)序,采用生物信息軟件從核苷酸、氨基酸以及分子進(jìn)化層面對(duì)毒株進(jìn)行分子特征分析。結(jié)果鹽城市2015-2017年分離的乙型流感病毒HA1基因和NA基因聚類(lèi)的分支關(guān)系基本一致,2015年Yamagata系毒株位于Yamagata Clade 3分支,屬Phuket/3073類(lèi)毒株;2016-2017年Victoria系毒株分布于Victoria Clade 1A分支,屬Brisbane/60類(lèi)毒株。Yamagata系所有毒株在190-helix抗原表位均發(fā)生了D196N位點(diǎn)的變異;Victoria系毒株共涉及2個(gè)抗原表位,120-loop抗原表位的117、129位點(diǎn),190-helix抗原表位的197、199位點(diǎn)。...

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圖1鹽城市2015-2017年乙型流感病毒HA1基因(A)、NA基因(B)分子進(jìn)化樹(shù)

表1鹽城市2015-2017年代表株與疫苗株HA1、NA基因核苷酸和氨基酸同源性分析Table1AnalysisofvaccinestrainsofnucleotideandaminoacidhomologyofHA1andNAgeneswit....

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