目的:探討乙肝病毒S區(qū)基因在垂直傳播中的傳播特征及S區(qū)突變對(duì)乙肝疫苗接種失敗的影響。方法:本研究納入了9對(duì)乙肝疫苗接種失敗的患兒及其母親,其中所有患兒生后都完整的接受了乙肝疫苗的接種,病程中患兒及母親的肝功能都保持正常。首先從患者血清中提取乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)DNA,聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增HBV S區(qū)基因,并將其純化后打斷成250-500bp長度的小片段;再通過PCR方法在每個(gè)樣本的小片段上加上Barcode引物序列,膠回收目的片段。最后將樣本送出進(jìn)行深度測序并完成生物信息學(xué)分析。結(jié)果:基因分型結(jié)果顯示,所有的母子對(duì)都為基因型B和基因型C的混合感染。其中7對(duì)母子的優(yōu)勢基因型為基因型B,2對(duì)為基因型C,所有患兒的優(yōu)勢基因型和其母親是相同的,優(yōu)勢基因型在垂直傳播中并未發(fā)生改變。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析顯示,所有母子之間的consensus sequences的一致性高于98.5%。母子所共同含有的突變的占患兒突變的比例高,平均占比為83.13±8.45%。通過比較相同氨基酸位點(diǎn)的平均香農(nóng)熵,發(fā)現(xiàn)大多數(shù)氨基酸...

【文章頁數(shù)】：46 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
英漢縮略語名詞對(duì)照
中文摘要
英文摘要
前言
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 研究對(duì)象
    1.3 實(shí)驗(yàn)室檢查
    1.4 HBV DNA提取
    1.5 HBVS區(qū)PCR擴(kuò)增
    1.6 HBVS區(qū)測序文庫構(gòu)建
    1.7 深度測序
    1.8 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果
    2.1 母子的臨床資料和高通量測序數(shù)據(jù)
    2.2 HBVS區(qū)基因在垂直傳播中的高保守性
    2.3 HBVS區(qū)基因突變的影響
    2.4 HBsAg的結(jié)構(gòu)分析
3 討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝
碩士期間發(fā)表論文



本文編號(hào)：3811329