目的探討MLVA基因分型法在云南大理地區(qū)單純感染者和合并HIV雙重感染者結(jié)核分枝桿菌基因分型中的運(yùn)用,初步研究兩種來源不同臨床分離株的基因型特征。方法收集大理地區(qū)單純感染肺結(jié)核患者和合并HIV雙重感染肺結(jié)核患者的痰標(biāo)本,經(jīng)培養(yǎng)鑒定后運(yùn)用MLVA法進(jìn)行基因分型研究。本研究選取15個數(shù)目可變串聯(lián)重復(fù)序列(VNTR)特異位點(diǎn),運(yùn)用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)和瓊脂糖凝膠電泳技術(shù)初步建立檢測大理地區(qū)結(jié)核分枝桿菌DNA指紋圖譜方法。運(yùn)用Quantity One和Bio Numerics(6.6)軟件對實驗獲得的結(jié)果進(jìn)行數(shù)字化處理并進(jìn)行聚類分析。對結(jié)核分枝桿菌基因型成簇率、優(yōu)勢菌株分布和人口學(xué)等信息運(yùn)用SPSS19.0統(tǒng)計軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析�；蚍中偷募易褰Y(jié)果通過與數(shù)據(jù)庫比對來獲得。結(jié)果1.通過MLVA法進(jìn)行基因分型研究,15個位點(diǎn)中分辨能力最高的為MIRU26(HGI=0.839),分辨能力最低的為MIRU4(HGI=0,341)。2.通過運(yùn)用UPGMA法將122株單純感染臨床分離株和1株H37Rv減毒株分為7個基因群;61株雙重感染者臨床分離株和1株H37Rv減毒株分為5個基因群。兩組中H37Rv減毒...

【文章頁數(shù)】：63 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
英漢縮略詞與英漢對照
中文摘要
英文摘要
前言
材料與方法
    1 實驗材料
        1.1 標(biāo)本來源
        1.2 主要試劑
        1.4 實驗耗材
        1.5 實驗儀器
        1.6 試劑配制
    2 研究方法
        2.1 結(jié)核菌株鑒定
        2.2 結(jié)核菌培養(yǎng)
        2.3 結(jié)核分枝桿菌DNA提取
        2.4 MLVA基因分型
        2.5 數(shù)據(jù)分析
結(jié)果
    1 標(biāo)本基本資料
    2 不同VNTR位點(diǎn)檢測
        2.1 DNA結(jié)果重復(fù)性檢測
        2.2 VNTR基因位點(diǎn)多態(tài)性檢測
    3 不同VNTR位點(diǎn)的分辨力
    4 MLVA基因分型
        4.1 計算各個菌株各VNTR重復(fù)次數(shù)
        4.2 UPGMA法MLVA基因分型
        4.3 MLVA基因分型結(jié)果對比
    5 大理地區(qū)結(jié)核分枝桿菌成簇率分布
    6 優(yōu)勢菌株基因型分布情況
        6.1 北京家族基因型在優(yōu)勢菌株和總菌株中分布情況之間的差異
        6.2 性別在優(yōu)勢與非優(yōu)勢菌株之間的差異
        6.3 年齡在優(yōu)勢基因群和非優(yōu)勢基因群之間的差異
    7 單純感染菌株和合并HIV雙重感染菌株之間的差異
        7.1 性別與菌株之間的差異
        7.2 年齡與菌株之間的差異
    8 61株雙重感染者樣本UPGMA法計算結(jié)果
        8.1 UPGMA樹狀圖結(jié)果分析
        8.2 UPGMA法樹狀圖各地區(qū)基因型分布特征
        8.3 MLVA基因分型結(jié)果對比
        8.4 北京家族基因型在雙感優(yōu)勢菌株和全部雙感菌株間分布情況的差異
        8.5 性別在優(yōu)勢與非優(yōu)勢菌株之間的差異
        8.6 年齡在雙重感染者優(yōu)勢基因群和非優(yōu)勢基因群之間的差異
    9 北京家族基因型在雙重感染者和總感染者中分布的差異
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
課題資助情況
綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝



本文編號：3810029