細(xì)粒棘球蚴線粒體nad1基因的克隆與序列分析
發(fā)布時(shí)間:2023-03-31 19:46
目的為完善細(xì)粒棘球蚴(Echinococcus granulasus)的分子分類學(xué)體系,提供更優(yōu)化的種間和種內(nèi)遺傳標(biāo)記基因。方法在內(nèi)蒙古地區(qū)采集患羊肝臟細(xì)粒棘球蚴和肝包蟲病患者棘球蚴。采用提取蟲體DNA的方法,擴(kuò)增線粒體NADH脫氫酶1(nad1)基因并進(jìn)行測序,運(yùn)用DNAstar5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹并采用MEGA4.0軟件進(jìn)行自居檢驗(yàn)。結(jié)果細(xì)粒棘球蚴DNA擴(kuò)增出的羊株、人株nad1基因序列片段長度為895 bp。羊株、人株細(xì)粒棘球蚴nad1序列與加拿大棘球絳蟲的同源性最高,相似性為86.5%;羊株、人株細(xì)粒棘球蚴nad1序列與加拿大棘球絳蟲位于同一分支,自展值(Boostrap)最高,為100%。羊株、人株細(xì)粒棘球蚴nad1序列所屬分支與裂頭目、裂頭科Diplogonoporus balaenopterae所屬分支相隔最遠(yuǎn)。結(jié)論nad1基因有較高保守性,同時(shí)也存在種間差異,可廣泛應(yīng)用于研究細(xì)粒棘球絳蟲的種間和種內(nèi)遺傳變異。
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 試驗(yàn)樣品
1.1.2 菌種、載體及主要試劑
1.2 基因組DNA提取及PCR擴(kuò)增
1.3 擴(kuò)增片段的克隆與測序
1.4 序列分析
2 結(jié) 果
2.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.2 克隆結(jié)果
2.3 測序結(jié)果細(xì)粒棘球蚴nad1序列
2.3.1 西烏旗羊株nad1序列
2.3.2 錫林浩特市人株細(xì)粒棘球蚴nad1序列
2.3.3 序列比對(duì)結(jié)果
2.3.4 基因序列同源性與遺傳距離分析
3 討 論
本文編號(hào):3775684
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1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 試驗(yàn)樣品
1.1.2 菌種、載體及主要試劑
1.2 基因組DNA提取及PCR擴(kuò)增
1.3 擴(kuò)增片段的克隆與測序
1.4 序列分析
2 結(jié) 果
2.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.2 克隆結(jié)果
2.3 測序結(jié)果細(xì)粒棘球蚴nad1序列
2.3.1 西烏旗羊株nad1序列
2.3.2 錫林浩特市人株細(xì)粒棘球蚴nad1序列
2.3.3 序列比對(duì)結(jié)果
2.3.4 基因序列同源性與遺傳距離分析
3 討 論
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