細粒棘球蚴線粒體nad1基因的克隆與序列分析
發(fā)布時間:2023-03-31 19:46
目的為完善細粒棘球蚴(Echinococcus granulasus)的分子分類學體系,提供更優(yōu)化的種間和種內(nèi)遺傳標記基因。方法在內(nèi)蒙古地區(qū)采集患羊肝臟細粒棘球蚴和肝包蟲病患者棘球蚴。采用提取蟲體DNA的方法,擴增線粒體NADH脫氫酶1(nad1)基因并進行測序,運用DNAstar5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹并采用MEGA4.0軟件進行自居檢驗。結(jié)果細粒棘球蚴DNA擴增出的羊株、人株nad1基因序列片段長度為895 bp。羊株、人株細粒棘球蚴nad1序列與加拿大棘球絳蟲的同源性最高,相似性為86.5%;羊株、人株細粒棘球蚴nad1序列與加拿大棘球絳蟲位于同一分支,自展值(Boostrap)最高,為100%。羊株、人株細粒棘球蚴nad1序列所屬分支與裂頭目、裂頭科Diplogonoporus balaenopterae所屬分支相隔最遠。結(jié)論nad1基因有較高保守性,同時也存在種間差異,可廣泛應用于研究細粒棘球絳蟲的種間和種內(nèi)遺傳變異。
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 試驗樣品
1.1.2 菌種、載體及主要試劑
1.2 基因組DNA提取及PCR擴增
1.3 擴增片段的克隆與測序
1.4 序列分析
2 結(jié) 果
2.1 PCR擴增結(jié)果
2.2 克隆結(jié)果
2.3 測序結(jié)果細粒棘球蚴nad1序列
2.3.1 西烏旗羊株nad1序列
2.3.2 錫林浩特市人株細粒棘球蚴nad1序列
2.3.3 序列比對結(jié)果
2.3.4 基因序列同源性與遺傳距離分析
3 討 論
本文編號:3775684
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1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 試驗樣品
1.1.2 菌種、載體及主要試劑
1.2 基因組DNA提取及PCR擴增
1.3 擴增片段的克隆與測序
1.4 序列分析
2 結(jié) 果
2.1 PCR擴增結(jié)果
2.2 克隆結(jié)果
2.3 測序結(jié)果細粒棘球蚴nad1序列
2.3.1 西烏旗羊株nad1序列
2.3.2 錫林浩特市人株細粒棘球蚴nad1序列
2.3.3 序列比對結(jié)果
2.3.4 基因序列同源性與遺傳距離分析
3 討 論
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