目的:信號通路上調控miRNA成熟的相關基因的SNPs可能通過影響基因的轉錄能力及蛋白質功能,干擾miRNA的成熟,調整miRNA的沉默作用,從而表現(xiàn)為疾病易感性的改變,即miRNA成熟通路上的SNPs與疾病相關�；谠摾碚摷靶陆S吾爾族肺結核的高發(fā),本課題利用全外顯子測序篩選新疆維吾爾族肺結核患者miRNA成熟通路上的易感基因,研究其基因多態(tài)性以及相應靶基因表達水平與維吾爾族肺結核的相關性,從而進一步推斷miRNA對該疾病的致病性作用。方法:1)收集和田地區(qū)維吾爾族肺結核患者3例及對照組3例全血標本,利用二代測序技術進行全基因組外顯子測序,初步篩選候選基因。查閱結核病發(fā)病機制的相關文獻及利用生物信息學方法,從獲得的突變基因上挑選信號通路上調控miRNA成熟的相關基因,最終確定候選基因;2)利用the International HapMap Project數(shù)據(jù)庫（http://www.hapmap.org）、dbSNP數(shù)據(jù)庫（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/）和miRBase registry數(shù)據(jù)庫（http://microrna.s... 

【文章頁數(shù)】：128 頁

【學位級別】：博士

【文章目錄】：
中英文縮略詞對照表
中文摘要
ABSTRACT
前言
第一部分 基于全外顯子測序篩選新疆維吾爾族肺結核患者信號通路上與MIRNA成熟相關的易感基因
    1 研究內容與方法
        1.1 研究對象
        1.2 標本采集
        1.3 實驗主要試劑
        1.4 實驗主要儀器
        1.5 實驗原理
        1.6 實驗步驟
        1.7 數(shù)據(jù)分析
        1.8 數(shù)據(jù)的質量控制
        1.9 技術路線圖
    2 結果
    3 討論
    4 小結
第二部分 候選基因中的SNPS與新疆維吾爾族肺結核的易感性研究
    1 研究內容與方法
        1.1 研究對象
        1.2 標本采集
        1.3 主要試劑
        1.4 實驗器材
        1.5 實驗原理
        1.6 實驗步驟
        1.7 統(tǒng)計學分析
        1.8 技術路線
    2 結果
    3 討論
    4 小結
第三部分 基于EQTL分析進行SNPS陽性位點所在基因的表達與新疆維吾爾族肺結核的相關性研究
    1 研究內容與方法
        1.1 研究對象
        1.2 倫理審查
        1.3 血液樣本收集
        1.4 ELISA實驗
        1.5 qPCR檢測
        1.6 技術路線
    2 結果
    3 討論
    4 小結
結論
致謝
參考文獻
綜述
    參考文獻
攻讀博士學位期間獲得的學術成果
個人簡歷


【參考文獻】：
期刊論文
[1]結核病及其易感基因的最近研究進展[J]. 杜敏,李釗偉,唐保明,李澤清.  中西醫(yī)結合心血管病電子雜志. 2016(35)
[2]SLC11A1基因多態(tài)性與新疆喀什地區(qū)維吾爾族人群肺結核易感性的相關性研究[J]. 于潞,楊敏,吳江東,張萍,孟祥慧,張少杰,吳長新,陳創(chuàng)夫,曹旭東.  石河子大學學報(自然科學版). 2016(01)
[3]NRAMP1基因D543N多態(tài)現(xiàn)象與世居藏族結核病易感性的研究[J]. 央拉,次仁卓瑪,鐘鏵,李長山,杜寶中.  西藏科技. 2015(04)
[4]目標序列捕獲及平行測序在臨床耳聾基因診斷中的應用[J]. 蘇鈺,湯文學,代志瑤,高雪,王國建,黃莎莎,康東洋,林曦,戴樸.  中華耳科學雜志. 2014(01)
[5]動物microRNA-181的功能與應用前景[J]. 常楊,穆偉濤,滿朝來.  遺傳. 2014(02)
[6]新疆維吾爾自治區(qū)2010—2011年結核病流行病學抽樣調查結果分析[J]. 楊津明,杰恩斯·斯馬胡勒,邰新蓉,李月華,趙珍.  中國防癆雜志. 2013(12)
[7]2010年全國第五次結核病流行病學抽樣調查報告[J]. 王黎霞,成詩明,陳明亭,趙雁林,張慧,姜世聞,何廣學,呂青,杜昕,陳偉,劉小秋,阮云洲,王勝芬,夏愔愔,于蘭,李峻,李雪.  中國防癆雜志. 2012(08)
[8]MBL基因多態(tài)性與新疆漢族人群結核病易感性的研究[J]. 李宇,吳芳,章樂,張萬江.  中國人獸共患病學報. 2011(09)
[9]中國2004—2008年結核病死亡率特征分析及趨勢[J]. 胡嘉,王黎霞,陳偉,黃飛,張慧,成詩明,周脈耕,王黎君.  中國防癆雜志. 2011(04)
[10]NRAMP1基因3′UTR多態(tài)現(xiàn)象與漢族結核病易感性的研究[J]. 段鴻飛,周新華,馬玙,李傳友,陳效友,高微微,鄭素華.  中華結核和呼吸雜志. 2003(05)

博士論文
[1]MicroRNA相關單核苷酸多態(tài)性與原發(fā)性肝癌遺傳易感性研究[D]. 李玉春.鄭州大學 2012



本文編號：3662032