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調(diào)控miRNA成熟的相關(guān)基因SNPs與肺結(jié)核易感性的相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2022-07-15 12:17
  目的:信號(hào)通路上調(diào)控miRNA成熟的相關(guān)基因的SNPs可能通過影響基因的轉(zhuǎn)錄能力及蛋白質(zhì)功能,干擾miRNA的成熟,調(diào)整miRNA的沉默作用,從而表現(xiàn)為疾病易感性的改變,即miRNA成熟通路上的SNPs與疾病相關(guān)。基于該理論及新疆維吾爾族肺結(jié)核的高發(fā),本課題利用全外顯子測(cè)序篩選新疆維吾爾族肺結(jié)核患者miRNA成熟通路上的易感基因,研究其基因多態(tài)性以及相應(yīng)靶基因表達(dá)水平與維吾爾族肺結(jié)核的相關(guān)性,從而進(jìn)一步推斷miRNA對(duì)該疾病的致病性作用。方法:1)收集和田地區(qū)維吾爾族肺結(jié)核患者3例及對(duì)照組3例全血標(biāo)本,利用二代測(cè)序技術(shù)進(jìn)行全基因組外顯子測(cè)序,初步篩選候選基因。查閱結(jié)核病發(fā)病機(jī)制的相關(guān)文獻(xiàn)及利用生物信息學(xué)方法,從獲得的突變基因上挑選信號(hào)通路上調(diào)控miRNA成熟的相關(guān)基因,最終確定候選基因;2)利用the International HapMap Project數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.hapmap.org)、dbSNP數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/)和miRBase registry數(shù)據(jù)庫(kù)(http://microrna.s... 

【文章頁(yè)數(shù)】:128 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【文章目錄】:
中英文縮略詞對(duì)照表
中文摘要
ABSTRACT
前言
第一部分 基于全外顯子測(cè)序篩選新疆維吾爾族肺結(jié)核患者信號(hào)通路上與MIRNA成熟相關(guān)的易感基因
    1 研究?jī)?nèi)容與方法
        1.1 研究對(duì)象
        1.2 標(biāo)本采集
        1.3 實(shí)驗(yàn)主要試劑
        1.4 實(shí)驗(yàn)主要儀器
        1.5 實(shí)驗(yàn)原理
        1.6 實(shí)驗(yàn)步驟
        1.7 數(shù)據(jù)分析
        1.8 數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制
        1.9 技術(shù)路線圖
    2 結(jié)果
    3 討論
    4 小結(jié)
第二部分 候選基因中的SNPS與新疆維吾爾族肺結(jié)核的易感性研究
    1 研究?jī)?nèi)容與方法
        1.1 研究對(duì)象
        1.2 標(biāo)本采集
        1.3 主要試劑
        1.4 實(shí)驗(yàn)器材
        1.5 實(shí)驗(yàn)原理
        1.6 實(shí)驗(yàn)步驟
        1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
        1.8 技術(shù)路線
    2 結(jié)果
    3 討論
    4 小結(jié)
第三部分 基于EQTL分析進(jìn)行SNPS陽(yáng)性位點(diǎn)所在基因的表達(dá)與新疆維吾爾族肺結(jié)核的相關(guān)性研究
    1 研究?jī)?nèi)容與方法
        1.1 研究對(duì)象
        1.2 倫理審查
        1.3 血液樣本收集
        1.4 ELISA實(shí)驗(yàn)
        1.5 qPCR檢測(cè)
        1.6 技術(shù)路線
    2 結(jié)果
    3 討論
    4 小結(jié)
結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
攻讀博士學(xué)位期間獲得的學(xué)術(shù)成果
個(gè)人簡(jiǎn)歷


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[9]中國(guó)2004—2008年結(jié)核病死亡率特征分析及趨勢(shì)[J]. 胡嘉,王黎霞,陳偉,黃飛,張慧,成詩(shī)明,周脈耕,王黎君.  中國(guó)防癆雜志. 2011(04)
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博士論文
[1]MicroRNA相關(guān)單核苷酸多態(tài)性與原發(fā)性肝癌遺傳易感性研究[D]. 李玉春.鄭州大學(xué) 2012



本文編號(hào):3662032

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