目的應(yīng)用生物信息學(xué)方法分析mi RNAs在慢性乙型肝炎（CHB）肝組織中的表達(dá)變化及生物學(xué)功能。方法在GEO數(shù)據(jù)庫中獲取GSE110217芯片數(shù)據(jù),使用R語言篩選差異表達(dá)的mi RNAs;使用mi RDB、mi RTar Base、Target Scan數(shù)據(jù)庫預(yù)測(cè)其靶基因,進(jìn)一步采用DAVID軟件對(duì)目的基因進(jìn)行生物學(xué)功能（GO）分析,利用京都基因與基因組百科全書（KEGG）數(shù)據(jù)庫對(duì)基因進(jìn)行生物通路富集分析,篩選靶基因所涉及的有意義的生物學(xué)功能和通路靶基因;采用String和Cytoscape軟件進(jìn)行靶基因蛋白相互作用（PPI）網(wǎng)絡(luò)分析,篩選關(guān)鍵靶基因;使用Transmir數(shù)據(jù)庫在線預(yù)測(cè)和富集分析,篩選mi RNAs的轉(zhuǎn)錄因子;以富集在乙型肝炎（hsa05161）通路上的靶基因?yàn)榛A(chǔ),構(gòu)建轉(zhuǎn)錄因子-mi RNAs-靶基因調(diào)控關(guān)系網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果在CHB肝組織中共篩出33個(gè)差異性表達(dá)的mi RNAs,其中10個(gè)上調(diào)、23個(gè)下調(diào)。這些mi RNAs的靶基因主要參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控、細(xì)胞分裂、凋亡過程負(fù)調(diào)控及細(xì)胞黏附等生物過程,涉及通路主要有乙型肝炎通路及PI3K/AKT、Fox O、Hippo信號(hào)通路等。... 

【文章來源】：山東醫(yī)藥. 2020,60(26)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

基于慢性乙型肝炎通路的轉(zhuǎn)錄因子-mi RNAs-靶基因的調(diào)控關(guān)系網(wǎng)絡(luò)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]The role of micro RNAs in hepatocyte metabolism and hepatitis B virus replication[J]. Wanyu Deng,Mengji Lu.  Virologica Sinica. 2016(06)
[2]microRNA與乙型肝炎病情轉(zhuǎn)歸的關(guān)系[J]. 張秀華,吳園園.  分子診斷與治療雜志. 2015(06)
[3]Host cellular micro RNA involvement in the control of hepatitis B virus gene expression and replication[J]. Yoshiaki Mizuguchi,Toshihiro Takizawa,Eiji Uchida.  World Journal of Hepatology. 2015(04)



本文編號(hào)：3581402