高通量二代測序技術(shù)在耐藥結(jié)核病診斷中的應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2022-01-06 14:10
目的探索新一代高通量二代測序(next-generation sequencing,NGS)技術(shù)在耐藥結(jié)核病診斷中的應(yīng)用價(jià)值。方法搜集2016—2017年甘肅省結(jié)核病耐藥基線調(diào)查150株臨床分離株,排除非結(jié)核分枝桿菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)菌株2株,進(jìn)行比例法藥物敏感性試驗(yàn)(簡稱"藥敏試驗(yàn)")及結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因(包括katG、inhA、embB、rpoB、rpsL、rrs、gyrA和gyrB)的NGS技術(shù)檢測,剔除測序失敗的13株,最后納入分析菌株135株。以比例法藥敏試驗(yàn)結(jié)果為參考標(biāo)準(zhǔn)評(píng)價(jià)二代測序在耐藥結(jié)核病中的檢測效能。結(jié)果以藥敏試驗(yàn)結(jié)果為參考標(biāo)準(zhǔn),NGS技術(shù)檢測異煙肼、乙胺丁醇、利福平、鏈霉素、氧氟沙星耐藥的敏感度分別為:88.75%(71/80)、85.71%(18/21)、84.72%(61/72)、73.91%(51/69)、68.97%(20/29),特異度分別為100.00%(55/55)、86.84%(99/114)、96.83%(61/63)、96.97%(64/66)、99.06%(105/106),Kappa值...
【文章來源】:中國防癆雜志. 2020,42(11)CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
材料和方法
一、材料收集
二、研究方法
1.藥敏試驗(yàn):
2. DNA提。
3. NGS技術(shù)檢測:
4.結(jié)果分析:
三、統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
結(jié)果
一、NGS對(duì)5種藥物耐藥性檢測的效能
二、結(jié)核分枝桿菌對(duì)5種藥物耐藥的相關(guān)基因突變類型及頻率分析(表3)
1.異煙肼:
2.乙胺丁醇:
3.利福平:
4.鏈霉素:
5.氧氟沙星:
討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新一代微測序基因芯片的設(shè)計(jì)及其耐藥性檢測效果的初步研究[J]. 孫照剛,張洪靜,李自慧,孫琦,呂琳娜,潘麗萍,Sandy Gilbert,張宗德,許紹發(fā),James Xia. 中國防癆雜志. 2019 (06)
[2]結(jié)核分枝桿菌耐藥性檢測專家共識(shí)[J]. Editorial Board of Chinese Journal of Antituberculosis;Basic and Clinical Groups of Tuberculosis Control Branch of China International Exchange and Promotive Association for Medical and Health Care;. 中國防癆雜志. 2019 (02)
[3]結(jié)核分枝桿菌耐藥性檢測方法的研究進(jìn)展[J]. 張俊仙,吳雪瓊. 中國防癆雜志. 2019 (02)
[4]二代測序技術(shù)對(duì)活動(dòng)性結(jié)核病患者的診斷價(jià)值[J]. 周晛,艾靜文,崔鵬,阮巧玲,沈瑤杰,王森,李永軍,張文宏. 中國防癆雜志. 2018 (02)
[5]貴陽市結(jié)核分枝桿菌鏈霉素和乙胺丁醇耐藥相關(guān)基因突變的檢測與分析[J]. 孫榮,歐維正,王燕,蒙俊,秦萬,畢雅坤,陳崢宏. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2016(08)
[6]耐多藥結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因突變特征分析[J]. 陳燕,趙麗麗,孫慶,趙秀芹,吳移謀,萬康林. 疾病監(jiān)測. 2014(04)
[7]結(jié)核分枝桿菌耐藥機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 閆雪梅,張朝霞. 新疆醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(02)
[8]應(yīng)用基因芯片技術(shù)檢測結(jié)核分枝桿菌鏈霉素耐藥性的研究[J]. 張俊仙,吳雪瓊,邢婉麗,梁艷,陽幼榮. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2009(11)
本文編號(hào):3572600
【文章來源】:中國防癆雜志. 2020,42(11)CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
材料和方法
一、材料收集
二、研究方法
1.藥敏試驗(yàn):
2. DNA提。
3. NGS技術(shù)檢測:
4.結(jié)果分析:
三、統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
結(jié)果
一、NGS對(duì)5種藥物耐藥性檢測的效能
二、結(jié)核分枝桿菌對(duì)5種藥物耐藥的相關(guān)基因突變類型及頻率分析(表3)
1.異煙肼:
2.乙胺丁醇:
3.利福平:
4.鏈霉素:
5.氧氟沙星:
討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新一代微測序基因芯片的設(shè)計(jì)及其耐藥性檢測效果的初步研究[J]. 孫照剛,張洪靜,李自慧,孫琦,呂琳娜,潘麗萍,Sandy Gilbert,張宗德,許紹發(fā),James Xia. 中國防癆雜志. 2019 (06)
[2]結(jié)核分枝桿菌耐藥性檢測專家共識(shí)[J]. Editorial Board of Chinese Journal of Antituberculosis;Basic and Clinical Groups of Tuberculosis Control Branch of China International Exchange and Promotive Association for Medical and Health Care;. 中國防癆雜志. 2019 (02)
[3]結(jié)核分枝桿菌耐藥性檢測方法的研究進(jìn)展[J]. 張俊仙,吳雪瓊. 中國防癆雜志. 2019 (02)
[4]二代測序技術(shù)對(duì)活動(dòng)性結(jié)核病患者的診斷價(jià)值[J]. 周晛,艾靜文,崔鵬,阮巧玲,沈瑤杰,王森,李永軍,張文宏. 中國防癆雜志. 2018 (02)
[5]貴陽市結(jié)核分枝桿菌鏈霉素和乙胺丁醇耐藥相關(guān)基因突變的檢測與分析[J]. 孫榮,歐維正,王燕,蒙俊,秦萬,畢雅坤,陳崢宏. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2016(08)
[6]耐多藥結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因突變特征分析[J]. 陳燕,趙麗麗,孫慶,趙秀芹,吳移謀,萬康林. 疾病監(jiān)測. 2014(04)
[7]結(jié)核分枝桿菌耐藥機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 閆雪梅,張朝霞. 新疆醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(02)
[8]應(yīng)用基因芯片技術(shù)檢測結(jié)核分枝桿菌鏈霉素耐藥性的研究[J]. 張俊仙,吳雪瓊,邢婉麗,梁艷,陽幼榮. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2009(11)
本文編號(hào):3572600
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