[目的]利用MLVA和DFR基因分型技術(shù)對云南省分離的鼠疫菌株進行基因分型，探究云南各型鼠疫菌菌株之間的內(nèi)在聯(lián)系、遺傳特征、流行特征及疫源地之間的聯(lián)系，為云南省鼠疫的防控工作提供依據(jù)。[材料與方法]MLVA分型：1.菌株選擇選擇分離自不同地點、不同年代、不同來源的云南鼠疫菌株158株，其中家鼠鼠疫菌株135株、野鼠鼠疫菌株16株、麗江玉龍菌株7株，另外還有1株EV菌。2. VNTR位點選擇VNTR位點是根據(jù)已公布的13株鼠疫菌全基因比對，篩選了14個VNTR位點，其中12個位點是全新的位點，另兩個是已公布使用過的位點。3. DNA的提取利用QIAGEN細(xì)菌DNA提取試劑盒進行提取制備。4. PCR擴增和毛細(xì)管電泳采用25l的多重PCR反應(yīng)體系進行擴增，將產(chǎn)物進行毛細(xì)管電泳分析，通過PCR產(chǎn)物大小計算出重復(fù)數(shù)，最后結(jié)果以Excel形式保存。5.結(jié)果分析通過BioNumerics軟件進行數(shù)據(jù)處理，得到各位點的分辨指數(shù)，繪制聚類圖和最小生成樹。DFR分型：1.菌株選擇選擇分離自不同地點、不同年代、不同來源的云南鼠疫菌株171株，其中家鼠鼠疫菌株148株、野鼠鼠疫菌株16株、麗江玉龍菌株7株。... 

【文章來源】：大理大學(xué)云南省

【文章頁數(shù)】：41 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
縮略語表
摘要
Abstract
前言
    1、中國鼠疫流行概述
    2、云南鼠疫流行概述
    3、鼠疫菌分型及基因組多態(tài)性研究進展
    4、本研究內(nèi)容和意義
基于串聯(lián)重復(fù)序列的云南省鼠疫菌基因多態(tài)性研究
    1、導(dǎo)論
    2、材料與方法
    3、結(jié)果
    4、討論
基于差異片段云南省鼠疫菌基因組多態(tài)性研究
    1、導(dǎo)論
    2、材料與方法
    3、結(jié)果
    4、討論
總結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[10]串聯(lián)重復(fù)序列及其在鼠疫菌基因分型中的應(yīng)用[J]. 付秀萍,俞東征,海榮.  中華流行病學(xué)雜志. 2004(03)

博士論文
[1]鼠疫耶爾森氏菌基因組多態(tài)性研究及快速鑒定溯源系統(tǒng)的建立[D]. 李艷君.中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2009

碩士論文
[1]中國鼠疫耶爾森菌多位點可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列分析[D]. 張曉媛.中國疾病預(yù)防控制中心 2008



本文編號：3557043