結(jié)核性胸膜炎患者胸膜組織中環(huán)狀RNA表達(dá)譜初步分析
發(fā)布時間:2021-12-24 05:45
目的分析結(jié)核性胸膜炎患者胸膜組織中環(huán)狀RNA(circRNA)的表達(dá)譜,并預(yù)測其靶基因,初步探討circRNA與結(jié)核性胸膜炎的關(guān)系。方法本研究納入了結(jié)核性胸膜炎患者和對照組各13例,所有患者均通過胸腔鏡進(jìn)行胸膜活檢。應(yīng)用高通量測序技術(shù)對結(jié)核性胸膜炎組織與正常胸膜組織各3例進(jìn)行circRNA檢測,用edgeR對基因進(jìn)行了差異表達(dá)分析,剩余標(biāo)本進(jìn)行實(shí)時熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)驗(yàn)證,用miRanda軟件預(yù)測差異表達(dá)circRNA相關(guān)的微小RNA(miRNA)。結(jié)果高通量測序結(jié)果顯示,結(jié)核性胸膜炎組織中存在差異表達(dá)的circRNA有134個,其中53個表達(dá)上調(diào),81個表達(dá)下調(diào)。挑選6個有顯著差異的circRNA進(jìn)行qRT-PCR驗(yàn)證,結(jié)果顯示hsacirc0008433在結(jié)核性胸膜炎組織中的表達(dá)上調(diào)(P<0.05),hsacirc0008234、hsacirc0001368在結(jié)核性胸膜炎組織中的表達(dá)下調(diào)(P<0.05),結(jié)果與高通量測序結(jié)...
【文章來源】:國際呼吸雜志. 2020,40(15)
【文章頁數(shù)】:6 頁
本文編號:3549927
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