中國西部地區(qū)1b型慢性丙型肝炎患者直接抗病毒藥物(DAAs)預存耐藥相關替代的流行情況分析
發(fā)布時間:2021-10-21 16:42
背景:直接抗病毒藥物(DAAs)作用于丙型肝炎病毒(HCV)的療效是很好的。然而,針對DAAs的RASs的出現(xiàn)會影響其抗病毒治療的有效性,尤其是基線RASs的存在。此外,中國西部地區(qū)1b型慢性丙型肝炎患者DAAs預存RASs的流行情況仍不清楚。材料與方法:本研究納入70例中國西部地區(qū)基因1b型慢性丙型肝炎初治患者進行分析,PCR分別擴增HCV NS3、NS5A和NS5B基因,并直接測序。序列通過MEGA5.0軟件進行比對分析,各區(qū)RASs的進化模式和氨基酸共變模型分別通過MEGA v5.05軟件和Cytoscape v3.2.1軟件構建。結果:HCV NS3區(qū)總的RASs流行率是很高的(85.48%;53/62),RASs主要包括C16S,T54S,Q80R/L,A87T,R117H,S122G,V132I,V170I;其次是NS5A區(qū)42.42%(28/66),RASs主要存在于L28M,R30Q,Q54H,P58S/T,Q62H/R,Y93H位點;值得注意的是,在HCV NS5B區(qū),我們發(fā)現(xiàn)100%(44/44)的患者均出現(xiàn)了至少一個RASs,這些突變位點主要包括N142S,A30...
【文章來源】:重慶醫(yī)科大學重慶市
【文章頁數(shù)】:49 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
Sanger測序典型的峰圖
圖 2. 不同作用區(qū)段 DAAs 臨床耐藥相關替代(RASs)的流行情況。Figure 2. The prevalence of clinically relevant resistance associated substitutions (RASs) invarious regions and DAA classes. Frequency of clinically relevant RASs for NS3 regions (A),NS5A region (B) and NS5B region(C). And total frequency of clinically relevant RASs fordifferent DAA classes (D).另外,62 例患者中有 25 例(40.32%)攜帶多種 NS3 RASs。具體來說,18例(29.03%)患者攜帶兩種不同的 RASs,如 V170I+S122G 和 T54S+S122G;5例(8.06%)患者攜帶三種不同的 RASs,如 Q80R + T54S + S122G 和 Q80R +S122G + V170I。重要的是,還在兩名患者中分別檢測到四種不同的 RAS 如:Q80R + T54S + V170I + S122G 和 C16S + R117H + V170I + S122G。3.3 NS5A 蛋白抑制劑的 RASs 的流行情況
重慶醫(yī)科大學碩士研究生學位論文區(qū)段聯(lián)合 RAS 頻率最高的是 NS3 + NS5B 區(qū)域,其次是 NS5A + NS5NS5B 和 NS3 + NS5A + NS5B 區(qū)域。因為在所有 NS5B 序列中均觀察到替代,這可能導致包含 NS5B 區(qū)的聯(lián)合突變流行率較高。因此,我們16N 后再次分析了各個區(qū)段聯(lián)合突變的結果,觀察到類似但較低的流行結果展示在圖 3 中。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Global epidemiology of hepatitis C virus infection: an up-date of the distribution and circulation of hepatitis C virus genotypes[J]. Arnolfo Petruzziello,Samantha Marigliano,Giovanna Loquercio,Anna Cozzolino,Carmela Cacciapuoti. World Journal of Gastroenterology. 2016(34)
[2]Treatment of chronic hepatitis C with direct-acting antivirals: The role of resistance[J]. Miguel Jiménez-Pérez,Rocío González-Grande,Pilar Espa?a Contreras,Isabel Pinazo Martínez,Jesús de la Cruz Lombardo,Raúl Olmedo Martín. World Journal of Gastroenterology. 2016(29)
[3]值得臨床關注的新挑戰(zhàn):丙型肝炎病毒對直接抗病毒藥物的耐藥[J]. 陳志偉,胡鵬,任紅. 中華肝臟病雜志. 2016 (03)
[4]Hepatitis C virus NS5A inhibitors and drug resistance mutations[J]. Shingo Nakamoto,Tatsuo Kanda,Shuang Wu,Hiroshi Shirasawa,Osamu Yokosuka. World Journal of Gastroenterology. 2014(11)
[5]Chronic hepatitis C:Treat or wait? Medical decision making in clinical practice[J]. Claus Niederau,Dietrich Hüppe,Elmar Zehnter,Bernd Mller,Renate Heyne,Stefan Christensen,Rainer Pfaff,Arno Theilmeier,Ulrich Alshuth,Stefan Mauss. World Journal of Gastroenterology. 2012(12)
本文編號:3449359
【文章來源】:重慶醫(yī)科大學重慶市
【文章頁數(shù)】:49 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
Sanger測序典型的峰圖
圖 2. 不同作用區(qū)段 DAAs 臨床耐藥相關替代(RASs)的流行情況。Figure 2. The prevalence of clinically relevant resistance associated substitutions (RASs) invarious regions and DAA classes. Frequency of clinically relevant RASs for NS3 regions (A),NS5A region (B) and NS5B region(C). And total frequency of clinically relevant RASs fordifferent DAA classes (D).另外,62 例患者中有 25 例(40.32%)攜帶多種 NS3 RASs。具體來說,18例(29.03%)患者攜帶兩種不同的 RASs,如 V170I+S122G 和 T54S+S122G;5例(8.06%)患者攜帶三種不同的 RASs,如 Q80R + T54S + S122G 和 Q80R +S122G + V170I。重要的是,還在兩名患者中分別檢測到四種不同的 RAS 如:Q80R + T54S + V170I + S122G 和 C16S + R117H + V170I + S122G。3.3 NS5A 蛋白抑制劑的 RASs 的流行情況
重慶醫(yī)科大學碩士研究生學位論文區(qū)段聯(lián)合 RAS 頻率最高的是 NS3 + NS5B 區(qū)域,其次是 NS5A + NS5NS5B 和 NS3 + NS5A + NS5B 區(qū)域。因為在所有 NS5B 序列中均觀察到替代,這可能導致包含 NS5B 區(qū)的聯(lián)合突變流行率較高。因此,我們16N 后再次分析了各個區(qū)段聯(lián)合突變的結果,觀察到類似但較低的流行結果展示在圖 3 中。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Global epidemiology of hepatitis C virus infection: an up-date of the distribution and circulation of hepatitis C virus genotypes[J]. Arnolfo Petruzziello,Samantha Marigliano,Giovanna Loquercio,Anna Cozzolino,Carmela Cacciapuoti. World Journal of Gastroenterology. 2016(34)
[2]Treatment of chronic hepatitis C with direct-acting antivirals: The role of resistance[J]. Miguel Jiménez-Pérez,Rocío González-Grande,Pilar Espa?a Contreras,Isabel Pinazo Martínez,Jesús de la Cruz Lombardo,Raúl Olmedo Martín. World Journal of Gastroenterology. 2016(29)
[3]值得臨床關注的新挑戰(zhàn):丙型肝炎病毒對直接抗病毒藥物的耐藥[J]. 陳志偉,胡鵬,任紅. 中華肝臟病雜志. 2016 (03)
[4]Hepatitis C virus NS5A inhibitors and drug resistance mutations[J]. Shingo Nakamoto,Tatsuo Kanda,Shuang Wu,Hiroshi Shirasawa,Osamu Yokosuka. World Journal of Gastroenterology. 2014(11)
[5]Chronic hepatitis C:Treat or wait? Medical decision making in clinical practice[J]. Claus Niederau,Dietrich Hüppe,Elmar Zehnter,Bernd Mller,Renate Heyne,Stefan Christensen,Rainer Pfaff,Arno Theilmeier,Ulrich Alshuth,Stefan Mauss. World Journal of Gastroenterology. 2012(12)
本文編號:3449359
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