冠狀病毒感染相關心肌損傷機制的組學分析及治療藥物的預測
發(fā)布時間:2021-10-18 12:15
目的研究冠狀病毒感染相關心肌損傷機制并預測可能有效的治療藥物。方法在基因表達數(shù)據庫檢索并篩選得到GSE59185數(shù)據集,根據不同的亞型分為wt組、ΔE組、Δ3組、Δ5組和對照組。用R語言Limma程序包對各組進行差異表達基因分析,將各組上調、下調表達基因分別取交集,作為共同差異表達基因,在DAVID數(shù)據庫進行基因本體學(GO)和京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路富集分析。采用自主研發(fā)的表觀精準治療預測平臺(EpiMed)進行治療藥物預測。用STRING數(shù)據庫對共同差異表達基因構建蛋白質互作網絡并篩選核心基因。結果各組差異表達基因分析,共交集上調基因191個,下調基因18個,共同差異表達基因共209個。GO富集分析發(fā)現(xiàn),共同差異基因主要富集在病毒反應、病毒防御反應、Ⅰ型干擾素反應、γ干擾素調節(jié)、γ干擾素介導的信號通路、先天免疫反應調節(jié)等;KEGG通路富集主要與細胞因子與受體相互作用、病毒蛋白與細胞因子和細胞因子受體相互作用、TNF、Toll樣受體、缺氧誘導因子1及白細胞介素17信號通路等有關。通過EpiMed預測的藥物主要為白藜蘆醇、利托那韋、維甲酸、連翹、魚腥草等。網絡分析篩選得...
【文章來源】:中華老年心腦血管病雜志. 2020,22(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
PPI網絡
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[2]連翹的化學成分及抗炎活性研究[J]. 夏麗,韓竹箴,田童,周越,谷麗華. 上海中醫(yī)藥雜志. 2019(04)
[3]全反式維甲酸抗支氣管哮喘大鼠氣道炎癥的作用及機制[J]. 金紅芳,方紅,王宏偉. 中華結核和呼吸雜志. 2004(04)
[4]SARS冠狀病毒對心臟及其傳導系統(tǒng)影響的病理學研究[J]. 周光德,趙景民,王松山,孫艷玲,潘登,楊建法,李文淑,于海麗,張?zhí)┖? 解放軍醫(yī)學雜志. 2004(01)
[5]生物信息學方法優(yōu)化依硫磷酸聯(lián)合方案治療骨髓增生異常綜合征的應用研究[J]. 盧學春,楊波,朱宏麗,范輝,李素霞,劉洋,姚善謙. 中華醫(yī)學雜志. 2009 (26)
本文編號:3442781
【文章來源】:中華老年心腦血管病雜志. 2020,22(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
PPI網絡
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[2]連翹的化學成分及抗炎活性研究[J]. 夏麗,韓竹箴,田童,周越,谷麗華. 上海中醫(yī)藥雜志. 2019(04)
[3]全反式維甲酸抗支氣管哮喘大鼠氣道炎癥的作用及機制[J]. 金紅芳,方紅,王宏偉. 中華結核和呼吸雜志. 2004(04)
[4]SARS冠狀病毒對心臟及其傳導系統(tǒng)影響的病理學研究[J]. 周光德,趙景民,王松山,孫艷玲,潘登,楊建法,李文淑,于海麗,張?zhí)┖? 解放軍醫(yī)學雜志. 2004(01)
[5]生物信息學方法優(yōu)化依硫磷酸聯(lián)合方案治療骨髓增生異常綜合征的應用研究[J]. 盧學春,楊波,朱宏麗,范輝,李素霞,劉洋,姚善謙. 中華醫(yī)學雜志. 2009 (26)
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